• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

盘基网柄菌线粒体大亚基核糖体RNA编码基因中的I组内含子:在藻类中的相同位点定位及体外自我剪接

A group-I intron in the mitochondrial large-subunit ribosomal RNA-encoding gene of Dictyostelium discoideum: same site localization in alga and in vitro self-splicing.

作者信息

Angata K, Ogawa S, Yanagisawa K, Tanaka Y

机构信息

Institute of Biological Sciences, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan.

出版信息

Gene. 1995 Feb 3;153(1):49-55. doi: 10.1016/0378-1119(94)00732-8.

DOI:10.1016/0378-1119(94)00732-8
PMID:7883184
Abstract

A 547-bp group-I intron belonging to subgroup IA1 was found near the 3' end of the large subunit ribosomal RNA-encoding gene (LSUrRNA) in the mitochondrial (mt) DNA of the cellular slime mold Dictyostelium discoideum. This intron was inserted in a highly conserved stretch within the sequence that encodes the peptidyl transferase center domain V in the corresponding region of the Escherichia coli LSUrRNA. Interestingly, the insertion site of the intron is the same as that of the So.LSU.2 intron of the green alga, Scenedesmus obliquus, mt DNA and the Pw.LSU.2 intron of the colorless alga, Prototheca wickerhamii, mt DNA. The intron could self-splice in vitro at a concentration higher than 20 mM MgCl2. Polymerase chain reaction analysis showed the possible existence of an intron similar to that of D. discoideum LSUrRNA in another cellular slime mold, Polysphondylium pallidum (CK-8), but not in D. mucoroides (Dm7 and Dm11).

摘要

在细胞黏菌盘基网柄菌的线粒体(mt)DNA中,在编码大亚基核糖体RNA的基因(LSUrRNA)的3'端附近发现了一个属于IA1亚组的547个碱基对的I类内含子。该内含子插入到大肠杆菌LSUrRNA相应区域中编码肽基转移酶中心结构域V的序列内的一个高度保守区域。有趣的是,该内含子的插入位点与绿藻斜生栅藻mt DNA的So.LSU.2内含子和无色藻威克汉姆原甲藻mt DNA的Pw.LSU.2内含子的插入位点相同。该内含子在体外MgCl2浓度高于20 mM时可自我剪接。聚合酶链反应分析表明,在另一种细胞黏菌苍白聚孢霉(CK - 8)中可能存在与盘基网柄菌LSUrRNA的内含子相似的内含子,但在毛霉状网柄菌(Dm7和Dm11)中不存在。

相似文献

1
A group-I intron in the mitochondrial large-subunit ribosomal RNA-encoding gene of Dictyostelium discoideum: same site localization in alga and in vitro self-splicing.盘基网柄菌线粒体大亚基核糖体RNA编码基因中的I组内含子:在藻类中的相同位点定位及体外自我剪接
Gene. 1995 Feb 3;153(1):49-55. doi: 10.1016/0378-1119(94)00732-8.
2
A self-splicing group II intron in the mitochondrial large subunit rRNA (LSUrRNA) gene of the eukaryotic alga Scenedesmus obliquus.真核藻类斜生栅藻线粒体大亚基核糖体RNA(LSUrRNA)基因中的一个自我剪接II组内含子。
Nucleic Acids Res. 1990 May 11;18(9):2691-7. doi: 10.1093/nar/18.9.2691.
3
Mitochondrial genes in the colourless alga Prototheca wickerhamii resemble plant genes in their exons but fungal genes in their introns.无色藻类威克汉姆原囊藻中的线粒体基因,其外显子类似植物基因,但其内含子类似真菌基因。
Nucleic Acids Res. 1993 Feb 11;21(3):719-26. doi: 10.1093/nar/21.3.719.
4
Characterization of a novel small RNA encoded by Dictyostelium discoideum mitochondrial DNA.盘基网柄菌线粒体DNA编码的一种新型小RNA的特征分析
Mol Gen Genet. 1998 Jan;257(2):124-31. doi: 10.1007/s004380050631.
5
Short repetitive sequences in green algal mitochondrial genomes: potential roles in mitochondrial genome evolution.绿藻线粒体基因组中的短重复序列:在线粒体基因组进化中的潜在作用。
Mol Biol Evol. 1998 Jun;15(6):690-701. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025972.
6
The ribosomal RNA gene region in Acanthamoeba castellanii mitochondrial DNA. A case of evolutionary transfer of introns between mitochondria and plastids?卡氏棘阿米巴线粒体DNA中的核糖体RNA基因区域。线粒体与质体之间内含子发生进化转移的一个实例?
J Mol Biol. 1994 Jun 17;239(4):476-99. doi: 10.1006/jmbi.1994.1390.
7
Transcript mapping and processing of mitochondrial RNA in the chlorophyte alga Prototheca wickerhamii.绿藻威克汉姆原藻中线粒体RNA的转录本定位与加工
Plant Mol Biol. 1996 Feb;30(3):577-95. doi: 10.1007/BF00049333.
8
A site-specific DNA endonuclease specified by one of two ORFs encoded by a group I intron in Dictyostelium discoideum mitochondrial DNA.
Gene. 1997 May 20;191(1):115-21. doi: 10.1016/s0378-1119(97)00050-4.
9
A group-I intron in the mitochondrial small subunit ribosomal RNA gene of Sclerotinia sclerotiorum.核盘菌线粒体小亚基核糖体RNA基因中的一个I组内含子。
Curr Genet. 1995 Jan;27(2):166-76. doi: 10.1007/BF00313431.
10
A ribosomal protein gene cluster is encoded in the mitochondrial DNA of Dictyostelium discoideum: UGA termination codons and similarity of gene order to Acanthamoeba castellanii.一个核糖体蛋白基因簇编码在盘基网柄菌的线粒体DNA中:UGA终止密码子以及与卡氏棘阿米巴基因顺序的相似性。
Curr Genet. 1998 Apr;33(4):304-10. doi: 10.1007/s002940050341.

引用本文的文献

1
Identification of Pentatricopeptide Repeat Proteins in the Model Organism Dictyostelium discoideum.鉴定模型生物盘基网柄菌中的五肽重复蛋白。
Int J Genomics. 2013;2013:586498. doi: 10.1155/2013/586498. Epub 2013 Aug 12.