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使用脉冲场和图像重建进行测序。

Sequencing using pulsed field and image reconstruction.

作者信息

Noolandi J, Forsyth R, Shi A C

机构信息

Xerox Research Centre of Canada, Mississauga, Ontario.

出版信息

Proc Natl Acad Sci U S A. 1993 Nov 1;90(21):10101-4. doi: 10.1073/pnas.90.21.10101.

DOI:10.1073/pnas.90.21.10101
PMID:8234263
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC47721/
Abstract

The use of pulsed fields in a standard manual sequencing set-up results in the separation of > 2 kb on a single gel, as compared to 300-400 bases with a dc field. However, visual reading of the sequence from a film exposed to a pulsed-field gel is not possible for more than 800-900 bases under the best conditions. The use of image reconstruction and enhancement techniques allows the reading of the M13mp18 sequence to > 1 kb, and individual bands can be identified at > 2 kb.

摘要

在标准手动测序设置中使用脉冲场,与直流场在单一凝胶上分离300 - 400个碱基相比,可分离超过2 kb的片段。然而,在最佳条件下,从曝光于脉冲场凝胶的胶片上目视读取超过800 - 900个碱基的序列是不可能的。使用图像重建和增强技术可以读取超过1 kb的M13mp18序列,并且在超过2 kb处可以识别出单个条带。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0437/47721/d5f8a37771b4/pnas01528-0374-a.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0437/47721/7769fe2aac7e/pnas01528-0372-a.jpg
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