Suppr超能文献

促红细胞生成素受体基因的遗传定位

Genetic mapping of the erythropoietin receptor gene.

作者信息

Sistonen P, Träskelin A L, Lehväslaiho H, de la Chapelle A

机构信息

Finnish Red Cross Blood Transfusion Service, Helsinki, Finland.

出版信息

Hum Genet. 1993 Oct 1;92(3):299-301. doi: 10.1007/BF00244476.

Abstract

We describe a novel, highly informative (polymorphism information content, PIC, = 0.86) simple sequence repeat polymorphism at the 5' end of the gene encoding the human erythropoietin receptor (EPOR) previously assigned to 19p13.2 by in situ hybridization. Fourteen different allelic size variants were identified in 12 families of the CEPH (Centre d'Etude du Polymorphisme Humain) family panel of 40 families. In pairwise linkage 16 of the 65 chromosome 19 markers reported to the CEPH database gave a lod score exceeding 3.0 when tested against EPOR. The most likely location of EPOR within a framework of 10 markers including orientation and information on reported physical assignments was pter-[INSR-D19S177-D19S176]-D19S24-LDLR-++ +EPOR-cen-D19S7-D19S49-D19S75-D19S47-AP OC2-qter, placing EPOR as the most proximal of the tested loci on the short arm. On an 11-point map the position and order for all other loci except INSR were supported by the data with odds exceeding 1,000:1. The polymorphism at the 5' end of EPOR should provide a useful landmark marker for future mapping studies of this region.

摘要

我们描述了一种新的、信息丰富的(多态性信息含量,PIC,= 0.86)简单序列重复多态性,该多态性位于人类促红细胞生成素受体(EPOR)编码基因的5'端,此前通过原位杂交将其定位于19p13.2。在CEPH(人类多态性研究中心)40个家庭的12个家庭面板中鉴定出14种不同的等位基因大小变体。在与CEPH数据库报告的65个19号染色体标记进行成对连锁分析时,当与EPOR进行测试时,其中16个标记的lod得分超过3.0。在包括方向和已报道物理定位信息的10个标记框架内,EPOR最可能的位置是pter-[胰岛素受体-D19S177-D19S176]-D19S24-低密度脂蛋白受体-++ +EPOR-着丝粒-D19S7-D19S49-D19S75-D19S47-载脂蛋白OC2-qter,将EPOR置于短臂上测试位点中最靠近端粒的位置。在一个11点的图谱上,除胰岛素受体外所有其他位点的位置和顺序得到了数据支持,优势比超过1000:1。EPOR 5'端的多态性应为该区域未来的图谱研究提供一个有用的界标标记。

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