• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

丙型肝炎病毒2c亚型在意大利高度流行,且在NS5A区域存在异质性。

Subtype 2c of hepatitis C virus is highly prevalent in Italy and is heterogeneous in the NS5A region.

作者信息

Maggi F, Vatteroni M L, Fornai C, Morrica A, Giorgi M, Bendinelli M, Pistello M

机构信息

Virology Section, University of Pisa, Italy.

出版信息

J Clin Microbiol. 1997 Jan;35(1):161-4. doi: 10.1128/jcm.35.1.161-164.1997.

DOI:10.1128/jcm.35.1.161-164.1997
PMID:8968899
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC229530/
Abstract

Hepatitis C virus (HCV) isolates, obtained from 50 Italian patients with community-acquired infection, that had previously been classified as subtype 2a or 2b by current rapid genotyping methods were further characterized by partial sequence analysis. All the isolates were reclassified: 45 within subtype 2c and the other 5 as subtype 1b, 3a, or 4d. Thus, subtype 2c is much more prevalent than previously recognized, with about 30% of all HCV strains detected in Italy being subtype 2c. In contrast, isolates of subtypes 2a and 2b appear to be infrequent, if not absent. Further studies showed that subtype 2c isolates are heterogeneous in the NS5A region, in that they may or may not contain a 57-nucleotide (nt) segment spanning from nt 7533 to nt 7589 of the viral genome. Partial nucleotide sequencing of the NS5B region of four 2c subtypes excluded the possibility that the isolates possessing or not possessing the 57-nt segment in the NS5A region may have resulted from recombination phenomena.

摘要

从50例意大利社区获得性感染患者中分离出的丙型肝炎病毒(HCV)毒株,此前通过当前快速基因分型方法被分类为2a或2b亚型,通过部分序列分析进一步进行特征鉴定。所有分离株均被重新分类:45株属于2c亚型,另外5株分别为1b、3a或4d亚型。因此,2c亚型比之前认识到的更为普遍,在意大利检测到的所有HCV毒株中约30%为2c亚型。相比之下,2a和2b亚型的分离株即便不是完全没有,似乎也很罕见。进一步研究表明,2c亚型分离株在NS5A区域存在异质性,即它们可能含有也可能不含有一段从病毒基因组第7533位核苷酸到第7589位核苷酸的57个核苷酸(nt)片段。对4个2c亚型的NS5B区域进行部分核苷酸测序排除了在NS5A区域拥有或不拥有57-nt片段的分离株可能是重组现象导致的可能性。

相似文献

1
Subtype 2c of hepatitis C virus is highly prevalent in Italy and is heterogeneous in the NS5A region.丙型肝炎病毒2c亚型在意大利高度流行,且在NS5A区域存在异质性。
J Clin Microbiol. 1997 Jan;35(1):161-4. doi: 10.1128/jcm.35.1.161-164.1997.
2
Partial nucleotide sequencing of six subtype 2c hepatitis C viruses detected in Italy.在意大利检测到的6株2c型丙型肝炎病毒的部分核苷酸测序
J Clin Microbiol. 1995 Oct;33(10):2781-4. doi: 10.1128/jcm.33.10.2781-2784.1995.
3
Use of sequence analysis of the NS5B region for routine genotyping of hepatitis C virus with reference to C/E1 and 5' untranslated region sequences.参照C/E1和5'非翻译区序列,使用NS5B区域的序列分析对丙型肝炎病毒进行常规基因分型。
J Clin Microbiol. 2007 Apr;45(4):1102-12. doi: 10.1128/JCM.02366-06. Epub 2007 Feb 7.
4
Different seroprevalence and molecular epidemiology patterns of hepatitis C virus infection in Italy.意大利丙型肝炎病毒感染的不同血清流行率和分子流行病学模式。
J Med Virol. 2005 Jul;76(3):327-32. doi: 10.1002/jmv.20376.
5
Analysis of the 5' noncoding region versus the NS5b region in genotyping hepatitis C virus isolates from blood donors in France.法国献血者丙型肝炎病毒分离株基因分型中5'非编码区与NS5b区的分析。
J Clin Microbiol. 2006 Jun;44(6):2051-6. doi: 10.1128/JCM.02463-05.
6
Back to the origin of HCV 2c subtype and spreading to the Calabria region (Southern Italy) over the last two centuries: a phylogenetic study.追溯丙型肝炎病毒2c亚型的起源及其在过去两个世纪向意大利南部卡拉布里亚地区的传播:一项系统发育研究。
Infect Genet Evol. 2014 Aug;26:352-8. doi: 10.1016/j.meegid.2014.06.006. Epub 2014 Jun 25.
7
Molecular characterization of genotype 2 and 4 hepatitis C virus isolates in French blood donors.法国献血者中2型和4型丙型肝炎病毒分离株的分子特征分析
J Med Virol. 2008 Oct;80(10):1732-9. doi: 10.1002/jmv.21285.
8
Molecular epidemiology and putative origin of hepatitis C virus in random volunteers from Argentina.阿根廷随机志愿者中丙型肝炎病毒的分子流行病学和可能起源。
World J Gastroenterol. 2013 Sep 21;19(35):5813-27. doi: 10.3748/wjg.v19.i35.5813.
9
Hepatitis C virus genotyping using an oligonucleotide microarray based on the NS5B sequence.基于 NS5B 序列的寡核苷酸微阵列进行丙型肝炎病毒基因分型。
J Clin Microbiol. 2010 Nov;48(11):3910-7. doi: 10.1128/JCM.01265-10. Epub 2010 Sep 15.
10
Mutations in the NS5A gene of hepatitis C virus subtype 1b and response to peg-IFNα-2a/RBV combination therapy in Azerbaijani patients.丙型肝炎病毒1b亚型NS5A基因的突变与阿塞拜疆患者对聚乙二醇干扰素α-2a/利巴韦林联合治疗的反应
Arch Virol. 2014 Nov;159(11):2893-9. doi: 10.1007/s00705-014-2133-0. Epub 2014 Aug 20.

引用本文的文献

1
Identification of two novel hepatitis C virus subtype 2 from Tunisia (2v and 2w).鉴定来自突尼斯的两种新型丙型肝炎病毒 2 型(2v 和 2w)。
PLoS One. 2021 Mar 11;16(3):e0248249. doi: 10.1371/journal.pone.0248249. eCollection 2021.
2
Comparison of Three Different Hepatitis C Virus Genotyping Methods: 5'NCR PCR-RFLP, Core Type-Specific PCR, and NS5b Sequencing in a Tertiary Care Hospital in South India.三种不同丙型肝炎病毒基因分型方法的比较:5'NCR PCR-RFLP、核心型特异性PCR以及印度南部一家三级护理医院中的NS5b测序
J Clin Lab Anal. 2017 May;31(3). doi: 10.1002/jcla.22045. Epub 2016 Sep 1.
3
Molecular epidemiology and putative origin of hepatitis C virus in random volunteers from Argentina.阿根廷随机志愿者中丙型肝炎病毒的分子流行病学和可能起源。
World J Gastroenterol. 2013 Sep 21;19(35):5813-27. doi: 10.3748/wjg.v19.i35.5813.
4
Phylogeny and phylodinamic of Hepatitis C in Italy.意大利丙型肝炎病毒的系统发育与系统动力学。
BMC Infect Dis. 2012;12 Suppl 2(Suppl 2):S5. doi: 10.1186/1471-2334-12-S2-S5. Epub 2012 Nov 12.
5
Use of sequence analysis of the NS5B region for routine genotyping of hepatitis C virus with reference to C/E1 and 5' untranslated region sequences.参照C/E1和5'非翻译区序列,使用NS5B区域的序列分析对丙型肝炎病毒进行常规基因分型。
J Clin Microbiol. 2007 Apr;45(4):1102-12. doi: 10.1128/JCM.02366-06. Epub 2007 Feb 7.
6
Genotype distribution and molecular epidemiology of hepatitis C virus in blood donors from southeast France.法国东南部献血者中丙型肝炎病毒的基因型分布及分子流行病学
J Clin Microbiol. 2005 Aug;43(8):3624-9. doi: 10.1128/JCM.43.8.3624-3629.2005.
7
Epidemiological dynamics of hepatitis C virus among 747 German individuals: new subtypes on the advance.747名德国人的丙型肝炎病毒流行病学动态:新亚型不断出现。
J Clin Microbiol. 2002 May;40(5):1866-8. doi: 10.1128/JCM.40.5.1866-1868.2002.
8
Genomic and phylogenetic analysis of hepatitis C virus isolates from argentine patients: a six-year retrospective study.阿根廷患者丙型肝炎病毒分离株的基因组和系统发育分析:一项为期六年的回顾性研究。
J Clin Microbiol. 2000 Dec;38(12):4560-8. doi: 10.1128/JCM.38.12.4560-4568.2000.
9
Classification of hepatitis C virus type 2 isolates by phylogenetic analysis of core and NS5 regions.通过对核心区和NS5区进行系统发育分析对2型丙型肝炎病毒分离株进行分类。
J Clin Microbiol. 1999 Jun;37(6):2116-7. doi: 10.1128/JCM.37.6.2116-2117.1999.
10
HCV genotypes in patients with chronic hepatitis C in Croatia.克罗地亚慢性丙型肝炎患者的丙型肝炎病毒基因型
Infection. 1998 May-Jun;26(3):173-7. doi: 10.1007/BF02771846.

本文引用的文献

1
Hepatitis C virus serological and polymerase chain reactions in human immunodeficiency virus-positive and -negative patients.人类免疫缺陷病毒阳性和阴性患者的丙型肝炎病毒血清学及聚合酶链反应
Clin Diagn Virol. 1994 Feb;2(1):7-16. doi: 10.1016/0928-0197(94)90031-0.
2
Genotype determination of hepatitis C virus from northern India: identification of a new subtype.印度北部丙型肝炎病毒的基因型测定:一种新亚型的鉴定。
J Med Virol. 1996 Feb;48(2):191-8. doi: 10.1002/(SICI)1096-9071(199602)48:2<191::AID-JMV12>3.0.CO;2-I.
3
Partial nucleotide sequencing of six subtype 2c hepatitis C viruses detected in Italy.在意大利检测到的6株2c型丙型肝炎病毒的部分核苷酸测序
J Clin Microbiol. 1995 Oct;33(10):2781-4. doi: 10.1128/jcm.33.10.2781-2784.1995.
4
Mutations in the nonstructural protein 5A gene and response to interferon in patients with chronic hepatitis C virus 1b infection.慢性丙型肝炎病毒1b感染患者非结构蛋白5A基因的突变与对干扰素的反应
N Engl J Med. 1996 Jan 11;334(2):77-81. doi: 10.1056/NEJM199601113340203.
5
Typing of hepatitis C virus isolates and characterization of new subtypes using a line probe assay.使用线性探针分析对丙型肝炎病毒分离株进行分型及新亚型的特征分析。
J Gen Virol. 1993 Jun;74 ( Pt 6):1093-102. doi: 10.1099/0022-1317-74-6-1093.
6
Classification of hepatitis C virus into six major genotypes and a series of subtypes by phylogenetic analysis of the NS-5 region.通过对NS-5区域进行系统发育分析,将丙型肝炎病毒分为六个主要基因型和一系列亚型。
J Gen Virol. 1993 Nov;74 ( Pt 11):2391-9. doi: 10.1099/0022-1317-74-11-2391.
7
Prevalence of hepatitis C virus genotypes in Italy.意大利丙型肝炎病毒基因型的流行情况。
J Clin Microbiol. 1994 Jan;32(1):232-4. doi: 10.1128/jcm.32.1.232-234.1994.
8
Sequence analysis of the core gene of 14 hepatitis C virus genotypes.14种丙型肝炎病毒基因型核心基因的序列分析
Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 Aug 16;91(17):8239-43. doi: 10.1073/pnas.91.17.8239.
9
Genetic heterogeneity of hepatitis C virus.丙型肝炎病毒的基因异质性
Intervirology. 1994;37(2):68-76. doi: 10.1159/000150360.
10
Survey of major genotypes and subtypes of hepatitis C virus using RFLP of sequences amplified from the 5' non-coding region.利用从5'非编码区扩增序列的限制性片段长度多态性对丙型肝炎病毒主要基因型和亚型进行调查。
J Gen Virol. 1995 May;76 ( Pt 5):1197-204. doi: 10.1099/0022-1317-76-5-1197.