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小核糖体亚基RNA结构数据库。

Database on the structure of small ribosomal subunit RNA.

作者信息

Van de Peer Y, Jansen J, De Rijk P, De Wachter R

机构信息

Departement Biochemie, Universiteit Antwerpen (UIA), Universiteitsplein 1, B-2610 Antwerpen, Belgium.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1997 Jan 1;25(1):111-6. doi: 10.1093/nar/25.1.111.

DOI:10.1093/nar/25.1.111
PMID:9016516
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC146374/
Abstract

The Antwerp database on small ribosomal subunit RNA now offers more than 6000 nucleotide sequences (August 1996). All these sequences are stored in the form of an alignment based on the adopted secondary structure model, which is corroborated by the observation of compensating substitutions in the alignment. Besides the primary and secondary structure information, literature references, accession numbers and detailed taxonomic information are also compiled. For ease of use, the complete database is made available to the scientific community via World Wide Web at URL http://rrna.uia.ac.be/ssu/ .

摘要

安特卫普小核糖体亚基RNA数据库目前提供了6000多条核苷酸序列(1996年8月)。所有这些序列都以基于所采用的二级结构模型的比对形式存储,该模型通过比对中补偿性替换的观察得到证实。除了一级和二级结构信息外,还汇编了文献参考、登录号和详细的分类信息。为便于使用,整个数据库通过万维网在网址http://rrna.uia.ac.be/ssu/ 向科学界提供。

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