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小核糖体亚基RNA结构数据库。

Database on the structure of small ribosomal subunit RNA.

作者信息

Van de Peer Y, Van den Broeck I, De Rijk P, De Wachter R

机构信息

Departement Biochemie, Universiteit Antwerpen (UIA), Belgium.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3488-94. doi: 10.1093/nar/22.17.3488.

DOI:10.1093/nar/22.17.3488
PMID:7524022
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC308309/
Abstract

The database on small ribosomal subunit RNA structure contains (June 1994) 2824 nucleotide sequences. All these sequences are stored in the form of an alignment based on the adopted secondary structure model, which in turn is corroborated by the observation of compensating substitutions in the alignment. The complete database is made available to the scientific community through anonymous ftp on our server in Antwerp. A special effort was made to improve electronic retrieval and a program is supplied that allows to create different file formats. The database can also be obtained from the EMBL nucleotide sequence library.

摘要

关于小核糖体亚基RNA结构的数据库(截至1994年6月)包含2824个核苷酸序列。所有这些序列均以基于所采用的二级结构模型的比对形式存储,而这种比对又通过观察比对中的补偿性替换得到了证实。完整的数据库通过我们在安特卫普服务器上的匿名ftp向科学界提供。我们特别努力改进电子检索,并提供了一个程序,可用于创建不同的文件格式。该数据库也可从EMBL核苷酸序列库获取。