Suppr超能文献

聚腺苷酸(Poly(A))信号控制酿酒酵母串联的GAL10基因和GAL7基因之间的转录终止和起始。

Poly(A) signals control both transcriptional termination and initiation between the tandem GAL10 and GAL7 genes of Saccharomyces cerevisiae.

作者信息

Greger I H, Proudfoot N J

机构信息

Sir William Dunn School of Pathology, University of Oxford, South Parks Road, Oxford OX1 3RE, UK.

出版信息

EMBO J. 1998 Aug 17;17(16):4771-9. doi: 10.1093/emboj/17.16.4771.

Abstract

We have investigated transcriptional interactions between the GAL10 and GAL7 genes of Saccharomyces cerevisiae. Both genes are part of the galactose (GAL) gene cluster which is transcriptionally activated to high levels in the presence of galactose. Since GAL7 is positioned downstream of GAL10 and both genes are expressed co-ordinately at high levels, the possibility that GAL10 transcription influences GAL7 was analysed. Using transcriptional run-on assays, we show that high levels of polymerase are found in the 600 bp GAL10-7 intergenic region that accumulate over the GAL7 promoter. Furthermore, GAL7 transcription is enhanced when the GAL10 upstream activating sequence (UASG) is deleted, indicating that interference between GAL10 and GAL7 is likely to occur in the chromosomal locus. Deletions in the GAL10 poly(A) signal result in complete inactivation of the GAL7 promoter and cause a dramatic increase in bi-cistronic GAL10-7 mRNA, predominantly utilizing the downstream, GAL7 poly(A) site. These data demonstrate a pivotal role for the GAL10 poly(A) site in allowing the simultaneous expression of GAL10 and GAL7. In effect, this RNA processing signal has a direct influence on both transcriptional termination and initiation.

摘要

我们研究了酿酒酵母GAL10和GAL7基因之间的转录相互作用。这两个基因都是半乳糖(GAL)基因簇的一部分,该基因簇在半乳糖存在的情况下会被转录激活至高水平。由于GAL7位于GAL10的下游,且两个基因在高水平上协同表达,因此分析了GAL10转录影响GAL7的可能性。通过转录延伸分析,我们发现在GAL10 - 7基因间区域的600 bp处有高水平的聚合酶,这些聚合酶在GAL7启动子上积累。此外,当GAL10上游激活序列(UASG)缺失时,GAL7转录增强,这表明GAL10和GAL7之间的干扰可能发生在染色体位点。GAL10聚腺苷酸化信号的缺失导致GAL7启动子完全失活,并导致双顺反子GAL10 - 7 mRNA显著增加,主要利用下游的GAL7聚腺苷酸化位点。这些数据证明了GAL10聚腺苷酸化位点在允许GAL10和GAL7同时表达中起关键作用。实际上,这种RNA加工信号对转录终止和起始都有直接影响。

相似文献

2
酿酒酵母GAL7启动子上转录干扰与起始的平衡
Proc Natl Acad Sci U S A. 2000 Jul 18;97(15):8415-20. doi: 10.1073/pnas.140217697.
3
酿酒酵母中GAL1、GAL7和GAL10基因3'区域体外RNA加工的异常方面。
Mol Cell Biol. 1992 Oct;12(10):4262-70. doi: 10.1128/mcb.12.10.4262-4270.1992.
4
芽殖酵母中反向基因间的转录碰撞
Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Jun 25;99(13):8796-801. doi: 10.1073/pnas.132270899. Epub 2002 Jun 19.
5
酵母GAL7基因转录起始区域的核苷酸序列。
Nucleic Acids Res. 1983 Dec 20;11(24):8555-68. doi: 10.1093/nar/11.24.8555.
7
酵母中GAL7基因侧翼的一个区域以及GAL4蛋白的一个结合位点作为上游激活序列。
J Mol Biol. 1985 Dec 20;186(4):821-4. doi: 10.1016/0022-2836(85)90400-0.
8
酿酒酵母GAL1 - GAL10双向启动子区域:上游激活序列UASG的定位与功能
Mol Cell Biol. 1984 Nov;4(11):2467-78. doi: 10.1128/mcb.4.11.2467-2478.1984.
9
酵母长谷部酿酒酵母中GAL基因在第十一条染色体上的独特分布。
Curr Microbiol. 2003 Dec;47(6):497-500. doi: 10.1007/s00284-003-4083-5.
10
除了GAL4之外,酵母GAL7基因多个拷贝的转录还受到特定因子的限制。
Mol Gen Genet. 1987 Jun;208(1-2):127-34. doi: 10.1007/BF00330433.

引用本文的文献

1
广泛的上位性塑造了RNA聚合酶II活性位点的功能和进化。
Nat Commun. 2025 Aug 27;16(1):7993. doi: 10.1038/s41467-025-63304-6.
2
金标装配转录单元文库到一个可重排的基因簇中。
Methods Mol Biol. 2025;2850:387-416. doi: 10.1007/978-1-0716-4220-7_22.
3
决定切割位置的关键抉择:与异常3'端加工及转录终止相关的病理学
J Mol Biol. 2025 Jan 1;437(1):168802. doi: 10.1016/j.jmb.2024.168802. Epub 2024 Sep 24.
4
基因表达的RNA聚合酶II活性调控及其与疾病的关系
J Mol Biol. 2025 Jan 1;437(1):168770. doi: 10.1016/j.jmb.2024.168770. Epub 2024 Aug 28.
5
广泛的上位性塑造了RNA聚合酶II活性位点的功能和进化。
bioRxiv. 2025 Feb 27:2023.02.27.530048. doi: 10.1101/2023.02.27.530048.
6
启动子遍及转录导致 RNA 聚合酶 II 暂停,以响应盐刺激来增强 DOG1 的表达。
EMBO J. 2023 Mar 1;42(5):e112443. doi: 10.15252/embj.2022112443. Epub 2023 Jan 27.
7
这是一个适者生存的世界——改变转录机制驱动基因下游(DoG)转录产物的产生。
Mol Cell. 2022 Jun 2;82(11):1981-1991. doi: 10.1016/j.molcel.2022.04.008. Epub 2022 Apr 28.
8
紧密串联的人类基因转录终止和起始的独特特征。
Mol Syst Biol. 2022 Apr;18(4):e10682. doi: 10.15252/msb.202110682.
9
转录邻域调节转录本异构体的长度和表达水平。
Science. 2022 Mar 4;375(6584):1000-1005. doi: 10.1126/science.abg0162. Epub 2022 Mar 3.
10
ELAV 介导的转录干扰抑制 Hox 基因 abd-A。
PLoS Genet. 2021 Nov 15;17(11):e1009843. doi: 10.1371/journal.pgen.1009843. eCollection 2021 Nov.

本文引用的文献

1
酿酒酵母中控制半乳糖利用的基因的酶表达与遗传连锁
Genetics. 1964 May;49(5):837-44. doi: 10.1093/genetics/49.5.837.
2
粟酒裂殖酵母的nmt1和nmt2基因的新生转录与相邻基因重叠。
EMBO J. 1998 Jun 1;17(11):3066-77. doi: 10.1093/emboj/17.11.3066.
3
人类半乳糖代谢的根本重要性:来自遗传学和生物化学的启示
Trends Genet. 1998 Mar;14(3):98-102. doi: 10.1016/s0168-9525(97)01379-6.
4
酵母中转录终止与信使核糖核酸成熟的偶联。
Science. 1998 Apr 10;280(5361):298-301. doi: 10.1126/science.280.5361.298.
5
源自酿酒酵母S288C的设计缺失菌株:用于PCR介导的基因破坏及其他应用的一组有用菌株和质粒。
Yeast. 1998 Jan 30;14(2):115-32. doi: 10.1002/(SICI)1097-0061(19980130)14:2<115::AID-YEA204>3.0.CO;2-2.
6
转录干扰会扰乱Sp1与HIV-1启动子的结合。
Nucleic Acids Res. 1998 Mar 1;26(5):1294-301. doi: 10.1093/nar/26.5.1294.
7
相邻的酵母基因ARO4和HIS7之间没有基因间区域。
J Biol Chem. 1997 Oct 17;272(42):26318-24. doi: 10.1074/jbc.272.42.26318.
8
裂殖酵母中RNA聚合酶II的转录终止信号
EMBO J. 1997 Jun 16;16(12):3633-43. doi: 10.1093/emboj/16.12.3633.
9
酵母信使核糖核酸的3'端形成信号
Trends Biochem Sci. 1996 Dec;21(12):477-81. doi: 10.1016/s0968-0004(96)10057-8.
10
RNA聚合酶II的通用转录因子。
Genes Dev. 1996 Nov 1;10(21):2657-83. doi: 10.1101/gad.10.21.2657.

文献AI研究员

20分钟写一篇综述,助力文献阅读效率提升50倍。

立即体验

用中文搜PubMed

大模型驱动的PubMed中文搜索引擎

马上搜索

文档翻译

学术文献翻译模型,支持多种主流文档格式。

立即体验