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氘代对HN-HN距离约束准确性的影响。

Effect of deuteration on the accuracy of HN-HN distance constraints.

作者信息

Briercheck D M, Rule G S

机构信息

Department of Biological Sciences, Carnegie Mellon University, 4400 Fifth Avenue, Pittsburgh, Pennsylvania, USA.

出版信息

J Magn Reson. 1998 Sep;134(1):52-6. doi: 10.1006/jmre.1998.1511.

DOI:10.1006/jmre.1998.1511
PMID:9740730
Abstract

The effect of deuteration on the measurement of HN-HN distances in moderately sized (15 kDa) proteins is discussed. Data are presented for a 15 kDa protein which is 95% deuterated on the Halpha position, and partially (70%) deuterated at other aliphatic sites. Deuteration of the protein increases the signal intensity of HN-HN cross peaks in NOESY spectra such that dipolar couplings between protons 4-5 A apart are readily detected. Experimental data and computer simulations show that either perdeuteration or partial deuteration of the protein increases the accuracy of amide-amide distance constraints. Thus, partial deuteration can be used to obtain more accurate long-range distance constraints for structure determination by NMR.

摘要

讨论了氘代对中等大小(15 kDa)蛋白质中HN-HN距离测量的影响。给出了一种15 kDa蛋白质的数据,该蛋白质在Hα位置95%氘代,在其他脂肪族位点部分(70%)氘代。蛋白质的氘代增加了NOESY谱中HN-HN交叉峰的信号强度,使得相距4-5 Å的质子之间的偶极耦合易于检测。实验数据和计算机模拟表明,蛋白质的全氘代或部分氘代均可提高酰胺-酰胺距离约束的准确性。因此,部分氘代可用于获得更准确的长程距离约束,以通过核磁共振确定结构。

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引用本文的文献

1
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