• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

依靠比较图谱。

Counting on comparative maps.

作者信息

Nadeau J H, Sankoff D

机构信息

Genetics Department, Case Western Reserve University School of Medicine, Cleveland, OH 44106, USA.

出版信息

Trends Genet. 1998 Dec;14(12):495-501. doi: 10.1016/s0168-9525(98)01607-2.

DOI:10.1016/s0168-9525(98)01607-2
PMID:9865155
Abstract

Comparative maps record the history of chromosome rearrangements that have occurred during the evolution of plants and animals. Effective use of these maps in genetic and evolutionary studies relies on quantitative analyses of the patterns of segment conservation. We review the analytical methods that have been developed for characterizing these maps and evaluate their application to existing comparative maps mainly for plants and animals.

摘要

比较图谱记录了动植物进化过程中发生的染色体重排历史。在遗传和进化研究中有效利用这些图谱依赖于对片段保守模式的定量分析。我们回顾了为表征这些图谱而开发的分析方法,并评估了它们在主要针对动植物的现有比较图谱中的应用。

相似文献

1
Counting on comparative maps.依靠比较图谱。
Trends Genet. 1998 Dec;14(12):495-501. doi: 10.1016/s0168-9525(98)01607-2.
2
Comparative mapping reveals extensive linkage conservation--but with gene order rearrangements--between the pig and the human genomes.比较图谱显示猪和人类基因组之间存在广泛的连锁保守性——但基因顺序存在重排。
Genomics. 1995 Feb 10;25(3):682-90. doi: 10.1016/0888-7543(95)80011-a.
3
A linkage map for the Newt Notophthalmus viridescens: Insights in vertebrate genome and chromosome evolution.绿螈(Notophthalmus viridescens)的连锁图谱:对脊椎动物基因组和染色体进化的见解
Dev Biol. 2017 Jun 15;426(2):211-218. doi: 10.1016/j.ydbio.2016.05.027. Epub 2016 Jun 2.
4
Maps of linkage and synteny homologies between mouse and man.小鼠与人之间的连锁和同线性同源性图谱。
Trends Genet. 1989 Mar;5(3):82-6. doi: 10.1016/0168-9525(89)90031-0.
5
Evolutionary conservation of large chromosomal segments reflected in mammalian gene maps.大型染色体片段的进化保守性在哺乳动物基因图谱中得以体现。
Clin Genet. 1979 Aug;16(2):72-81. doi: 10.1111/j.1399-0004.1979.tb00855.x.
6
Comparative linkage maps of the rice and maize genomes.水稻和玉米基因组的比较连锁图谱。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1993 Sep 1;90(17):7980-4. doi: 10.1073/pnas.90.17.7980.
7
Genetic maps and the use of synteny.遗传图谱与同线性的应用。
Methods Mol Biol. 2009;513:41-55. doi: 10.1007/978-1-59745-427-8_3.
8
Construction of chromosome markers from the Lake Victoria cichlid Paralabidochromis chilotes and their application to comparative mapping.基于维多利亚湖丽鱼科鱼类马拉维口孵非鲫构建染色体标记及其在比较图谱绘制中的应用
Cytogenet Genome Res. 2014;142(2):112-20. doi: 10.1159/000356128. Epub 2013 Nov 8.
9
Gene-based anchoring of the rat genetic linkage and cytogenetic maps: new regional localizations, orientation of the linkage groups, and insights into mammalian chromosome evolution.
Mamm Genome. 1998 Sep;9(9):721-34. doi: 10.1007/s003359900853.
10
Genetic distance and markers used in linkage mapping.连锁图谱中使用的遗传距离和标记。
Methods Mol Biol. 2011;713:43-53. doi: 10.1007/978-1-60327-416-6_4.

引用本文的文献

1
Xenolog classification.异源基因分类
Bioinformatics. 2017 Mar 1;33(5):640-649. doi: 10.1093/bioinformatics/btw686.
2
Large-scale analysis of microRNA evolution.大规模 miRNA 进化分析。
BMC Genomics. 2012 Jun 6;13:218. doi: 10.1186/1471-2164-13-218.
3
Identification of conserved gene clusters in multiple genomes based on synteny and homology.基于基因同线性和同源性在多个基因组中鉴定保守基因簇。
BMC Bioinformatics. 2011 Oct 5;12 Suppl 9(Suppl 9):S18. doi: 10.1186/1471-2105-12-S9-S18.
4
Extensive synteny conservation of holocentric chromosomes in Lepidoptera despite high rates of local genome rearrangements.尽管局部基因组重排率很高,但鳞翅目全着丝粒染色体的广泛同线性保守。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Apr 27;107(17):7680-5. doi: 10.1073/pnas.0910413107. Epub 2010 Apr 13.
5
A novel construction of genome space with biological geometry.具有生物几何结构的基因组空间的新构建。
DNA Res. 2010 Jun;17(3):155-68. doi: 10.1093/dnares/dsq008. Epub 2010 Apr 1.
6
A 4,103 marker integrated physical and comparative map of the horse genome.一份包含4103个标记的马基因组综合物理图谱和比较图谱。
Cytogenet Genome Res. 2008;122(1):28-36. doi: 10.1159/000151313. Epub 2008 Oct 14.
7
Early vertebrate whole genome duplications were predated by a period of intense genome rearrangement.在早期脊椎动物全基因组复制之前,有一段基因组剧烈重排的时期。
Genome Res. 2008 Oct;18(10):1582-91. doi: 10.1101/gr.080119.108. Epub 2008 Jul 14.
8
Chromosomal rearrangement inferred from comparisons of 12 Drosophila genomes.通过对12个果蝇基因组的比较推断出的染色体重排。
Genetics. 2008 Jul;179(3):1657-80. doi: 10.1534/genetics.107.086108. Epub 2008 Jul 13.
9
Sequence similarity network reveals common ancestry of multidomain proteins.序列相似性网络揭示了多结构域蛋白的共同祖先。
PLoS Comput Biol. 2008 May 16;4(4):e1000063. doi: 10.1371/journal.pcbi.1000063.
10
Analysis of gene order data supports vertical inheritance of the leukotoxin operon and genome rearrangements in the 5' flanking region in genus Mannheimia.基因顺序数据分析支持曼氏杆菌属中白细胞毒素操纵子的垂直遗传以及5'侧翼区域的基因组重排。
BMC Evol Biol. 2007 Oct 3;7:184. doi: 10.1186/1471-2148-7-184.