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ASDB：可变剪接基因数据库。

ASDB: database of alternatively spliced genes.

作者信息

Dralyuk I, Brudno M, Gelfand M S, Zorn M, Dubchak I

机构信息

National Energy Research Scientific Computing Center, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2000 Jan 1;28(1):296-7. doi: 10.1093/nar/28.1.296.

DOI:10.1093/nar/28.1.296
PMID:10592252
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC102426/
Abstract

Version 2.1 of ASDB (Alternative Splicing Data Base) contains 1922 protein and 2486 DNA sequences. The protein entries from SWISS-PROT are joined into clusters corresponding to alternatively spliced variants of one gene. The DNA division consists of complete genes with alternative splicing mentioned or annotated in GenBank. The search engine allows one to search over SWISS-PROT and GenBank fields and then follow the links to all variants. The database can be assessed at the URL http://cbcg.nersc.gov/asdb

摘要

ASDB（可变剪接数据库）2.1版本包含1922个蛋白质序列和2486个DNA序列。来自SWISS-PROT的蛋白质条目被整合为对应于一个基因可变剪接变体的簇。DNA部分由在GenBank中提及或注释了可变剪接的完整基因组成。搜索引擎允许用户在SWISS-PROT和GenBank字段中进行搜索，然后通过链接查看所有变体。可通过网址http://cbcg.nersc.gov/asdb访问该数据库。