2000年的酶数据库。
The ENZYME database in 2000.
作者信息
Bairoch A
机构信息
Swiss Institute of Bioinformatics, Centre Medical Universitaire, 1 rue Michel Servet, 1211 Geneva 4, Switzerland.
出版信息
Nucleic Acids Res. 2000 Jan 1;28(1):304-5. doi: 10.1093/nar/28.1.304.
Abstract
The ENZYME database is a repository of information related to the nomenclature of enzymes. In recent years it has became an indispensable resource for the development of metabolic databases. The current version contains information on 3705 enzymes. It is available through the ExPASy WWW server (http://www.expasy.ch/enzyme/ ).
摘要
酶数据库是一个与酶命名相关信息的储存库。近年来，它已成为代谢数据库开发不可或缺的资源。当前版本包含3705种酶的信息。可通过ExPASy万维网服务器（http://www.expasy.ch/enzyme/ ）获取该数据库。
相似文献
1
The ENZYME database in 2000.2000年的酶数据库。
Nucleic Acids Res. 2000 Jan 1;28(1):304-5. doi: 10.1093/nar/28.1.304.
2
The ENZYME data bank in 1999.1999年的酶数据库。
Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):310-1. doi: 10.1093/nar/27.1.310.
3
The ENZYME data bank in 1995.1995年的酶数据库。
Nucleic Acids Res. 1996 Jan 1;24(1):221-2. doi: 10.1093/nar/24.1.221.
4
ExplorEnz: a MySQL database of the IUBMB enzyme nomenclature.探索酶库：一个关于国际生物化学与分子生物学联盟酶命名法的MySQL数据库。
BMC Biochem. 2007 Jul 27;8:14. doi: 10.1186/1471-2091-8-14.
5
IntEnz, the integrated relational enzyme database.IntEnz，综合关系酶数据库。
Nucleic Acids Res. 2004 Jan 1;32(Database issue):D434-7. doi: 10.1093/nar/gkh119.
6
LIGAND database for enzymes, compounds and reactions.用于酶、化合物及反应的配体数据库。
Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):377-9. doi: 10.1093/nar/27.1.377.
7
ExPASy: The proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis.ExPASy：用于深入蛋白质知识和分析的蛋白质组学服务器。
Nucleic Acids Res. 2003 Jul 1;31(13):3784-8. doi: 10.1093/nar/gkg563.
8
Mendel, a database of nomenclature for sequenced plant genes.孟德尔，一个已测序植物基因命名数据库。
Nucleic Acids Res. 2001 Jan 1;29(1):118-9. doi: 10.1093/nar/29.1.118.
9
LPSN--list of prokaryotic names with standing in nomenclature.LPSN--具有命名地位的原核生物名称列表。
Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D613-6. doi: 10.1093/nar/gkt1111. Epub 2013 Nov 15.
10
The 1999 SWISS-2DPAGE database update.1999年瑞士二维聚丙烯酰胺凝胶电泳数据库更新
Nucleic Acids Res. 2000 Jan 1;28(1):286-8. doi: 10.1093/nar/28.1.286.
引用本文的文献
1
Deciphering enzymatic potential in metagenomic reads through DNA language models.通过DNA语言模型解读宏基因组读数中的酶促潜力。
Nucleic Acids Res. 2025 Aug 27;53(16). doi: 10.1093/nar/gkaf836.
2
Decoding microbial ecology and functions: metagenomic profiling of activated sludge contaminated with chlorolignin compounds in a pulp-paper mill treatment system.解码微生物生态学与功能：制浆造纸厂处理系统中受氯代木质素化合物污染的活性污泥的宏基因组分析
Arch Microbiol. 2025 Aug 30;207(10):247. doi: 10.1007/s00203-025-04443-8.
3
Protein functional site annotation using local structure embeddings.利用局部结构嵌入进行蛋白质功能位点注释。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2025 Aug 26;122(34):e2513219122. doi: 10.1073/pnas.2513219122. Epub 2025 Aug 20.
4
Bag-of-words is competitive with sum-of-embeddings language-inspired representations on protein inference.词袋模型在蛋白质推理方面与基于语言启发的词嵌入求和表示法具有竞争力。
PLoS One. 2025 Aug 6;20(8):e0325531. doi: 10.1371/journal.pone.0325531. eCollection 2025.
5
An insight into the draft genome of the Oriental rat flea, Xenopsylla cheopis, together with its Wolbachia endosymbiont.对东方鼠蚤（印鼠客蚤）及其沃尔巴克氏体共生菌的基因组草图的深入研究。
BMC Genomics. 2025 Jul 1;26(1):621. doi: 10.1186/s12864-025-11759-8.
6
Unlocking the Power of Magnesium: A Systematic Review and Meta-Analysis Regarding Its Role in Oxidative Stress and Inflammation.解锁镁的力量：关于其在氧化应激和炎症中作用的系统评价与荟萃分析
Antioxidants (Basel). 2025 Jun 16;14(6):740. doi: 10.3390/antiox14060740.
7
A phased chromosome-level genome of the annelid tubeworm Galeolaria caespitosa.环节动物管栖蠕虫丛生艾氏岩蠍的阶段性染色体水平基因组。
J Hered. 2025 Aug 23;116(5):702-712. doi: 10.1093/jhered/esaf025.
8
ProtNote: a multimodal method for protein-function annotation.ProtNote：一种用于蛋白质功能注释的多模态方法。
Bioinformatics. 2025 May 6;41(5). doi: 10.1093/bioinformatics/btaf170.
9
FGeneBERT: function-driven pre-trained gene language model for metagenomics.FGeneBERT：用于宏基因组学的功能驱动型预训练基因语言模型
Brief Bioinform. 2025 Mar 4;26(2). doi: 10.1093/bib/bbaf149.
10
Discovery of diverse and high-quality mRNA capping enzymes through a language model-enabled platform.通过一个基于语言模型的平台发现多样且高质量的mRNA加帽酶。
Sci Adv. 2025 Apr 11;11(15):eadt0402. doi: 10.1126/sciadv.adt0402. Epub 2025 Apr 9.
本文引用的文献
1
The PROSITE database, its status in 1999.PROSITE数据库及其1999年的状况。
Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):215-9. doi: 10.1093/nar/27.1.215.
2
GenBank.基因银行
Nucleic Acids Res. 1999 Jan 1;27(1):12-7. doi: 10.1093/nar/27.1.12.
3
Using metabolic pathway databases for functional annotation.利用代谢途径数据库进行功能注释。
Trends Genet. 1998 Aug;14(8):332-3. doi: 10.1016/s0168-9525(98)01523-6.
4
Metabolic databases.代谢数据库。
Trends Biochem Sci. 1998 Mar;23(3):114-6. doi: 10.1016/s0968-0004(98)01184-0.
5
Reconstruction of amino acid biosynthesis pathways from the complete genome sequence.基于完整基因组序列重建氨基酸生物合成途径
Genome Res. 1998 Mar;8(3):203-10. doi: 10.1101/gr.8.3.203.
6
A new generation of information retrieval tools for biologists: the example of the ExPASy WWW server.面向生物学家的新一代信息检索工具：以ExPASy万维网服务器为例。
Trends Biochem Sci. 1994 Jun;19(6):258-60. doi: 10.1016/0968-0004(94)90153-8.
7
The status of online Mendelian inheritance in man (OMIM) medio 1994.《人类孟德尔遗传在线》（OMIM）的状态，1994年年中。
Nucleic Acids Res. 1994 Sep;22(17):3470-3. doi: 10.1093/nar/22.17.3470.
Zotero 插件