• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

论全球分类的本质。

On the nature of global classification.

作者信息

Wheelis M L, Kandler O, Woese C R

机构信息

Department of Microbiology, University of California, Davis 95616.

出版信息

Proc Natl Acad Sci U S A. 1992 Apr;89(7):2930-4. doi: 10.1073/pnas.89.7.2930.

DOI:10.1073/pnas.89.7.2930
PMID:11537862
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC48777/
Abstract

Molecular sequencing technology has brought biology into the era of global (universal) classification. Methodologically and philosophically, global classification differs significantly from traditional, local classification. The need for uniformity requires that higher level taxa be defined on the molecular level in terms of universally homologous functions. A global classification should reflect both principal dimensions of the evolutionary process: genealogical relationship and quality and extent of divergence within a group. The ultimate purpose of a global classification is not simply information storage and retrieval; such a system should also function as an heuristic representation of the evolutionary paradigm that exerts a directing influence on the course of biology. The global system envisioned allows paraphyletic taxa. To retain maximal phylogenetic information in these cases, minor notational amendments in existing taxonomic conventions should be adopted.

摘要

分子测序技术已将生物学带入全球(通用)分类时代。在方法和理念上,全球分类与传统的局部分类有显著差异。对一致性的需求要求在分子水平上根据普遍同源功能来定义更高层次的分类单元。全球分类应反映进化过程的两个主要维度:谱系关系以及一个类群内分化的性质和程度。全球分类的最终目的不仅仅是信息存储和检索;这样一个系统还应作为进化范式的启发式表征,对生物学进程产生指导影响。所设想的全球系统允许并系分类单元。为了在这些情况下保留最大的系统发育信息,应采用对现有分类学惯例的微小符号修正。

相似文献

1
On the nature of global classification.论全球分类的本质。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1992 Apr;89(7):2930-4. doi: 10.1073/pnas.89.7.2930.
2
Kingdom Animalia: the zoological malaise from a microbial perspective.动物界:从微生物角度看动物学困境
Am Zool. 1990;30:861-75. doi: 10.1093/icb/30.4.861.
3
The evolution of ecological tolerance in prokaryotes.原核生物生态耐受性的进化。
Trans R Soc Edinb Earth Sci. 1989;80:209-23. doi: 10.1017/s0263593300028650.
4
Ten years in the library: new data confirm paleontological patterns.在图书馆的十年:新数据证实古生物学模式。
Paleobiology. 1993 Winter;19(1):43-51. doi: 10.1017/s0094837300012306.
5
What are mycoplasmas: the relationship of tempo and mode in bacterial evolution.什么是支原体:细菌进化中速度与模式的关系
J Mol Evol. 1984;21(4):305-16. doi: 10.1007/BF02115648.
6
A detailed phylogeny for the Methanomicrobiales.甲烷微菌目的详细系统发育。
Syst Appl Microbiol. 1992 Aug;15(3):363-71. doi: 10.1016/S0723-2020(11)80209-2.
7
A definition of the domains Archaea, Bacteria and Eucarya in terms of small subunit ribosomal RNA characteristics.根据小亚基核糖体RNA特征对古菌域、细菌域和真核生物域的定义。
Syst Appl Microbiol. 1991;14(4):305-10. doi: 10.1016/S0723-2020(11)80303-6.
8
Ribosomal RNA: a key to phylogeny.核糖体RNA:系统发育的关键。
FASEB J. 1993 Jan;7(1):113-23. doi: 10.1096/fasebj.7.1.8422957.
9
Phylogenetic placement of the Spirosomaceae.螺菌科的系统发育定位
Syst Appl Microbiol. 1990 Mar;13(1):19-23. doi: 10.1016/S0723-2020(11)80175-X.
10
Protozoa, Protista, Protoctista: what's in a name?原生动物、原生生物、原生生物界:名称里有什么含义?
J Hist Biol. 1989 Summer;22(2):277-305. doi: 10.1007/BF00139515.

引用本文的文献

1
Darwinizing Gaia: conceptual approaches.使盖亚理论达尔文化:概念方法。
Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2025 Aug 7;380(1931):20240089. doi: 10.1098/rstb.2024.0089.
2
Contributions of Non-Neuronal Cholinergic Systems to the Regulation of Immune Cell Function, Highlighting the Role of α7 Nicotinic Acetylcholine Receptors.非神经元胆碱能系统对免疫细胞功能调节的贡献,重点阐述α7烟碱型乙酰胆碱受体的作用。
Int J Mol Sci. 2024 Apr 22;25(8):4564. doi: 10.3390/ijms25084564.
3
The Prodigal Compound: Return of Ribosyl 1,5-Bisphosphate as an Important Player in Metabolism.浪子化合物:核酮糖 1,5-二磷酸的回归作为代谢中的重要参与者。
Microbiol Mol Biol Rev. 2018 Dec 19;83(1). doi: 10.1128/MMBR.00040-18. Print 2019 Mar.
4
The fur gene as a new phylogenetic marker for Vibrionaceae species identification.fur基因作为弧菌科物种鉴定的一种新的系统发育标记。
Appl Environ Microbiol. 2015 Apr;81(8):2745-52. doi: 10.1128/AEM.00058-15. Epub 2015 Feb 6.
5
Whole-proteome analysis of twelve species of alphaproteobacteria links four pathogens.十二种α变形菌的全蛋白质组分析将四种病原体联系起来。
Pathogens. 2013 Nov 26;2(4):627-35. doi: 10.3390/pathogens2040627.
6
How natural a kind is "eukaryote?".“真核生物”有多自然?
Cold Spring Harb Perspect Biol. 2014 Jun 2;6(6):a015974. doi: 10.1101/cshperspect.a015974.
7
Carl woese: from biophysics to evolutionary microbiology.卡尔·伍斯:从生物物理学到进化微生物学。
Indian J Microbiol. 2013 Sep;53(3):247-52. doi: 10.1007/s12088-013-0401-4. Epub 2013 Apr 5.
8
Phylogeny and beyond: Scientific, historical, and conceptual significance of the first tree of life.系统发育与超越:生命第一棵树的科学、历史和概念意义。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Jan 24;109(4):1011-8. doi: 10.1073/pnas.1109716109. Epub 2012 Jan 17.
9
Sequence analysis of an Archaeal virus isolated from a hypersaline lake in Inner Mongolia, China.对从中国内蒙古一个盐湖中分离出的古病毒进行序列分析。
BMC Genomics. 2007 Nov 9;8:410. doi: 10.1186/1471-2164-8-410.
10
The use of molecular techniques based on ribosomal RNA and DNA for rumen microbial ecosystem studies: a review.基于核糖体RNA和DNA的分子技术在瘤胃微生物生态系统研究中的应用:综述
Mol Biol Rep. 2008 Jun;35(2):265-74. doi: 10.1007/s11033-007-9079-1. Epub 2007 May 5.

本文引用的文献

1
The Main Outlines of Bacterial Classification.细菌分类大纲
J Bacteriol. 1941 Oct;42(4):437-66. doi: 10.1128/jb.42.4.437-466.1941.
2
THE CYTOPHAGA GROUP: A CONTRIBUTION TO THE BIOLOGY OF MYXOBACTERIA.噬纤维菌属:对黏细菌生物学的一项贡献。
Bacteriol Rev. 1942 Sep;6(3):143-96. doi: 10.1128/br.6.3.143-196.1942.
3
On the broad classification of organisms.论生物体的广义分类。
Q Rev Biol. 1959 Sep;34:210-26. doi: 10.1086/402733.
4
Kingdoms in turmoil.王国动荡不安。
New Sci. 1991 Mar 23;1761:46-50.
5
Non-Darwinian evolution.非达尔文式进化
Science. 1969 May 16;164(3881):788-98. doi: 10.1126/science.164.3881.788.
6
Evolutionary relationship of archaebacteria, eubacteria, and eukaryotes inferred from phylogenetic trees of duplicated genes.从重复基因的系统发育树推断古细菌、真细菌和真核生物的进化关系。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1989 Dec;86(23):9355-9. doi: 10.1073/pnas.86.23.9355.
7
Evolution of the vacuolar H+-ATPase: implications for the origin of eukaryotes.液泡H⁺-ATP酶的进化:对真核生物起源的启示
Proc Natl Acad Sci U S A. 1989 Sep;86(17):6661-5. doi: 10.1073/pnas.86.17.6661.
8
Bacterial evolution.细菌进化
Microbiol Rev. 1987 Jun;51(2):221-71. doi: 10.1128/mr.51.2.221-271.1987.
9
Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.迈向生物自然分类系统:关于古菌域、细菌域和真核生物域的提议。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1990 Jun;87(12):4576-9. doi: 10.1073/pnas.87.12.4576.
10
Early evolution and the origin of eukaryotes.早期进化与真核生物的起源
Curr Opin Genet Dev. 1991 Dec;1(4):457-63. doi: 10.1016/s0959-437x(05)80192-3.