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CIBEX:信息生物学基因表达数据库中心

CIBEX: center for information biology gene expression database.

作者信息

Ikeo Kazuho, Ishi-i Jun, Tamura Takurou, Gojobori Takashi, Tateno Yoshio

机构信息

Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan (DDBJ), National Institute of Genetics, Mishima 411-8540, Japan.

出版信息

C R Biol. 2003 Oct-Nov;326(10-11):1079-82. doi: 10.1016/j.crvi.2003.09.034.

DOI:10.1016/j.crvi.2003.09.034
PMID:14744116
Abstract

We describe the current status of the gene expression database CIBEX (Center for Information Biology gene EXpression database, http://cibex.nig.ac.jp), with a data retrieval system in compliance with MIAME, a standard that the MGED Society has developed for comparing and data produced in microarray experiments at different laboratories worldwide. CIBEX serves as a public repository for a wide range of high-throughput experimental data in gene expression research, including microarray-based experiments measuring mRNA, serial analysis of gene expression (SAGE tags), and mass spectrometry proteomic data.

摘要

我们描述了基因表达数据库CIBEX(信息生物学基因表达数据库中心,http://cibex.nig.ac.jp)的当前状态,其数据检索系统符合MIAME标准,该标准由MGED协会制定,用于比较全球不同实验室在微阵列实验中产生的数据。CIBEX作为一个公共存储库,存储基因表达研究中广泛的高通量实验数据,包括基于微阵列的测量mRNA的实验、基因表达系列分析(SAGE标签)和质谱蛋白质组学数据。

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