• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于频谱序列化的图编辑距离。

Graph edit distance from spectral seriation.

作者信息

Robles-Kelly A, Hancock E R

出版信息

IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2005 Mar;27(3):365-378. doi: 10.1109/TPAMI.2005.56.

DOI:10.1109/TPAMI.2005.56
PMID:15747792
Abstract

This paper is concerned with computing graph edit distance. One of the criticisms that can be leveled at existing methods for computing graph edit distance is that they lack some of the formality and rigor of the computation of string edit distance. Hence, our aim is to convert graphs to string sequences so that string matching techniques can be used. To do this, we use a graph spectral seriation method to convert the adjacency matrix into a string or sequence order. We show how the serial ordering can be established using the leading eigenvector of the graph adjacency matrix. We pose the problem of graph-matching as a maximum a posteriori probability (MAP) alignment of the seriation sequences for pairs of graphs. This treatment leads to an expression in which the edit cost is the negative logarithm of the a posteriori sequence alignment probability. We compute the edit distance by finding the sequence of string edit operations which minimizes the cost of the path traversing the edit lattice. The edit costs are determined by the components of the leading eigenvectors of the adjacency matrix and by the edge densities of the graphs being matched. We demonstrate the utility of the edit distance on a number of graph clustering problems.

摘要

本文关注于计算图编辑距离。对现有计算图编辑距离方法的一种批评是,它们缺乏字符串编辑距离计算中的一些形式化和严谨性。因此,我们的目标是将图转换为字符串序列,以便能够使用字符串匹配技术。为此,我们使用一种图谱序列化方法将邻接矩阵转换为字符串或序列顺序。我们展示了如何使用图邻接矩阵的主特征向量来建立序列排序。我们将图匹配问题作为图对的序列化序列的最大后验概率(MAP)对齐。这种处理导致了一种表达式,其中编辑成本是后验序列对齐概率的负对数。我们通过找到使遍历编辑格的路径成本最小化的字符串编辑操作序列来计算编辑距离。编辑成本由邻接矩阵的主特征向量的分量以及被匹配图的边密度决定。我们在一些图聚类问题上展示了编辑距离的效用。

相似文献

1
Graph edit distance from spectral seriation.基于频谱序列化的图编辑距离。
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2005 Mar;27(3):365-378. doi: 10.1109/TPAMI.2005.56.
2
Self-organizing maps for learning the edit costs in graph matching.用于学习图匹配中编辑成本的自组织映射。
IEEE Trans Syst Man Cybern B Cybern. 2005 Jun;35(3):503-14. doi: 10.1109/tsmcb.2005.846635.
3
A binary linear programming formulation of the graph edit distance.图编辑距离的二元线性规划公式化表述。
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2006 Aug;28(8):1200-14. doi: 10.1109/TPAMI.2006.152.
4
An eigenspace projection clustering method for inexact graph matching.一种用于不精确图匹配的特征空间投影聚类方法。
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2004 Apr;26(4):515-9. doi: 10.1109/TPAMI.2004.1265866.
5
Markov edit distance.马尔可夫编辑距离
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2004 Mar;26(3):311-21. doi: 10.1109/TPAMI.2004.1262315.
6
Isoperimetric graph partitioning for image segmentation.用于图像分割的等周图划分
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2006 Mar;28(3):469-75. doi: 10.1109/TPAMI.2006.57.
7
A (sub)graph isomorphism algorithm for matching large graphs.一种用于匹配大型图的(子)图同构算法。
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2004 Oct;26(10):1367-72. doi: 10.1109/TPAMI.2004.75.
8
Path similarity skeleton graph matching.路径相似性骨架图匹配。
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2008 Jul;30(7):1282-92. doi: 10.1109/TPAMI.2007.70769.
9
Weighted graph cuts without eigenvectors a multilevel approach.无需特征向量的加权图割:一种多级方法。
IEEE Trans Pattern Anal Mach Intell. 2007 Nov;29(11):1944-57. doi: 10.1109/TPAMI.2007.1115.
10
A graph-spectral approach to shape-from-shading.一种基于图谱的从阴影恢复形状方法。
IEEE Trans Image Process. 2004 Jul;13(7):912-26. doi: 10.1109/tip.2004.828414.

引用本文的文献

1
Spatial Location in Integrated Circuits through Infrared Microscopy.集成电路中的空间定位技术——红外显微镜方法
Sensors (Basel). 2021 Mar 20;21(6):2175. doi: 10.3390/s21062175.
2
Network Communities of Dynamical Influence.动态影响的网络社区。
Sci Rep. 2019 Nov 26;9(1):17590. doi: 10.1038/s41598-019-53942-4.
3
Exploring metabolic pathway disruption in the subchronic phencyclidine model of schizophrenia with the Generalized Singular Value Decomposition.运用广义奇异值分解探索精神分裂症亚慢性苯环利定模型中的代谢途径紊乱。
BMC Syst Biol. 2011 May 16;5:72. doi: 10.1186/1752-0509-5-72.
4
New polynomial-based molecular descriptors with low degeneracy.基于多项式的低简并性分子描述符。
PLoS One. 2010 Jul 30;5(7):e11393. doi: 10.1371/journal.pone.0011393.
5
Network-level analysis of cortical thickness of the epileptic brain.脑网络水平分析癫痫患者大脑皮层厚度。
Neuroimage. 2010 Oct 1;52(4):1302-13. doi: 10.1016/j.neuroimage.2010.05.045. Epub 2010 May 27.