• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

pcaMethods——一个生物导体软件包,为不完整数据提供主成分分析方法。

pcaMethods--a bioconductor package providing PCA methods for incomplete data.

作者信息

Stacklies Wolfram, Redestig Henning, Scholz Matthias, Walther Dirk, Selbig Joachim

机构信息

CAS-MPG Partner Institute for Comp. Biology, Shanghai, China.

出版信息

Bioinformatics. 2007 May 1;23(9):1164-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btm069. Epub 2007 Mar 7.

DOI:10.1093/bioinformatics/btm069
PMID:17344241
Abstract

UNLABELLED

pcaMethods is a Bioconductor compliant library for computing principal component analysis (PCA) on incomplete data sets. The results can be analyzed directly or used to estimate missing values to enable the use of missing value sensitive statistical methods. The package was mainly developed with microarray and metabolite data sets in mind, but can be applied to any other incomplete data set as well.

AVAILABILITY

http://www.bioconductor.org

摘要

未标记

pcaMethods是一个符合Bioconductor标准的库,用于对不完整数据集进行主成分分析(PCA)。结果可直接进行分析,或用于估计缺失值,以便能够使用对缺失值敏感的统计方法。该软件包主要是针对微阵列和代谢物数据集开发的,但也可应用于任何其他不完整数据集。

可用性

http://www.bioconductor.org

相似文献

1
pcaMethods--a bioconductor package providing PCA methods for incomplete data.pcaMethods——一个生物导体软件包,为不完整数据提供主成分分析方法。
Bioinformatics. 2007 May 1;23(9):1164-7. doi: 10.1093/bioinformatics/btm069. Epub 2007 Mar 7.
2
Robust imputation method for missing values in microarray data.微阵列数据中缺失值的稳健插补方法。
BMC Bioinformatics. 2007 May 3;8 Suppl 2(Suppl 2):S6. doi: 10.1186/1471-2105-8-S2-S6.
3
BioMart and Bioconductor: a powerful link between biological databases and microarray data analysis.生物数据库与芯片分析的强大纽带——生物集市与生物导体
Bioinformatics. 2005 Aug 15;21(16):3439-40. doi: 10.1093/bioinformatics/bti525.
4
goCluster integrates statistical analysis and functional interpretation of microarray expression data.goCluster整合了微阵列表达数据的统计分析和功能解释。
Bioinformatics. 2005 Sep 1;21(17):3575-7. doi: 10.1093/bioinformatics/bti574. Epub 2005 Jul 14.
5
twilight; a Bioconductor package for estimating the local false discovery rate.Twilight:一个用于估计局部错误发现率的Bioconductor软件包。
Bioinformatics. 2005 Jun 15;21(12):2921-2. doi: 10.1093/bioinformatics/bti436. Epub 2005 Apr 7.
6
OrderedList--a bioconductor package for detecting similarity in ordered gene lists.OrderedList——一个用于检测有序基因列表中相似性的生物导体软件包。
Bioinformatics. 2006 Sep 15;22(18):2315-6. doi: 10.1093/bioinformatics/btl385. Epub 2006 Jul 14.
7
A suite of Perl modules for handling microarray data.一套用于处理微阵列数据的Perl模块。
Bioinformatics. 2008 Apr 15;24(8):1102-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btn085. Epub 2008 Mar 18.
8
IlluminaGUI: graphical user interface for analyzing gene expression data generated on the Illumina platform.IlluminaGUI:用于分析在Illumina平台上生成的基因表达数据的图形用户界面。
Bioinformatics. 2007 Jun 1;23(11):1431-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btm101. Epub 2007 Mar 23.
9
A friendly statistics package for microarray analysis.一款用于微阵列分析的友好统计软件包。
Bioinformatics. 2005 Nov 1;21(21):4069-70. doi: 10.1093/bioinformatics/bti663. Epub 2005 Sep 27.
10
RefPlus: an R package extending the RMA Algorithm.RefPlus:一个扩展RMA算法的R包。
Bioinformatics. 2007 Sep 15;23(18):2493-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btm357. Epub 2007 Jul 10.

引用本文的文献

1
High-resolution time-series transcriptomic and metabolomic profiling reveals the regulatory mechanism underlying salt tolerance in maize.高分辨率时间序列转录组学和代谢组学分析揭示了玉米耐盐性的调控机制。
Genome Biol. 2025 Sep 10;26(1):275. doi: 10.1186/s13059-025-03766-5.
2
Modelling in-hospital length of stay: A comparison of linear and ensemble models for competing risk analysis.住院时长建模:用于竞争风险分析的线性模型与集成模型比较
PLoS One. 2025 Aug 26;20(8):e0322101. doi: 10.1371/journal.pone.0322101. eCollection 2025.
3
Rapid Divergence of Visual Systems and Signaling Traits to Contrasting Light Regimes During Early Speciation of African Crater Lake Cichlid Fish.
非洲火山口湖丽鱼科鱼类早期物种形成过程中视觉系统和信号特征对不同光照环境的快速分化
Mol Biol Evol. 2025 Sep 1;42(9). doi: 10.1093/molbev/msaf204.
4
Anticancer effects and mechanisms of , and on human lung carcinoma and hepatoma cells.[具体物质名称]、[具体物质名称]和[具体物质名称]对人肺癌和肝癌细胞的抗癌作用及机制
Comput Struct Biotechnol J. 2025 Jul 13;27:3066-3078. doi: 10.1016/j.csbj.2025.07.023. eCollection 2025.
5
A protein-specific priority code in presequences determines the efficiency of mitochondrial protein import.前序列中的蛋白质特异性优先级代码决定了线粒体蛋白质导入的效率。
PLoS Biol. 2025 Jul 21;23(7):e3003298. doi: 10.1371/journal.pbio.3003298. eCollection 2025 Jul.
6
Multi-omics decodes host-specific and environmental microbiome interactions in sepsis.多组学解析脓毒症中宿主特异性和环境微生物组的相互作用。
Front Microbiol. 2025 Jun 26;16:1618177. doi: 10.3389/fmicb.2025.1618177. eCollection 2025.
7
Global diversity of soil-transmitted helminths reveals population-biased genetic variation that impacts diagnostic targets.土壤传播蠕虫的全球多样性揭示了影响诊断靶点的群体偏向性遗传变异。
Nat Commun. 2025 Jul 10;16(1):6374. doi: 10.1038/s41467-025-61687-0.
8
Enrichment of extracellular vesicles using Mag-Net for the analysis of the plasma proteome.使用磁网富集细胞外囊泡以分析血浆蛋白质组。
Nat Commun. 2025 Jul 1;16(1):5447. doi: 10.1038/s41467-025-60595-7.
9
Investigation on the Influence of Protein Corona and Platelet Adhesion on Storage Bag Surface on the Platelet Storage Lesion.蛋白质冠层和血小板在储存袋表面的黏附对血小板储存损伤的影响研究
Adv Healthc Mater. 2025 Sep;14(23):e2501217. doi: 10.1002/adhm.202501217. Epub 2025 Jun 23.
10
Aneuploidy-induced proteostasis disruption impairs mitochondrial functions and mediates aggregation of mitochondrial precursor proteins through SQSTM1/p62.非整倍体诱导的蛋白质稳态破坏会损害线粒体功能,并通过SQSTM1/p62介导线粒体前体蛋白的聚集。
Nat Commun. 2025 Jun 17;16(1):5328. doi: 10.1038/s41467-025-60857-4.