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阿尔维拉:病毒株的比较基因组学。

Alvira: comparative genomics of viral strains.

作者信息

Enault François, Fremez Romain, Baranowski Eric, Faraut Thomas

机构信息

Laboratoire de Génétique Cellulaire INRA UMR444, Chemin de Borde Rouge BP52627 31326 Castanet Tolosan Cedex, France.

出版信息

Bioinformatics. 2007 Aug 15;23(16):2178-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btm293. Epub 2007 Jun 5.

DOI:10.1093/bioinformatics/btm293
PMID:17550913
Abstract

MOTIVATION

The Alvira tool is a general purpose multiple sequence alignment viewer with a special emphasis on the comparative analysis of viral genomes. This new tool has been devised specifically to address the problem of the simultaneous analysis of a large number of viral strains. The multiple alignment is embedded in a graph that can be explored at different levels of resolution.

AVAILABILITY

The Alvira software is available at: http://bioinfo.genopole-toulouse.prd.fr/Alvira.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

A tutorial is available at Alvira's homepage.

摘要

动机

Alvira工具是一款通用的多序列比对查看器,特别侧重于病毒基因组的比较分析。这个新工具是专门为解决同时分析大量病毒株的问题而设计的。多序列比对嵌入在一个可以在不同分辨率水平上进行探索的图形中。

可用性

Alvira软件可在以下网址获取:http://bioinfo.genopole-toulouse.prd.fr/Alvira。

补充信息

Alvira的主页上有一个教程。

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1
Alvira: comparative genomics of viral strains.阿尔维拉:病毒株的比较基因组学。
Bioinformatics. 2007 Aug 15;23(16):2178-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btm293. Epub 2007 Jun 5.
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引用本文的文献

1
Advances in bioinformatics and multi-omics integration: transforming viral infectious disease research in veterinary medicine.生物信息学与多组学整合的进展:变革兽医学中的病毒传染病研究
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