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基因表达特征的编码与比较策略。

Strategy for encoding and comparison of gene expression signatures.

作者信息

Yi Yajun, Li Chun, Miller Clay, George Alfred L

机构信息

Department of Medicine, Vanderbilt University, Nashville, Tennessee 37232-0275, USA.

出版信息

Genome Biol. 2007;8(7):R133. doi: 10.1186/gb-2007-8-7-r133.

DOI:10.1186/gb-2007-8-7-r133
PMID:17612401
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2323223/
Abstract

EXALT (EXpression signature AnaLysis Tool) is a computational system enabling comparisons of microarray data across experimental platforms and different laboratories http://seq.mc.vanderbilt.edu/exalt/. An essential feature of EXALT is a database holding thousands of gene expression signatures extracted from the Gene Expression Omnibus, and encoded in a searchable format. This novel approach to performing global comparisons of shared microarray data may have enormous value when coupled directly with a shared data repository.

摘要

EXALT(表达特征分析工具)是一个计算系统,可实现跨实验平台和不同实验室的微阵列数据比较(http://seq.mc.vanderbilt.edu/exalt/)。EXALT的一个基本特征是一个数据库,其中包含从基因表达综合数据库中提取的数千个基因表达特征,并以可搜索的格式进行编码。当直接与共享数据存储库结合使用时,这种对共享微阵列数据进行全局比较的新方法可能具有巨大价值。

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