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基于DNA结构第一性原理计算确定启动子位置。

Determining promoter location based on DNA structure first-principles calculations.

作者信息

Goñi J Ramon, Pérez Alberto, Torrents David, Orozco Modesto

机构信息

Institute for Research in Biomedicine, Parc Científic de Barcelona, Josep Samitier, Barcelona 08028, Spain.

出版信息

Genome Biol. 2007;8(12):R263. doi: 10.1186/gb-2007-8-12-r263.

DOI:10.1186/gb-2007-8-12-r263
PMID:18072969
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2246265/
Abstract

A new method for the prediction of promoter regions based on atomic molecular dynamics simulations of small oligonucleotides has been developed. The method works independently of gene structure conservation and orthology and of the presence of detectable sequence features. Results obtained with our method confirm the existence of a hidden physical code that modulates genome expression.

摘要

一种基于小寡核苷酸的原子分子动力学模拟预测启动子区域的新方法已经被开发出来。该方法的工作独立于基因结构保守性、直系同源性以及可检测序列特征的存在。用我们的方法获得的结果证实了存在一种调节基因组表达的隐藏物理密码。

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