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NOBAI:一个用于RNA结构中几何和统计特征字符编码的网络服务器。

NOBAI: a web server for character coding of geometrical and statistical features in RNA structure.

作者信息

Knudsen Vegeir, Caetano-Anollés Gustavo

机构信息

Department of Crop Sciences, University of Illinois at Urbana-Champaign, IL 61801, USA.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2008 Jul 1;36(Web Server issue):W85-90. doi: 10.1093/nar/gkn220. Epub 2008 Apr 29.

DOI:10.1093/nar/gkn220
PMID:18448469
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2447726/
Abstract

The Numeration of Objects in Biology: Alignment Inferences (NOBAI) web server provides a web interface to the applications in the NOBAI software package. This software codes topological and thermodynamic information related to the secondary structure of RNA molecules as multi-state phylogenetic characters, builds character matrices directly in NEXUS format and provides sequence randomization options. The web server is an effective tool that facilitates the search for evolutionary history embedded in the structure of functional RNA molecules. The NOBAI web server is accessible at 'http://www.manet.uiuc.edu/nobai/nobai.php'. This web site is free and open to all users and there is no login requirement.

摘要

生物学中对象的编号

比对推断(NOBAI)网络服务器为NOBAI软件包中的应用程序提供了一个网络界面。该软件将与RNA分子二级结构相关的拓扑和热力学信息编码为多状态系统发育特征,直接以NEXUS格式构建特征矩阵,并提供序列随机化选项。该网络服务器是一个有效的工具,有助于寻找嵌入在功能性RNA分子结构中的进化历史。可通过“http://www.manet.uiuc.edu/nobai/nobai.php”访问NOBAI网络服务器。该网站免费向所有用户开放,无需登录。

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