• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

核酸库的制备与表征。

Nucleic acid pool preparation and characterization.

作者信息

Piasecki Shawn K, Hall Bradley, Ellington Andrew D

机构信息

Department of Chemistry and Biochemistry, University of Texas at Austin, Austin, TX, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2009;535:3-18. doi: 10.1007/978-1-59745-557-2_1.

DOI:10.1007/978-1-59745-557-2_1
PMID:19377997
Abstract

Random sequence nucleic acid pools can be used in a variety of applications, including the selection of functional nucleic acids such as protein binding sites, aptamers, and ribozymes. while the design, synthesis, and purification of pools is relatively straightforward, keeping track of the size and complexity of a nucleic acid pool can sometimes task even an experienced researcher. The following protocol takes the reader through the steps necessary for the preparation of a pool of known complexity.

摘要

随机序列核酸文库可用于多种应用,包括选择功能性核酸,如蛋白质结合位点、适体和核酶。虽然文库的设计、合成和纯化相对简单,但即使是经验丰富的研究人员,有时也难以追踪核酸文库的大小和复杂性。以下方案将引导读者完成制备已知复杂性文库所需的步骤。

相似文献

1
Nucleic acid pool preparation and characterization.核酸库的制备与表征。
Methods Mol Biol. 2009;535:3-18. doi: 10.1007/978-1-59745-557-2_1.
2
Inside the Black Box: What Makes SELEX Better?黑箱之内:SELEX 缘何更优?
Molecules. 2019 Oct 7;24(19):3598. doi: 10.3390/molecules24193598.
3
Enhancing aptamer function and stability via in vitro selection using modified nucleic acids.通过使用修饰核酸的体外筛选提高适体功能和稳定性。
Methods. 2016 Aug 15;106:29-36. doi: 10.1016/j.ymeth.2016.03.008. Epub 2016 Mar 21.
4
High-throughput methods in aptamer discovery and analysis.适体发现与分析中的高通量方法。
Methods Enzymol. 2019;621:329-346. doi: 10.1016/bs.mie.2019.02.009. Epub 2019 Mar 12.
5
Absolute quantification of cell-bound DNA aptamers during SELEX.在 SELEX 过程中对细胞结合 DNA 适体进行绝对定量。
Nucleic Acid Ther. 2013 Apr;23(2):125-30. doi: 10.1089/nat.2012.0406. Epub 2013 Feb 13.
6
Development of DNA aptamers using Cell-SELEX.使用细胞 SELEX 技术开发 DNA 适体。
Nat Protoc. 2010 Jun;5(6):1169-85. doi: 10.1038/nprot.2010.66. Epub 2010 Jun 3.
7
Implementation of High-Throughput Sequencing (HTS) in Aptamer Selection Technology.高通量测序(HTS)在适体筛选技术中的应用
Int J Mol Sci. 2020 Nov 20;21(22):8774. doi: 10.3390/ijms21228774.
8
Identification of Nucleic Acid High Affinity Binding Sequences of Proteins by SELEX.通过指数富集的配体系统进化技术鉴定蛋白质的核酸高亲和力结合序列
Methods Mol Biol. 2015;1334:333-43. doi: 10.1007/978-1-4939-2877-4_21.
9
SELEX methods on the road to protein targeting with nucleic acid aptamers.SELEX 方法在利用核酸适体进行蛋白质靶向中的应用。
Biochimie. 2018 Nov;154:132-155. doi: 10.1016/j.biochi.2018.09.001. Epub 2018 Sep 5.
10
A mathematical analysis of multiple-target SELEX.多靶点 SELEX 的数学分析。
Bull Math Biol. 2010 Oct;72(7):1623-65. doi: 10.1007/s11538-009-9491-x. Epub 2010 Jan 14.

引用本文的文献

1
Optimization of RNA Aptamer SELEX Methods: Improved Aptamer Transcript 3'-End Homogeneity, PAGE Purification Yield, and Target-Bound Aptamer RNA Recovery.RNA 适体 SELEX 方法的优化:提高适体转录本 3'末端同质性、PAGE 纯化产率和靶结合适体 RNA 回收率。
Nucleic Acid Ther. 2022 Feb;32(1):74-80. doi: 10.1089/nat.2021.0060. Epub 2021 Nov 10.
2
Aptamers, the Nucleic Acid Antibodies, in Cancer Therapy.适体,即核酸抗体,在癌症治疗中的应用。
Int J Mol Sci. 2020 Apr 17;21(8):2793. doi: 10.3390/ijms21082793.
3
Development of a novel, high-affinity ssDNA trypsin inhibitor.
新型高亲和力 ssDNA 胰蛋白酶抑制剂的研制。
J Enzyme Inhib Med Chem. 2019 Dec;34(1):638-643. doi: 10.1080/14756366.2019.1569648.
4
Characterization of homing endonuclease binding and cleavage specificities using yeast surface display SELEX (YSD-SELEX).使用酵母表面展示SELEX(YSD-SELEX)对归巢内切酶结合和切割特异性进行表征。
Nucleic Acids Res. 2017 Feb 17;45(3):e11. doi: 10.1093/nar/gkw864.
5
Development of RNA aptamers as molecular probes for HER2(+) breast cancer study using cell-SELEX.使用细胞指数富集的配体系统进化技术开发RNA适配体作为HER2(+)乳腺癌研究的分子探针。
Iran J Basic Med Sci. 2015 Jun;18(6):576-86.
6
High-affinity RNA Aptamers Against the HIV-1 Protease Inhibit Both In Vitro Protease Activity and Late Events of Viral Replication.高亲和力 RNA 适体可抑制 HIV-1 蛋白酶的体外酶活性和病毒复制的晚期事件。
Mol Ther Nucleic Acids. 2015 Feb 17;4(2):e228. doi: 10.1038/mtna.2015.1.
7
An RNA aptamer possessing a novel monovalent cation-mediated fold inhibits lysozyme catalysis by inhibiting the binding of long natural substrates.一种具有新型单价阳离子介导折叠的 RNA 适体通过抑制长天然底物的结合来抑制溶菌酶的催化作用。
RNA. 2014 Apr;20(4):447-61. doi: 10.1261/rna.043034.113. Epub 2014 Feb 25.
8
Selection of RNA aptamers imported into yeast and human mitochondria.导入酵母和人线粒体的 RNA 适体的选择。
RNA. 2010 May;16(5):926-41. doi: 10.1261/rna.1914110. Epub 2010 Mar 26.