• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

蛋白质分段同位素标记的最新进展:NMR 在大蛋白和糖蛋白中的应用。

Recent advances in segmental isotope labeling of proteins: NMR applications to large proteins and glycoproteins.

机构信息

Institute for Molecular Biology and Biophysics, ETH Zürich, Zurich, Switzerland.

出版信息

J Biomol NMR. 2010 Jan;46(1):51-65. doi: 10.1007/s10858-009-9362-7. Epub 2009 Aug 19.

DOI:10.1007/s10858-009-9362-7
PMID:19690964
Abstract

In the last 15 years substantial advances have been made to place isotope labels in native and glycosylated proteins for NMR studies and structure determination. Key developments include segmental isotope labeling using Native Chemical Ligation, Expressed Protein Ligation and Protein Trans-Splicing. These advances are pushing the size limit of NMR spectroscopy further making larger proteins accessible for this technique. It is just emerging that segmental isotope labeling can be used to define inter-domain interactions in NMR structure determination. Labeling of post-translational modified proteins like glycoproteins remains difficult but some promising developments were recently achieved. Key achievements are segmental and site-specific labeling schemes that improve resonance assignment and structure determination of the glycan moiety. We adjusted the focus of this perspective article to concentrate on the NMR applications based on recent developments rather than on labeling methods themselves to illustrate the considerable potential for biomolecular NMR.

摘要

在过去的 15 年中,在将同位素标记应用于天然和糖基化蛋白质的 NMR 研究和结构测定方面取得了重大进展。关键的发展包括使用天然化学连接、表达蛋白连接和蛋白质转剪接进行分段同位素标记。这些进展正在推动 NMR 光谱学的大小限制进一步发展,使更大的蛋白质能够应用于该技术。现在刚刚出现的是,分段同位素标记可以用于在 NMR 结构测定中定义结构域间相互作用。对糖蛋白等翻译后修饰蛋白的标记仍然很困难,但最近取得了一些有希望的进展。关键成就是分段和位点特异性标记方案,可提高聚糖部分的共振分配和结构测定。我们调整了这篇观点文章的重点,集中讨论基于最新发展的 NMR 应用,而不是标记方法本身,以说明生物分子 NMR 的巨大潜力。

相似文献

1
Recent advances in segmental isotope labeling of proteins: NMR applications to large proteins and glycoproteins.蛋白质分段同位素标记的最新进展:NMR 在大蛋白和糖蛋白中的应用。
J Biomol NMR. 2010 Jan;46(1):51-65. doi: 10.1007/s10858-009-9362-7. Epub 2009 Aug 19.
2
Segmental labeling to study multidomain proteins.分段标记法研究多结构域蛋白。
Adv Exp Med Biol. 2012;992:17-33. doi: 10.1007/978-94-007-4954-2_2.
3
Selective isotope labeling for NMR structure determination of proteins in complex with unlabeled ligands.用于与未标记配体结合的蛋白质的 NMR 结构测定的选择性同位素标记。
J Biomol NMR. 2019 Apr;73(3-4):183-189. doi: 10.1007/s10858-019-00241-9. Epub 2019 Apr 30.
4
NMR solution structure determination of large RNA-protein complexes.大型核糖核蛋白复合物的核磁共振溶液结构测定
Prog Nucl Magn Reson Spectrosc. 2016 Nov;97:57-81. doi: 10.1016/j.pnmrs.2016.10.001. Epub 2016 Oct 27.
5
Segmental isotopic labeling by asparaginyl endopeptidase-mediated protein ligation.通过天冬酰胺内肽酶介导的蛋白质连接进行片段同位素标记。
J Biomol NMR. 2018 Aug;71(4):225-235. doi: 10.1007/s10858-018-0175-4. Epub 2018 Mar 13.
6
The Preparation and Solution NMR Spectroscopy of Human Glycoproteins Is Accessible and Rewarding.人糖蛋白的制备及溶液核磁共振波谱分析方法简便且成果丰硕。
Methods Enzymol. 2019;614:239-261. doi: 10.1016/bs.mie.2018.08.021. Epub 2018 Sep 22.
7
Stable isotope labeling approaches for NMR characterization of glycoproteins using eukaryotic expression systems.使用真核表达系统对糖蛋白进行核磁共振表征的稳定同位素标记方法。
J Biomol NMR. 2018 Jul;71(3):193-202. doi: 10.1007/s10858-018-0169-2. Epub 2018 Feb 28.
8
Isotope labeling strategies for NMR studies of RNA.用于 RNA 的 NMR 研究的同位素标记策略。
J Biomol NMR. 2010 Jan;46(1):113-25. doi: 10.1007/s10858-009-9375-2. Epub 2009 Sep 30.
9
Advanced approaches for elucidating structures of large RNAs using NMR spectroscopy and complementary methods.利用 NMR 光谱学和互补方法阐明大型 RNA 结构的先进方法。
Methods. 2020 Nov 1;183:93-107. doi: 10.1016/j.ymeth.2020.01.009. Epub 2020 Jan 20.
10
Segmental isotopic labeling of proteins for nuclear magnetic resonance.用于核磁共振的蛋白质片段同位素标记
Methods Enzymol. 2009;462:151-75. doi: 10.1016/S0076-6879(09)62008-5.

引用本文的文献

1
Solid-state NMR protocols for unveiling dynamics and (drug) interactions of membrane-bound proteins.用于揭示膜结合蛋白动力学和(药物)相互作用的固态核磁共振方法。
Protein Sci. 2025 Apr;34(4):e70102. doi: 10.1002/pro.70102.
2
Primary Structure of Glycans by NMR Spectroscopy.通过 NMR 光谱学研究聚糖的一级结构。
Chem Rev. 2023 Feb 8;123(3):1040-1102. doi: 10.1021/acs.chemrev.2c00580. Epub 2023 Jan 9.
3
Ultrafast Magic Angle Spinning Solid-State NMR Spectroscopy: Advances in Methodology and Applications.超快魔角旋转固态核磁共振波谱学:方法学和应用的进展。

本文引用的文献

1
New methods for proteomic research: preparation of proteins with N-terminal cysteines for labeling and conjugation.蛋白质组学研究的新方法:用于标记和偶联的含N端半胱氨酸蛋白质的制备
Angew Chem Int Ed Engl. 2002 Jun 17;41(12):2171-4. doi: 10.1002/1521-3773(20020617)41:12<2171::aid-anie2171>3.0.co;2-q.
2
Segmental isotopic labeling of a central domain in a multidomain protein by protein trans-splicing using only one robust DnaE intein.仅使用一种强大的DnaE内含肽,通过蛋白质反式剪接对多结构域蛋白质中的中央结构域进行片段同位素标记。
Angew Chem Int Ed Engl. 2009;48(33):6128-31. doi: 10.1002/anie.200901488.
3
Semisynthesis of a homogeneous glycoprotein enzyme: ribonuclease C: part 1.
Chem Rev. 2023 Feb 8;123(3):918-988. doi: 10.1021/acs.chemrev.2c00197. Epub 2022 Dec 21.
4
Three segment ligation of a 104 kDa multi-domain protein by SrtA and OaAEP1.SrtA 和 OaAEP1 对 104 kDa 多结构域蛋白的三段连接。
J Biomol NMR. 2023 Apr;77(1-2):25-37. doi: 10.1007/s10858-022-00409-w. Epub 2022 Dec 21.
5
Segmental and site-specific isotope labelling strategies for structural analysis of posttranslationally modified proteins.用于翻译后修饰蛋白质结构分析的片段和位点特异性同位素标记策略。
RSC Chem Biol. 2021 Aug 11;2(5):1441-1461. doi: 10.1039/d1cb00045d. eCollection 2021 Oct 7.
6
Virus Structures and Dynamics by Magic-Angle Spinning NMR.魔角旋转 NMR 研究病毒结构与动力学
Annu Rev Virol. 2021 Sep 29;8(1):219-237. doi: 10.1146/annurev-virology-011921-064653.
7
Silkworm Pupae Function as Efficient Producers of Recombinant Glycoproteins with Stable-Isotope Labeling.家蚕蛹可作为高效的重组糖蛋白生产宿主,实现稳定同位素标记。
Biomolecules. 2020 Oct 26;10(11):1482. doi: 10.3390/biom10111482.
8
Novel NMR Avenues to Explore the Conformation and Interactions of Glycans.探索聚糖构象与相互作用的新型核磁共振途径
ACS Omega. 2019 Aug 19;4(9):13618-13630. doi: 10.1021/acsomega.9b01901. eCollection 2019 Aug 27.
9
Segmental isotopic labeling by asparaginyl endopeptidase-mediated protein ligation.通过天冬酰胺内肽酶介导的蛋白质连接进行片段同位素标记。
J Biomol NMR. 2018 Aug;71(4):225-235. doi: 10.1007/s10858-018-0175-4. Epub 2018 Mar 13.
10
A molecular engineering toolbox for the structural biologist.结构生物学家的分子工程工具箱。
Q Rev Biophys. 2017 Jan;50:e7. doi: 10.1017/S0033583517000051.
一种同源糖蛋白酶的半合成:核糖核酸酶C:第1部分
Angew Chem Int Ed Engl. 2009;48(11):1936-40. doi: 10.1002/anie.200804734.
4
NMR structure determination of a segmentally labeled glycoprotein using in vitro glycosylation.利用体外糖基化对片段标记糖蛋白进行核磁共振结构测定。
J Am Chem Soc. 2009 Jan 28;131(3):1274-81. doi: 10.1021/ja808682v.
5
Attachment of an NMR-invisible solubility enhancement tag using a sortase-mediated protein ligation method.使用分选酶介导的蛋白质连接方法连接一个核磁共振不可见的溶解度增强标签。
J Biomol NMR. 2009 Mar;43(3):145-50. doi: 10.1007/s10858-008-9296-5. Epub 2009 Jan 13.
6
Glycoprotein synthesis: an update.糖蛋白合成:最新进展。
Chem Rev. 2009 Jan;109(1):131-63. doi: 10.1021/cr078291i.
7
Segmental isotopic labelling of a multidomain protein by protein ligation by protein trans-splicing.通过蛋白质反式剪接进行蛋白质连接对多结构域蛋白质进行片段同位素标记。
Chembiochem. 2008 Dec 15;9(18):2958-61. doi: 10.1002/cbic.200800604.
8
Dictyostelium discoideum--a promising expression system for the production of eukaryotic proteins.盘基网柄菌——一种用于生产真核蛋白质的有前景的表达系统。
FASEB J. 2008 Dec;22(12):4055-66. doi: 10.1096/fj.08-110544. Epub 2008 Aug 19.
9
13C-sialic acid labeling of glycans on glycoproteins using ST6Gal-I.使用ST6Gal-I对糖蛋白上的聚糖进行13C-唾液酸标记。
J Am Chem Soc. 2008 Sep 10;130(36):11864-5. doi: 10.1021/ja804614w. Epub 2008 Aug 14.
10
Toward the characterization of peptidoglycan structure and protein-peptidoglycan interactions by solid-state NMR spectroscopy.通过固态核磁共振光谱法对肽聚糖结构及蛋白质-肽聚糖相互作用进行表征
J Am Chem Soc. 2008 Apr 30;130(17):5618-9. doi: 10.1021/ja7108135. Epub 2008 Apr 5.