Suppr超能文献

植物古基因组学:基于同线性的灭绝祖先建模。

Palaeogenomics of plants: synteny-based modelling of extinct ancestors.

机构信息

INRA, UMR 1095, Laboratoire Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales, 234 avenue du Brézet, 63100 Clermont Ferrand, France.

出版信息

Trends Plant Sci. 2010 Sep;15(9):479-87. doi: 10.1016/j.tplants.2010.06.001. Epub 2010 Jul 17.

Abstract

In the past ten years, international initiatives have led to the development of large sets of genomic resources that allow comparative genomic studies between plant genomes at a high level of resolution. Comparison of map-based genomic sequences revealed shared intra-genomic duplications, providing new insights into the evolution of flowering plant genomes from common ancestors. Plant genomes can be presented as concentric circles, providing a new reference for plant chromosome evolutionary relationships and an efficient tool for gene annotation and cross-genome markers development. Recent palaeogenomic data demonstrate that whole-genome duplications have provided a motor for the evolutionary success of flowering plants over the last 50-70 million years.

摘要

在过去的十年中,国际倡议已经促成了大量基因组资源的发展,这些资源允许在高分辨率水平上对植物基因组进行比较基因组研究。基于图谱的基因组序列比较揭示了基因组内的共享重复,为从共同祖先演化而来的开花植物基因组提供了新的见解。植物基因组可以呈现为同心环,为植物染色体进化关系提供了新的参考,也为基因注释和跨基因组标记开发提供了有效的工具。最近的古基因组数据表明,全基因组复制为开花植物在过去 5000 万至 7000 万年的进化成功提供了动力。

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