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1
Genome sequences of Pelagibaca bermudensis HTCC2601T and Maritimibacter alkaliphilus HTCC2654T, the type strains of two marine Roseobacter genera.Pelagibaca bermudensis HTCC2601T 和 Maritimibacter alkaliphilus HTCC2654T 的基因组序列，它们分别是两个海洋玫瑰杆菌属的模式菌株。
J Bacteriol. 2010 Oct;192(20):5552-3. doi: 10.1128/JB.00873-10. Epub 2010 Aug 20.
2
Pelagibaca bermudensis gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium within the Roseobacter clade in the order Rhodobacterales.百慕大远洋杆菌，新属，新种，红杆菌目红杆菌科内一种新型海洋细菌。
Int J Syst Evol Microbiol. 2006 Apr;56(Pt 4):855-859. doi: 10.1099/ijs.0.64063-0.
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Maritimibacter alkaliphilus gen. nov., sp. nov., a genome-sequenced marine bacterium of the Roseobacter clade in the order Rhodobacterales.嗜碱海杆菌属新属，新种，一种已进行基因组测序的红杆菌目红杆菌科海洋细菌。
Int J Syst Evol Microbiol. 2007 Jul;57(Pt 7):1653-1658. doi: 10.1099/ijs.0.64960-0.
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J Bacteriol. 2011 Jan;193(1):305-6. doi: 10.1128/JB.01205-10. Epub 2010 Oct 29.
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Maritimibacter harenae sp. nov. and Sneathiella litorea sp. nov.: members of Alphaproteobacteria isolated from sea sand.海泥杆菌新种和滨浅海硫杆菌新种：海砂中分离的α-变形菌成员。
Antonie Van Leeuwenhoek. 2021 Jun;114(6):799-811. doi: 10.1007/s10482-021-01559-x. Epub 2021 Mar 26.
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J Bacteriol. 2010 Jul;192(13):3549-50. doi: 10.1128/JB.00412-10. Epub 2010 Apr 23.
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gen. nov., sp. nov., a novel non-marine bacterium belonging to the group, and reclassification of (Zhong . 2015) as gen. nov., comb. nov.新属新种，一种新型非海洋细菌，属于 群，同时将 （Zhong. 2015）重新分类为 新属，新组合。
Int J Syst Evol Microbiol. 2021 Jun;71(6). doi: 10.1099/ijsem.0.004859.
8
Phylogenomic analyses of a clade within the roseobacter group suggest taxonomic reassignments of species of the genera Aestuariivita, Citreicella, Loktanella, Nautella, Pelagibaca, Ruegeria, Thalassobius, Thiobacimonas and Tropicibacter, and the proposal of six novel genera.对玫瑰杆菌群内一个进化枝的系统基因组分析表明，需对河口维他菌属、柠檬黄杆菌属、洛氏菌属、瑙氏菌属、海洋芽孢杆菌属、红杆菌属、嗜盐杆菌属、硫杆菌属和嗜热栖菌属的物种进行分类重新划分，并提议设立六个新属。
Int J Syst Evol Microbiol. 2018 Jul;68(7):2393-2411. doi: 10.1099/ijsem.0.002833. Epub 2018 May 29.
9
Genome sequence of Oceanicaulis sp. strain HTCC2633, isolated from the Western Sargasso Sea.分离自马尾藻海的海洋杆菌 HTCC2633 株的基因组序列。
J Bacteriol. 2011 Jan;193(1):317-8. doi: 10.1128/JB.01267-10. Epub 2010 Oct 29.
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引用本文的文献

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Front Microbiol. 2023 Dec 20;14:1287477. doi: 10.3389/fmicb.2023.1287477. eCollection 2023.
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ISME J. 2021 Jul;15(7):1987-2000. doi: 10.1038/s41396-021-00899-w. Epub 2021 Mar 2.
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promotes biofuel competence of in a broad range of abiotic stressors: dynamics of quorum-sensing precursors and strategic improvement in lipid productivity.在广泛的非生物胁迫因素中提高生物燃料能力：群体感应前体的动态变化及脂质生产力的策略性提升。
Biotechnol Biofuels. 2018 Apr 7;11:102. doi: 10.1186/s13068-018-1097-9. eCollection 2018.
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Sci Rep. 2016 Oct 20;6:35528. doi: 10.1038/srep35528.
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Ubiquity and diversity of heterotrophic bacterial nasA genes in diverse marine environments.不同海洋环境中异养细菌nasA基因的普遍性和多样性。
PLoS One. 2015 Feb 3;10(2):e0117473. doi: 10.1371/journal.pone.0117473. eCollection 2015.
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Recoding of the stop codon UGA to glycine by a BD1-5/SN-2 bacterium and niche partitioning between Alpha- and Gammaproteobacteria in a tidal sediment microbial community naturally selected in a laboratory chemostat.BD1-5/SN-2 菌对 UGA 终止密码子的重编码为甘氨酸，以及潮汐沉积微生物群落中α-和γ-变形菌之间的生态位分隔，该群落是在实验室恒化器中自然选择的。
Front Microbiol. 2014 May 16;5:231. doi: 10.3389/fmicb.2014.00231. eCollection 2014.
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High-throughput proteogenomics of Ruegeria pomeroyi: seeding a better genomic annotation for the whole marine Roseobacter clade. Ruegeria pomeroyi 的高通量蛋白基因组学研究：为整个海洋 Roseobacter 分支提供更好的基因组注释。
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本文引用的文献

1
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Arch Microbiol. 2008 Jun;189(6):531-9. doi: 10.1007/s00203-008-0353-y. Epub 2008 Feb 6.
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IMG/M: a data management and analysis system for metagenomes.IMG/M：一种用于宏基因组的数据管理与分析系统。
Nucleic Acids Res. 2008 Jan;36(Database issue):D534-8. doi: 10.1093/nar/gkm869. Epub 2007 Oct 11.
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Maritimibacter alkaliphilus gen. nov., sp. nov., a genome-sequenced marine bacterium of the Roseobacter clade in the order Rhodobacterales.嗜碱海杆菌属新属，新种，一种已进行基因组测序的红杆菌目红杆菌科海洋细菌。
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Pelagibaca bermudensis HTCC2601T 和 Maritimibacter alkaliphilus HTCC2654T 的基因组序列，它们分别是两个海洋玫瑰杆菌属的模式菌株。

Genome sequences of Pelagibaca bermudensis HTCC2601T and Maritimibacter alkaliphilus HTCC2654T, the type strains of two marine Roseobacter genera.

机构信息

Department of Microbiology, Oregon State University, Corvallis, Oregon 97331, USA.

出版信息

J Bacteriol. 2010 Oct;192(20):5552-3. doi: 10.1128/JB.00873-10. Epub 2010 Aug 20.

DOI:10.1128/JB.00873-10
PMID:20729358
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2950497/
Abstract

Pelagibaca bermudensis HTCC2601(T) and Maritimibacter alkaliphilus HTCC2654(T) represent two marine genera in the globally significant Roseobacter clade of the Alphaproteobacteria. Here, we present the genome sequences of these organisms, isolated from the Sargasso Sea using dilution-to-extinction culturing, which offer insight into the genetic basis for the metabolic and ecological diversity of this important group.

摘要

Pelagibaca bermudensis HTCC2601(T) 和 Maritimibacter alkaliphilus HTCC2654(T) 代表了海洋放线菌门 α 变形菌纲中具有全球重要意义的玫瑰杆菌目中的两个海洋属。本文介绍了这两种微生物的基因组序列，它们是从马尾藻海通过稀释培养法分离得到的，这为了解该重要类群的代谢和生态多样性的遗传基础提供了线索。