• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种基于几何的粒子滤波方法用于白质纤维束成像。

A geometry-based particle filtering approach to white matter tractography.

作者信息

Savadjiev Peter, Rathi Yogesh, Malcolm James G, Shenton Martha E, Westin Carl-Fredrik

机构信息

Department of Psychiatry, Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.

出版信息

Med Image Comput Comput Assist Interv. 2010;13(Pt 2):233-40. doi: 10.1007/978-3-642-15745-5_29.

DOI:10.1007/978-3-642-15745-5_29
PMID:20879320
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3081616/
Abstract

We introduce a fibre tractography framework based on a particle filter which estimates a local geometrical model of the underlying white matter tract, formulated as a 'streamline flow' using generalized helicoids. The method is not dependent on the diffusion model, and is applicable to diffusion tensor (DT) data as well as to high angular resolution reconstructions. The geometrical model allows for a robust inference of local tract geometry, which, in the context of the causal filter estimation, guides tractography through regions with partial volume effects. We validate the method on synthetic data and present results on two types in vivo data: diffusion tensors and a spherical harmonic reconstruction of the fibre orientation distribution function (fODF).

摘要

我们介绍了一种基于粒子滤波器的纤维束成像框架,该框架估计潜在白质束的局部几何模型,使用广义螺旋面将其表述为“流线流”。该方法不依赖于扩散模型,适用于扩散张量(DT)数据以及高角分辨率重建。几何模型允许对局部束几何进行稳健推断,在因果滤波器估计的背景下,该推断可引导纤维束成像穿过具有部分容积效应的区域。我们在合成数据上验证了该方法,并展示了在两种体内数据类型上的结果:扩散张量和纤维取向分布函数(fODF)的球谐重建。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/71e4669736f7/nihms-247447-f0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/313f69dce803/nihms-247447-f0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/23ee25a161b3/nihms-247447-f0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/09dd46c100f9/nihms-247447-f0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/71e4669736f7/nihms-247447-f0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/313f69dce803/nihms-247447-f0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/23ee25a161b3/nihms-247447-f0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/09dd46c100f9/nihms-247447-f0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8f71/3081616/71e4669736f7/nihms-247447-f0004.jpg

相似文献

1
A geometry-based particle filtering approach to white matter tractography.一种基于几何的粒子滤波方法用于白质纤维束成像。
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2010;13(Pt 2):233-40. doi: 10.1007/978-3-642-15745-5_29.
2
Tractometer: towards validation of tractography pipelines.束径仪:用于追踪技术管道的验证。
Med Image Anal. 2013 Oct;17(7):844-57. doi: 10.1016/j.media.2013.03.009. Epub 2013 Apr 25.
3
Beyond crossing fibers: tractography exploiting sub-voxel fibre dispersion and neighbourhood structure.超越交叉纤维:利用亚体素纤维分散和邻域结构的纤维束成像
Inf Process Med Imaging. 2013;23:402-13. doi: 10.1007/978-3-642-38868-2_34.
4
Recursive calibration of the fiber response function for spherical deconvolution of diffusion MRI data.递归标定纤维响应函数,用于扩散 MRI 数据的球谐反卷积。
Neuroimage. 2014 Feb 1;86:67-80. doi: 10.1016/j.neuroimage.2013.07.067. Epub 2013 Aug 5.
5
Local white matter geometry indices from diffusion tensor gradients.来自扩散张量梯度的局部白质几何指数。
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2009;12(Pt 1):345-52. doi: 10.1007/978-3-642-04268-3_43.
6
A polynomial approach for maxima extraction and its application to tractography in HARDI.一种用于最大值提取的多项式方法及其在高角分辨率扩散成像纤维束成像中的应用。
Inf Process Med Imaging. 2011;22:723-34. doi: 10.1007/978-3-642-22092-0_59.
7
Two-tensor tractography using a constrained filter.使用约束滤波器的双张量纤维束成像
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2009;12(Pt 1):894-902. doi: 10.1007/978-3-642-04268-3_110.
8
Belief propagation based segmentation of white matter tracts in DTI.基于信念传播的扩散张量成像中白质纤维束分割
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2009;12(Pt 1):943-50. doi: 10.1007/978-3-642-04268-3_116.
9
Tractography via the ensemble average propagator in diffusion MRI.扩散磁共振成像中基于总体平均传播子的纤维束成像
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2012;15(Pt 2):339-46. doi: 10.1007/978-3-642-33418-4_42.
10
Unbiased groupwise registration of white matter tractography.白质纤维束成像的无偏组内配准
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2012;15(Pt 3):123-30. doi: 10.1007/978-3-642-33454-2_16.

引用本文的文献

1
Parallel Transport Tractography.并行传输束追踪技术。
IEEE Trans Med Imaging. 2021 Feb;40(2):635-647. doi: 10.1109/TMI.2020.3034038. Epub 2021 Feb 2.
2
Tracking and validation techniques for topographically organized tractography.拓扑组织束追踪的跟踪和验证技术。
Neuroimage. 2018 Nov 1;181:64-84. doi: 10.1016/j.neuroimage.2018.06.071. Epub 2018 Jul 2.
3
A NOVEL INTRINSIC UNSCENTED KALMAN FILTER FOR TRACTOGRAPHY FROM HARDI*.一种用于基于高分辨率扩散成像的纤维束成像的新型内在无迹卡尔曼滤波器*

本文引用的文献

1
A filtered approach to neural tractography using the Watson directional function.基于 Watson 方向函数的神经束追踪滤波方法。
Med Image Anal. 2010 Feb;14(1):58-69. doi: 10.1016/j.media.2009.10.003. Epub 2009 Oct 24.
2
Streamline flows for white matter fibre pathway segmentation in diffusion MRI.
Med Image Comput Comput Assist Interv. 2008;11(Pt 1):135-43. doi: 10.1007/978-3-540-85988-8_17.
3
Probabilistic white matter fiber tracking using particle filtering and von Mises-Fisher sampling.使用粒子滤波和冯·米塞斯-费舍尔采样的概率性白质纤维追踪
Proc IEEE Int Symp Biomed Imaging. 2012 Dec 31;2012:534-537. doi: 10.1109/ISBI.2012.6235603.
Med Image Anal. 2009 Feb;13(1):5-18. doi: 10.1016/j.media.2008.05.001. Epub 2008 Jun 5.
4
Regularized, fast, and robust analytical Q-ball imaging.正则化、快速且稳健的解析Q球成像。
Magn Reson Med. 2007 Sep;58(3):497-510. doi: 10.1002/mrm.21277.
5
Parametric spherical deconvolution: inferring anatomical connectivity using diffusion MR imaging.参数化球面去卷积:利用扩散磁共振成像推断解剖连接性
Neuroimage. 2007 Aug 15;37(2):474-88. doi: 10.1016/j.neuroimage.2007.05.012. Epub 2007 May 18.
6
Probabilistic anatomical connectivity derived from the microscopic persistent angular structure of cerebral tissue.从脑组织微观持久角结构得出的概率性解剖连接性。
Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2005 May 29;360(1457):893-902. doi: 10.1098/rstb.2005.1639.
7
White matter tractography using diffusion tensor deflection.使用扩散张量偏转的白质纤维束成像
Hum Brain Mapp. 2003 Apr;18(4):306-21. doi: 10.1002/hbm.10102.
8
Three-dimensional tracking of axonal projections in the brain by magnetic resonance imaging.通过磁共振成像对大脑中轴突投射进行三维追踪。
Ann Neurol. 1999 Feb;45(2):265-9. doi: 10.1002/1531-8249(199902)45:2<265::aid-ana21>3.0.co;2-3.