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大肠杆菌DNA序列汇编（1990年更新）

Compilation of DNA sequences of Escherichia coli (update 1990).

作者信息

Kröger M, Wahl R, Rice P

机构信息

Institut für Mikrobiologie und Molekularbiologie, Justus-Liebig-Universität Giessen, FRG.

出版信息

Nucleic Acids Res. 1990 Apr 25;18 Suppl(Suppl):2549-87. doi: 10.1093/nar/18.suppl.2549.

DOI:10.1093/nar/18.suppl.2549
PMID:2185457
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC331880/
Abstract

We have compiled the DNA sequence data for E.coli available from the GENBANK and EMBL data libraries and over a period of several years independently from the literature. This is the second listing replacing and increasing the former listing roughly by one third. After deletion of all detected overlaps a total of 1 248 696 individual bp is found to be determined till the beginning of 1990. This corresponds to a total of 26.46% of the entire E. coli chromosome consisting of about 4,720 kbp. This number may actually be higher by some extra 2% derived from the sequence of lysogenic bacteriophage lambda and various insertion sequences. This compilation is now available in machine readable form from the EMBL data library.

摘要

我们从GENBANK和EMBL数据库中搜集了多年来独立于文献的大肠杆菌DNA序列数据。这是第二次列表，取代了之前的列表并使其数量大致增加了三分之一。在删除所有检测到的重叠部分后，到1990年初共确定了1248696个单独的碱基对。这相当于整个大肠杆菌染色体（约4720kbp）的26.46%。实际上，这个数字可能还会因溶原性噬菌体λ和各种插入序列的序列而高出约2%。这个汇编现在可以从EMBL数据库以机器可读的形式获取。

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