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相似文献

1
Roles of chromatin insulator proteins in higher-order chromatin organization and transcription regulation.染色质绝缘子蛋白在高级染色质组织和转录调控中的作用。
Nucleus. 2011 Sep-Oct;2(5):358-69. doi: 10.4161/nucl.2.5.17860. Epub 2011 Sep 1.
2
Drosophila CTCF tandemly aligns with other insulator proteins at the borders of H3K27me3 domains.果蝇 CTCF 串联排列与其他绝缘子蛋白在 H3K27me3 结构域的边界处。
Genome Res. 2012 Nov;22(11):2176-87. doi: 10.1101/gr.136788.111. Epub 2012 Jun 21.
3
Chromatin insulators specifically associate with different levels of higher-order chromatin organization in Drosophila.染色质绝缘子在果蝇中与不同水平的高阶染色质组织特异性相关。
Chromosoma. 2010 Apr;119(2):177-94. doi: 10.1007/s00412-009-0246-0. Epub 2009 Dec 23.
4
The chromosomal association/dissociation of the chromatin insulator protein Cp190 of Drosophila melanogaster is mediated by the BTB/POZ domain and two acidic regions.果蝇染色质绝缘子蛋白Cp190的染色体缔合/解离由BTB/POZ结构域和两个酸性区域介导。
BMC Cell Biol. 2010 Dec 31;11:101. doi: 10.1186/1471-2121-11-101.
5
Chromatin immunoprecipitation indirect peaks highlight long-range interactions of insulator proteins and Pol II pausing.染色质免疫沉淀间接峰突出了绝缘子蛋白和 Pol II 暂停的长距离相互作用。
Mol Cell. 2014 Feb 20;53(4):672-81. doi: 10.1016/j.molcel.2013.12.029. Epub 2014 Jan 30.
6
Genome-wide localization of exosome components to active promoters and chromatin insulators in Drosophila.外泌体成分在果蝇活性启动子和染色质绝缘子上的全基因组定位。
Nucleic Acids Res. 2013 Mar 1;41(5):2963-80. doi: 10.1093/nar/gkt037. Epub 2013 Jan 28.
7
SUMM4 complex couples insulator function and DNA replication control.SUM4 复合物将绝缘子功能和 DNA 复制控制联系起来。
Elife. 2022 Dec 2;11:e81828. doi: 10.7554/eLife.81828.
8
The Drosophila boundary element-associated factors BEAF-32A and BEAF-32B affect chromatin structure.果蝇边界元件相关因子BEAF - 32A和BEAF - 32B影响染色质结构。
Genetics. 2006 Jul;173(3):1365-75. doi: 10.1534/genetics.106.056002. Epub 2006 Apr 30.
9
Coordinated control of dCTCF and gypsy chromatin insulators in Drosophila.果蝇中dCTCF与gypsy染色质绝缘子的协同调控
Mol Cell. 2007 Dec 14;28(5):761-72. doi: 10.1016/j.molcel.2007.09.024.
10
The zinc-finger protein CLAMP promotes chromatin insulator function in .锌指蛋白 CLAMP 促进. 中的染色质绝缘子功能。
J Cell Sci. 2019 Mar 8;132(5):jcs226092. doi: 10.1242/jcs.226092.

引用本文的文献

1
Small DNA elements can act as both insulators and silencers in plants.小DNA元件在植物中既可以充当绝缘子,也可以充当沉默子。
Plant Cell. 2025 Jun 4;37(6). doi: 10.1093/plcell/koaf084.
2
Small DNA elements that act as both insulators and silencers in plants.在植物中兼具绝缘子和沉默子功能的小DNA元件。
bioRxiv. 2024 Sep 19:2024.09.13.612883. doi: 10.1101/2024.09.13.612883.
3
3D chromatin interactions involving Drosophila insulators are infrequent but preferential and arise before TADs and transcription.涉及果蝇绝缘子的三维染色质相互作用很少见,但具有偏好性,且发生在拓扑相关结构域(TADs)和转录之前。
Nat Commun. 2023 Oct 21;14(1):6678. doi: 10.1038/s41467-023-42485-y.
4
The Impact of Space and Time on the Functional Output of the Genome.时空对基因组功能输出的影响。
Cold Spring Harb Perspect Biol. 2022 May 17;14(4):a040378. doi: 10.1101/cshperspect.a040378.
5
Insulator-based loops mediate the spreading of H3K27me3 over distant micro-domains repressing euchromatin genes.基于绝缘子的环介导H3K27me3在远距离微结构域上的扩散,从而抑制常染色质基因。
Genome Biol. 2020 Aug 3;21(1):193. doi: 10.1186/s13059-020-02106-z.
6
The Integrity of piRNA Clusters is Abolished by Insulators in the Germline.PiRNA 簇的完整性被生殖系中的绝缘子废除。
Genes (Basel). 2019 Mar 11;10(3):209. doi: 10.3390/genes10030209.
7
Dense neural networks for predicting chromatin conformation.用于预测染色质构象的密集神经网络。
BMC Bioinformatics. 2018 Oct 11;19(1):372. doi: 10.1186/s12859-018-2286-z.
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DIVERSITY in binding, regulation, and evolution revealed from high-throughput ChIP.高通量 ChIP 揭示的结合、调控和进化多样性。
PLoS Comput Biol. 2018 Apr 23;14(4):e1006090. doi: 10.1371/journal.pcbi.1006090. eCollection 2018 Apr.
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A maximum-entropy model for predicting chromatin contacts.一种用于预测染色质接触的最大熵模型。
PLoS Comput Biol. 2018 Feb 5;14(2):e1005956. doi: 10.1371/journal.pcbi.1005956. eCollection 2018 Feb.
10
Boundaries of loop domains (insulators): Determinants of chromosome form and function in multicellular eukaryotes.环状结构域(绝缘子)的边界:多细胞真核生物中染色体形态和功能的决定因素
Bioessays. 2017 Mar;39(3). doi: 10.1002/bies.201600233. Epub 2017 Jan 30.

本文引用的文献

1
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Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jun 7;108(23):9566-71. doi: 10.1073/pnas.1019391108. Epub 2011 May 23.
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Nat Struct Mol Biol. 2011 Jun;18(6):708-14. doi: 10.1038/nsmb.2059. Epub 2011 May 22.
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Long-range chromatin interactions at the mouse Igf2/H19 locus reveal a novel paternally expressed long non-coding RNA.在小鼠 Igf2/H19 基因座的长程染色质相互作用揭示了一种新型的父系表达的长非编码 RNA。
Nucleic Acids Res. 2011 Aug;39(14):5893-906. doi: 10.1093/nar/gkr209. Epub 2011 Apr 7.
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Mol Cell Biol. 2011 Jun;31(11):2174-83. doi: 10.1128/MCB.05093-11. Epub 2011 Mar 28.
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Curr Opin Genet Dev. 2011 Apr;21(2):199-206. doi: 10.1016/j.gde.2011.01.018. Epub 2011 Feb 14.
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10
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Genes Dev. 2010 Dec 15;24(24):2812-22. doi: 10.1101/gad.608210.

染色质绝缘子蛋白在高级染色质组织和转录调控中的作用。

Roles of chromatin insulator proteins in higher-order chromatin organization and transcription regulation.

机构信息

Centre de Biochimie Structurale, Centre National de la Recherche Scientifique and Institut National de la Santé et la Recherche Médicale, 29 rue de Navacelles, 34090, Montpellier, France.

出版信息

Nucleus. 2011 Sep-Oct;2(5):358-69. doi: 10.4161/nucl.2.5.17860. Epub 2011 Sep 1.

DOI:10.4161/nucl.2.5.17860
PMID:21983085
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3796873/
Abstract

Eukaryotic chromosomes are condensed into several hierarchical levels of complexity: DNA is wrapped around core histones to form nucleosomes, nucleosomes form a higher-order structure called chromatin, and chromatin is subsequently compartmentalized in part by the combination of multiple specific or unspecific long-range contacts. The conformation of chromatin at these three levels greatly influences DNA metabolism and transcription. One class of chromatin regulatory proteins called insulator factors may organize chromatin both locally, by setting up barriers between heterochromatin and euchromatin, and globally by establishing platforms for long-range interactions. Here, we review recent data revealing a global role of insulator proteins in the regulation of transcription through the formation of clusters of long-range interactions that impact different levels of chromatin organization.

摘要

真核染色体浓缩成几个层次的复杂性

DNA 缠绕在核心组蛋白周围形成核小体,核小体形成称为染色质的高级结构,染色质随后通过多种特定或非特定长距离接触的组合部分分隔。这三个层次上的染色质构象极大地影响了 DNA 代谢和转录。一类称为绝缘子因子的染色质调节蛋白可以通过在异染色质和常染色质之间建立障碍来局部组织染色质,也可以通过建立长距离相互作用的平台来全局组织染色质。在这里,我们回顾了最近的数据,这些数据揭示了绝缘子蛋白在通过形成影响不同层次染色质组织的长距离相互作用簇来调节转录方面的全局作用。