pymzML--用于质谱数据高通量生物信息学的 Python 模块。
pymzML--Python module for high-throughput bioinformatics on mass spectrometry data.
机构信息
Institute of Plant Biology and Biotechnology, University of Muenster, 48143 Muenster, Germany.
出版信息
Bioinformatics. 2012 Apr 1;28(7):1052-3. doi: 10.1093/bioinformatics/bts066. Epub 2012 Feb 2.
SUMMARY
pymzML is an extension to Python that offers (i) an easy access to mass spectrometry (MS) data that allows the rapid development of tools, (ii) a very fast parser for mzML data, the standard data format in MS and (iii) a set of functions to compare or handle spectra.
AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION
pymzML requires Python2.6.5+ and is fully compatible with Python3. The module is freely available on http://pymzml.github.com or pypi, is published under LGPL license and requires no additional modules to be installed.
CONTACT
摘要
pymzML 是 Python 的一个扩展，提供了（i）对质谱（MS）数据的便捷访问，支持快速开发工具，（ii）对 mzML 数据的快速解析器，这是 MS 中的标准数据格式，以及（iii）一组用于比较或处理光谱的函数。
可用性和实现
pymzML 需要 Python2.6.5+，并与 Python3 完全兼容。该模块可在 http://pymzml.github.com 或 pypi 上免费获得，根据 LGPL 许可证发布，无需安装其他模块。
Zotero 插件