• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

用分子动力学探测溶菌酶-碳纳米管杂化物的结构。

Probing the structure of lysozyme-carbon-nanotube hybrids with molecular dynamics.

机构信息

Dipartimento di Chimica G. Ciamician, Università di Bologna, V. F. Selmi 2, 40126 Bologna, Italy.

出版信息

Chemistry. 2012 Apr 2;18(14):4308-13. doi: 10.1002/chem.201102703. Epub 2012 Feb 22.

DOI:10.1002/chem.201102703
PMID:22354722
Abstract

Lysozyme has been successfully used to solvate carbon nanotubes (CNT). Extensive molecular dynamics simulations show that 1) a favorite site of adsorption exists, 2) the protein-tube interaction region is located far from the active site, 3) two protein helices act as a tweezer that grips the nanotube, 4) a localized protein re-arrangement hides the tube from the solvent, and 5) aminic and amidic moieties of lysozyme behave similarly to surfactants in the solvation of the tube.

摘要

溶菌酶已成功用于溶解碳纳米管(CNT)。广泛的分子动力学模拟表明:1)存在一个首选的吸附位置;2)蛋白质-管相互作用区域位于远离活性部位的位置;3)两个蛋白质螺旋充当夹子,夹住纳米管;4)局部的蛋白质重排将管隐藏在溶剂之外;5)溶菌酶的氨基和酰胺部分在管的溶解中表现得类似于表面活性剂。

相似文献

1
Probing the structure of lysozyme-carbon-nanotube hybrids with molecular dynamics.用分子动力学探测溶菌酶-碳纳米管杂化物的结构。
Chemistry. 2012 Apr 2;18(14):4308-13. doi: 10.1002/chem.201102703. Epub 2012 Feb 22.
2
Sodium hexadecyl sulfate as an interfacial substance adjusting the adsorption of a protein on carbon nanotubes.十六烷基硫酸钠作为一种界面物质,调节蛋白质在碳纳米管上的吸附。
ACS Appl Mater Interfaces. 2014 Sep 10;6(17):15132-9. doi: 10.1021/am5032715. Epub 2014 Aug 21.
3
Interactions between single-walled carbon nanotubes and lysozyme.单壁碳纳米管与溶菌酶的相互作用。
J Colloid Interface Sci. 2011 Mar 15;355(2):342-7. doi: 10.1016/j.jcis.2010.12.026. Epub 2010 Dec 15.
4
Polar solvation dynamics of lysozyme from molecular dynamics studies.从分子动力学研究看溶菌酶的极性溶剂化动力学。
J Chem Phys. 2012 May 14;136(18):185102. doi: 10.1063/1.4712036.
5
Role of arginine in mediating protein-carbon nanotube interactions.精氨酸在介导蛋白质与碳纳米管相互作用中的作用。
Langmuir. 2015 Feb 10;31(5):1683-92. doi: 10.1021/la5043553. Epub 2015 Jan 28.
6
Effect of cosolvents on nano-confined water: a molecular dynamics study.共溶剂对纳米受限水的影响:分子动力学研究。
Nanoscale. 2012 Apr 28;4(9):2931-6. doi: 10.1039/c2nr30070b. Epub 2012 Mar 22.
7
Wrapping nanotubes with micelles, hemimicelles, and cylindrical micelles.用胶束、半胶束和圆柱状胶束包裹纳米管。
Small. 2009 Oct;5(19):2191-8. doi: 10.1002/smll.200900528.
8
Noncovalent interactions of molecules with single walled carbon nanotubes.分子与单壁碳纳米管的非共价相互作用。
Chem Soc Rev. 2006 Jul;35(7):637-59. doi: 10.1039/b507451g. Epub 2006 Mar 23.
9
A multiscale simulation study of carbon nanotube interactions with designed amphiphilic peptide helices.多尺度模拟研究碳纳米管与设计的两亲性肽螺旋的相互作用。
Nanoscale. 2010 Jun;2(6):967-75. doi: 10.1039/b9nr00355j. Epub 2010 Apr 9.
10
Stabilization of aqueous carbon nanotube dispersions using surfactants: insights from molecular dynamics simulations.使用表面活性剂稳定水基碳纳米管分散体:分子动力学模拟的见解。
ACS Nano. 2010 Dec 28;4(12):7193-204. doi: 10.1021/nn101929f. Epub 2010 Dec 3.

引用本文的文献

1
Potential functional changes in native lysozyme induced by carbon nanotubes studied by molecular dynamics simulations.通过分子动力学模拟研究碳纳米管诱导的天然溶菌酶的潜在功能变化。
Sci Rep. 2025 Apr 4;15(1):11593. doi: 10.1038/s41598-025-96435-3.
2
An Overview of Crosslinked Enzyme Aggregates: Concept of Development and Trends of Applications.交联酶聚集体概述:发展概念与应用趋势。
Appl Biochem Biotechnol. 2024 Sep;196(9):5711-5739. doi: 10.1007/s12010-023-04809-y. Epub 2024 Jan 5.
3
Enzyme immobilization studied through molecular dynamic simulations.
通过分子动力学模拟研究酶的固定化。
Front Bioeng Biotechnol. 2023 Jun 8;11:1200293. doi: 10.3389/fbioe.2023.1200293. eCollection 2023.
4
Exploiting Blood Transport Proteins as Carborane Supramolecular Vehicles for Boron Neutron Capture Therapy.利用血液转运蛋白作为用于硼中子俘获疗法的碳硼烷超分子载体。
Nanomaterials (Basel). 2023 May 31;13(11):1770. doi: 10.3390/nano13111770.
5
Dissecting the Interactions between Chlorin e6 and Human Serum Albumin.解析氯乙啶 6 与人血清白蛋白的相互作用。
Molecules. 2023 Mar 3;28(5):2348. doi: 10.3390/molecules28052348.
6
Computational Investigation of Chirality-Based Separation of Carbon Nanotubes Using Tripeptide Library.基于三肽库的手性分离碳纳米管的计算研究。
Biomolecules. 2023 Jan 13;13(1):175. doi: 10.3390/biom13010175.
7
In Silico Analysis of Nanoplastics' and β-amyloid Fibrils' Interactions.纳米塑料与β-淀粉样纤维相互作用的计算机分析。
Molecules. 2023 Jan 2;28(1):388. doi: 10.3390/molecules28010388.
8
Interfacial Liquid Water on Graphite, Graphene, and 2D Materials.石墨、石墨烯和二维材料的界面液态水。
ACS Nano. 2023 Jan 10;17(1):51-69. doi: 10.1021/acsnano.2c10215. Epub 2022 Dec 12.
9
Boron nitride nanotubes enhance mechanical properties of fibers from nanotube/polyvinyl alcohol dispersions.氮化硼纳米管增强了纳米管/聚乙烯醇分散体中纤维的机械性能。
Nanoscale Adv. 2021 Oct 29;4(1):77-86. doi: 10.1039/d1na00677k. eCollection 2021 Dec 21.
10
Dissecting the Supramolecular Dispersion of Fullerenes by Proteins/Peptides: Amino Acid Ranking and Driving Forces for Binding to C.解析蛋白质/肽对富勒烯的超分子分散作用:与 C. 结合的氨基酸排序和驱动力。
Int J Mol Sci. 2021 Oct 26;22(21):11567. doi: 10.3390/ijms222111567.