• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

真菌菌落和群落建模:挑战与机遇。

Modelling fungal colonies and communities: challenges and opportunities.

机构信息

SIMBIOS Centre, University of Abertay Dundee, DD1 1HG, Dundee Scotland UK;

出版信息

IMA Fungus. 2010 Dec;1(2):155-9. doi: 10.5598/imafungus.2010.01.02.07. Epub 2010 Nov 18.

DOI:10.5598/imafungus.2010.01.02.07
PMID:22679574
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3348771/
Abstract

This contribution, based on a Special Interest Group session held during IMC9, focuses on physiological based models of filamentous fungal colony growth and interactions. Fungi are known to be an important component of ecosystems, in terms of colony dynamics and interactions within and between trophic levels. We outline some of the essential components necessary to develop a fungal ecology: a mechanistic model of fungal colony growth and interactions, where observed behaviour can be linked to underlying function; a model of how fungi can cooperate at larger scales; and novel techniques for both exploring quantitatively the scales at which fungi operate; and addressing the computational challenges arising from this highly detailed quantification. We also propose a novel application area for fungi which may provide alternate routes for supporting scientific study of colony behaviour. This synthesis offers new potential to explore fungal community dynamics and the impact on ecosystem functioning.

摘要

本研究以 IMC9 期间的一个特别兴趣小组会议为基础,重点介绍丝状真菌菌落生长和相互作用的生理基础模型。从菌落动态以及营养层内和之间的相互作用角度来看,真菌是生态系统的重要组成部分。我们概述了开发真菌生态学所需的一些基本组成部分:真菌菌落生长和相互作用的机制模型,其中可以将观察到的行为与潜在功能联系起来;真菌在更大尺度上如何合作的模型;以及用于定量探索真菌作用尺度和解决由此产生的高度详细量化的计算挑战的新技术。我们还为真菌提出了一个新的应用领域,这可能为支持对菌落行为的科学研究提供替代途径。这种综合为探索真菌群落动态及其对生态系统功能的影响提供了新的潜力。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5285/3348771/0a1efb346777/ima-1-2-155-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5285/3348771/ffddca72d7a7/ima-1-2-155-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5285/3348771/0a1efb346777/ima-1-2-155-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5285/3348771/ffddca72d7a7/ima-1-2-155-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/5285/3348771/0a1efb346777/ima-1-2-155-g002.jpg

相似文献

1
Modelling fungal colonies and communities: challenges and opportunities.真菌菌落和群落建模:挑战与机遇。
IMA Fungus. 2010 Dec;1(2):155-9. doi: 10.5598/imafungus.2010.01.02.07. Epub 2010 Nov 18.
2
Aligning spatial ecological theory with the study of clonal organisms: the case of fungal coexistence.将空间生态理论与克隆生物研究相结合:以真菌共存为例。
Biol Rev Camb Philos Soc. 2024 Dec;99(6):2211-2233. doi: 10.1111/brv.13119. Epub 2024 Jul 29.
3
Dynamics and drivers of fungal communities in a multipartite ant-plant association.多部分蚁-植物共生体中真菌群落的动态和驱动因素。
BMC Biol. 2024 May 14;22(1):112. doi: 10.1186/s12915-024-01897-y.
4
5
Erratum: High-Throughput Identification of Resistance to Pseudomonas syringae pv. Tomato in Tomato using Seedling Flood Assay.勘误:利用幼苗浸没法高通量鉴定番茄对丁香假单胞菌 pv.番茄的抗性。
J Vis Exp. 2023 Oct 18(200). doi: 10.3791/6576.
6
Macromolecular crowding: chemistry and physics meet biology (Ascona, Switzerland, 10-14 June 2012).大分子拥挤现象:化学与物理邂逅生物学(瑞士阿斯科纳,2012年6月10日至14日)
Phys Biol. 2013 Aug;10(4):040301. doi: 10.1088/1478-3975/10/4/040301. Epub 2013 Aug 2.
7
Successional theories.演替理论。
Biol Rev Camb Philos Soc. 2023 Dec;98(6):2049-2077. doi: 10.1111/brv.12995. Epub 2023 Jul 16.
8
Assembly processes lead to divergent soil fungal communities within and among 12 forest ecosystems along a latitudinal gradient.组装过程导致了在纬度梯度上的 12 个森林生态系统内和之间的土壤真菌群落的分歧。
New Phytol. 2021 Aug;231(3):1183-1194. doi: 10.1111/nph.17457. Epub 2021 Jun 6.
9
Soil Bacterial and Fungal Communities Show Distinct Recovery Patterns during Forest Ecosystem Restoration.土壤细菌和真菌群落在森林生态系统恢复过程中呈现出不同的恢复模式。
Appl Environ Microbiol. 2017 Jun 30;83(14). doi: 10.1128/AEM.00966-17. Print 2017 Jul 15.
10
Untangling the fungal niche: the trait-based approach.解析真菌生态位:基于性状的方法。
Front Microbiol. 2014 Oct 31;5:579. doi: 10.3389/fmicb.2014.00579. eCollection 2014.

引用本文的文献

1
The Mycelium as a Network.菌丝体作为网络。
Microbiol Spectr. 2017 May;5(3). doi: 10.1128/microbiolspec.FUNK-0033-2017.

本文引用的文献

1
THE INFLUENCE OF ROOT GROWTH AND INOCULUM DENSITY ON THE DYNAMICS OF ROOT DISEASE EPIDEMICS: THEORETICAL ANALYSIS.根系生长和接种体密度对根病流行动态的影响:理论分析
New Phytol. 1987 Oct;107(2):459-478. doi: 10.1111/j.1469-8137.1987.tb00197.x.
2
Fungal colonization in soils with different management histories: modeling growth in three-dimensional pore volumes.不同管理历史土壤中的真菌定殖:在三维孔隙体积中模拟生长。
Ecol Appl. 2011 Jun;21(4):1202-10. doi: 10.1890/10-0525.1.
3
Three-dimensional x-ray imaging and analysis of fungi on and in wood.
木材表面及内部真菌的三维X射线成像与分析
Microsc Microanal. 2009 Oct;15(5):395-402. doi: 10.1017/S1431927609990419. Epub 2009 Aug 27.
4
Bronnikov-aided correction for x-ray computed tomography.用于X射线计算机断层扫描的布龙尼科夫辅助校正
J Opt Soc Am A Opt Image Sci Vis. 2009 Apr;26(4):890-4. doi: 10.1364/josaa.26.000890.
5
Mathematical models of plant-soil interaction.植物-土壤相互作用的数学模型。
Philos Trans A Math Phys Eng Sci. 2008 Dec 28;366(1885):4597-611. doi: 10.1098/rsta.2008.0198.
6
Modelling interactions in fungi.真菌中的相互作用建模。
J R Soc Interface. 2008 Jun 6;5(23):603-15. doi: 10.1098/rsif.2007.1210.
7
Biological solutions to transport network design.运输网络设计的生物解决方案。
Proc Biol Sci. 2007 Sep 22;274(1623):2307-15. doi: 10.1098/rspb.2007.0459.
8
Three-way interactions among mutualistic mycorrhizal fungi, plants, and plant enemies: hypotheses and synthesis.互惠菌根真菌、植物和植物天敌之间的三方相互作用:假说与综合
Am Nat. 2006 Feb;167(2):141-52. doi: 10.1086/499379. Epub 2005 Dec 19.
9
Parasitic plants indirectly regulate below-ground properties in grassland ecosystems.寄生植物间接调节草原生态系统的地下特性。
Nature. 2006 Feb 23;439(7079):969-72. doi: 10.1038/nature04197.
10
Biomass recycling and the origin of phenotype in fungal mycelia.真菌菌丝体中的生物质循环利用与表型起源
Proc Biol Sci. 2005 Aug 22;272(1573):1727-34. doi: 10.1098/rspb.2005.3150.