• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

合成并评价一种对多巴胺具有选择性的荧光探针衍生检测试剂（Pup 试剂），多巴胺是结核分枝杆菌的一个潜在药物靶点。

Synthesis and evaluation of a selective fluorogenic Pup derived assay reagent for Dop, a potential drug target in Mycobacterium tuberculosis.

机构信息

Division of Cell Biology, Netherlands Cancer Institute, Plesmanlaan 121, 1066 CX Amsterdam, The Netherlands.

出版信息

Chembiochem. 2012 Sep 24;13(14):2056-60. doi: 10.1002/cbic.201200460. Epub 2012 Aug 24.

DOI:10.1002/cbic.201200460
PMID:22927162
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3474595/
Abstract

A litter of pups: The synthesis and in vitro evaluation of new Pup-based fluorogenic substrates for Dop, the mycobacterial depupylase, are described. A full-length Pup-amidomethylcoumarin conjugate as well as an amino-terminus-truncated analogue exhibited high sensitivity and specificity towards hydrolysis by Dop. The substrates developed here might find application as high-throughput screening assay reagents for the identification of Dop inhibitors.

摘要

一窝幼崽

描述了新的基于 Pup 的荧光底物的合成和体外评估，用于 Dop，即分枝杆菌脱 pupylase。全长 Pup-氨甲基香豆素缀合物以及氨基末端截断类似物对 Dop 水解表现出高灵敏度和特异性。这里开发的底物可能会作为高通量筛选测定试剂，用于鉴定 Dop 抑制剂。

相似文献

1
Synthesis and evaluation of a selective fluorogenic Pup derived assay reagent for Dop, a potential drug target in Mycobacterium tuberculosis.合成并评价一种对多巴胺具有选择性的荧光探针衍生检测试剂（Pup 试剂），多巴胺是结核分枝杆菌的一个潜在药物靶点。
Chembiochem. 2012 Sep 24;13(14):2056-60. doi: 10.1002/cbic.201200460. Epub 2012 Aug 24.
2
Molecular analysis of the prokaryotic ubiquitin-like protein (Pup) conjugation pathway in Mycobacterium tuberculosis.结核分枝杆菌原核泛素样蛋白（Pup）连接途径的分子分析。
Mol Microbiol. 2010 Sep;77(5):1123-35. doi: 10.1111/j.1365-2958.2010.07276.x.
3
Development of Tyrphostin Analogues to Study Inhibition of the Mycobacterium tuberculosis Pup Proteasome System*.研究结核分枝杆菌 Pup 蛋白酶体系统抑制作用的 Tyrphostin 类似物的开发*。
Chembiochem. 2021 Nov 3;22(21):3082-3089. doi: 10.1002/cbic.202100333. Epub 2021 Sep 12.
4
Activity of the mycobacterial proteasomal ATPase Mpa is reversibly regulated by pupylation.分枝杆菌蛋白酶体 ATP 酶 Mpa 的活性可被多泛素化作用可逆调节。
J Biol Chem. 2012 Mar 9;287(11):7907-14. doi: 10.1074/jbc.M111.331124. Epub 2011 Dec 30.
5
Dop functions as a depupylase in the prokaryotic ubiquitin-like modification pathway.Dop 在原核泛素样修饰途径中充当脱泛素酶。
EMBO Rep. 2010 Oct;11(10):791-7. doi: 10.1038/embor.2010.119. Epub 2010 Aug 27.
6
Mycobacterium tuberculosis prokaryotic ubiquitin-like protein-deconjugating enzyme is an unusual aspartate amidase.结核分枝杆菌原核泛素样蛋白去连接酶是一种不寻常的天冬氨酸酰胺酶。
J Biol Chem. 2012 Oct 26;287(44):37522-9. doi: 10.1074/jbc.M112.384784. Epub 2012 Aug 31.
7
Proteasome Accessory Factor A (PafA) Can Transfer Prokaryotic Ubiquitin-Like Protein (Pup) between Substrates.蛋白酶体辅助因子A（PafA）可在底物之间转移原核类泛素蛋白（Pup）。
mBio. 2017 Feb 21;8(1):e00122-17. doi: 10.1128/mBio.00122-17.
8
"Depupylation" of prokaryotic ubiquitin-like protein from mycobacterial proteasome substrates.原核泛素样蛋白的去泛素化作用，来自分枝杆菌蛋白酶体底物。
Mol Cell. 2010 Sep 10;39(5):821-7. doi: 10.1016/j.molcel.2010.07.019. Epub 2010 Aug 12.
9
Structures of prokaryotic ubiquitin-like protein Pup in complex with depupylase Dop reveal the mechanism of catalytic phosphate formation.原核泛素样蛋白 Pup 与去泛素酶 Dop 复合物的结构揭示了催化磷酸形成的机制。
Nat Commun. 2021 Nov 17;12(1):6635. doi: 10.1038/s41467-021-26848-x.
10
A conserved loop sequence of the proteasome system depupylase Dop regulates substrate selectivity in Mycobacterium tuberculosis.蛋白酶体系统去泛素化酶 Dop 的保守环序列调节结核分枝杆菌中的底物选择性。
J Biol Chem. 2022 Oct;298(10):102478. doi: 10.1016/j.jbc.2022.102478. Epub 2022 Sep 10.

引用本文的文献

1
Development of Tyrphostin Analogues to Study Inhibition of the Mycobacterium tuberculosis Pup Proteasome System*.研究结核分枝杆菌 Pup 蛋白酶体系统抑制作用的 Tyrphostin 类似物的开发*。
Chembiochem. 2021 Nov 3;22(21):3082-3089. doi: 10.1002/cbic.202100333. Epub 2021 Sep 12.
2
Deciphering Molecular Virulence Mechanism of Mycobacterium tuberculosis Dop isopeptidase Based on Its Sequence-Structure-Function Linkage.基于结核分枝杆菌 Dop 异构酶的序列-结构-功能关系解析其分子毒力机制。
Protein J. 2020 Feb;39(1):33-45. doi: 10.1007/s10930-019-09876-x.
3
Proteasome Accessory Factor A (PafA) Can Transfer Prokaryotic Ubiquitin-Like Protein (Pup) between Substrates.

本文引用的文献

1
Ubiquitin-like protein conjugation and the ubiquitin-proteasome system as drug targets.泛素样蛋白缀合和泛素-蛋白酶体系统作为药物靶点。
Nat Rev Drug Discov. 2011 Jan;10(1):29-46. doi: 10.1038/nrd3321. Epub 2010 Dec 10.
2
Chemical synthesis of ubiquitin, ubiquitin-based probes, and diubiquitin.泛素、基于泛素的探针及双泛素的化学合成。
Angew Chem Int Ed Engl. 2010 Dec 27;49(52):10149-53. doi: 10.1002/anie.201005995.
3
Mycobacterial ubiquitin-like protein ligase PafA follows a two-step reaction pathway with a phosphorylated pup intermediate.
蛋白酶体辅助因子A（PafA）可在底物之间转移原核类泛素蛋白（Pup）。
mBio. 2017 Feb 21;8(1):e00122-17. doi: 10.1128/mBio.00122-17.
4
Bacterial Proteasomes.细菌蛋白酶体
Annu Rev Microbiol. 2015;69:109-27. doi: 10.1146/annurev-micro-091014-104201.
5
A time-resolved Förster resonance energy transfer assay to measure activity of the deamidase of the prokaryotic ubiquitin-like protein.一种用于测量原核泛素样蛋白脱酰胺酶活性的时间分辨福斯特共振能量转移测定法。
Anal Biochem. 2015 Oct 15;487:27-9. doi: 10.1016/j.ab.2015.07.003. Epub 2015 Jul 21.
6
Mycobacterium tuberculosis prokaryotic ubiquitin-like protein-deconjugating enzyme is an unusual aspartate amidase.结核分枝杆菌原核泛素样蛋白去连接酶是一种不寻常的天冬氨酸酰胺酶。
J Biol Chem. 2012 Oct 26;287(44):37522-9. doi: 10.1074/jbc.M112.384784. Epub 2012 Aug 31.
分枝杆菌泛素样蛋白连接酶 PafA 遵循一个两步反应途径，其中包括一个磷酸化的 pup 中间产物。
J Biol Chem. 2011 Feb 11;286(6):4412-9. doi: 10.1074/jbc.M110.189282. Epub 2010 Nov 16.
4
Binding-induced folding of prokaryotic ubiquitin-like protein on the Mycobacterium proteasomal ATPase targets substrates for degradation.原核类泛素蛋白在分枝杆菌蛋白酶体 ATP 酶上的结合诱导折叠，将底物靶向降解。
Nat Struct Mol Biol. 2010 Nov;17(11):1352-7. doi: 10.1038/nsmb.1918. Epub 2010 Oct 17.
5
Dop functions as a depupylase in the prokaryotic ubiquitin-like modification pathway.Dop 在原核泛素样修饰途径中充当脱泛素酶。
EMBO Rep. 2010 Oct;11(10):791-7. doi: 10.1038/embor.2010.119. Epub 2010 Aug 27.
6
The Mycobacterium tuberculosis proteasome active site threonine is essential for persistence yet dispensable for replication and resistance to nitric oxide.结核分枝杆菌蛋白酶体活性位点苏氨酸对于持续存在是必需的，但对于复制和抵抗一氧化氮是可有可无的。
PLoS Pathog. 2010 Aug 12;6(8):e1001040. doi: 10.1371/journal.ppat.1001040.
7
"Depupylation" of prokaryotic ubiquitin-like protein from mycobacterial proteasome substrates.原核泛素样蛋白的去泛素化作用，来自分枝杆菌蛋白酶体底物。
Mol Cell. 2010 Sep 10;39(5):821-7. doi: 10.1016/j.molcel.2010.07.019. Epub 2010 Aug 12.
8
Molecular analysis of the prokaryotic ubiquitin-like protein (Pup) conjugation pathway in Mycobacterium tuberculosis.结核分枝杆菌原核泛素样蛋白（Pup）连接途径的分子分析。
Mol Microbiol. 2010 Sep;77(5):1123-35. doi: 10.1111/j.1365-2958.2010.07276.x.
9
Prokaryotic ubiquitin-like protein provides a two-part degron to Mycobacterium proteasome substrates.原核生物泛素样蛋白为分枝杆菌蛋白酶体底物提供双部分降解基序。
J Bacteriol. 2010 Jun;192(11):2933-5. doi: 10.1128/JB.01639-09. Epub 2010 Mar 16.
10
The mycobacterial Mpa-proteasome unfolds and degrades pupylated substrates by engaging Pup's N-terminus.分枝杆菌 Mpa 蛋白酶体通过与 Pup 的 N 端结合来展开和降解泛素化底物。
EMBO J. 2010 Apr 7;29(7):1262-71. doi: 10.1038/emboj.2010.23. Epub 2010 Mar 4.