• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

古菌转录中的顺式调控逻辑。

Cis-regulatory logic in archaeal transcription.

机构信息

Research group of Microbiology, Vrije Universiteit Brussel, Pleinlaan 2, B-1050 Brussels, Belgium.

出版信息

Biochem Soc Trans. 2013 Feb 1;41(1):326-31. doi: 10.1042/BST20120312.

DOI:10.1042/BST20120312
PMID:23356306
Abstract

For cellular fitness and survival, gene expression levels need to be regulated in response to a wealth of cellular and environmental signals. TFs (transcription factors) execute a large part of this regulation by interacting with the basal transcription machinery at promoter regions. Archaea are characterized by a simplified eukaryote-like basal transcription machinery and bacteria-type TFs, which convert sequence information into a gene expression output according to cis-regulatory rules. In the present review, we discuss the current state of knowledge about these rules in archaeal systems, ranging from DNA-binding specificities and operator architecture to regulatory mechanisms.

摘要

为了保持细胞的健康和生存,基因表达水平需要根据大量的细胞和环境信号进行调节。转录因子(TFs)通过与启动子区域的基本转录机制相互作用,执行了这一调节的很大一部分。古菌的基本转录机制具有简化的真核生物样特征,以及细菌型 TF,它们根据顺式调控规则将序列信息转化为基因表达输出。在本综述中,我们讨论了目前关于古菌系统中这些规则的知识状况,范围从 DNA 结合特异性和操作子结构到调控机制。

相似文献

1
Cis-regulatory logic in archaeal transcription.古菌转录中的顺式调控逻辑。
Biochem Soc Trans. 2013 Feb 1;41(1):326-31. doi: 10.1042/BST20120312.
2
New insights on gene regulation in archaea.古菌基因调控的新见解。
Comput Biol Chem. 2011 Dec 14;35(6):341-6. doi: 10.1016/j.compbiolchem.2011.10.006. Epub 2011 Oct 17.
3
The basal transcription factors TBP and TFB from the mesophilic archaeon Methanosarcina mazeii: structure and conformational changes upon interaction with stress-gene promoters.嗜温古菌马氏甲烷八叠球菌的基础转录因子TBP和TFB:与应激基因启动子相互作用时的结构和构象变化
J Mol Biol. 2001 Jun 8;309(3):589-603. doi: 10.1006/jmbi.2001.4705.
4
Archaeal promoter architecture and mechanism of gene activation.古菌启动子结构和基因激活机制。
Biochem Soc Trans. 2011 Jan;39(1):99-103. doi: 10.1042/BST0390099.
5
Characterization of the Haloarcula hispanica amyH gene promoter, an archaeal promoter that confers promoter activity in Escherichia coli.嗜盐栖热放线菌amyH基因启动子的特性分析,一种能在大肠杆菌中赋予启动子活性的古菌启动子。
Gene. 2009 Aug 1;442(1-2):1-7. doi: 10.1016/j.gene.2009.04.004. Epub 2009 Apr 17.
6
Archaeal transcriptional regulation--variation on a bacterial theme?古菌转录调控——细菌模式的变体?
Trends Microbiol. 2005 Jun;13(6):262-5. doi: 10.1016/j.tim.2005.03.015.
7
Divergent transcriptional and translational signals in Archaea.古菌中不同的转录和翻译信号
Environ Microbiol. 2005 Jan;7(1):47-54. doi: 10.1111/j.1462-2920.2004.00674.x.
8
Transcription regulation in the third domain.第三域的转录调控。
Adv Appl Microbiol. 2014;89:101-33. doi: 10.1016/B978-0-12-800259-9.00003-2.
9
Archaeal transcription: making up for lost time.古菌转录:弥补失去的时间。
Biochem Soc Trans. 2013 Feb 1;41(1):356-61. doi: 10.1042/BST20120305.
10
Recent advances in the understanding of archaeal transcription.古菌转录理解的最新进展。
Curr Opin Microbiol. 2011 Jun;14(3):328-34. doi: 10.1016/j.mib.2011.04.012. Epub 2011 May 17.

引用本文的文献

1
A TrmBL2-like transcription factor mediates the growth phase-dependent expression of halolysin SptA in a concentration-dependent manner in J7-2.一种 TrmBL2 样转录因子以浓度依赖的方式介导 J7-2 中 haloysin SptA 在生长阶段依赖性表达。
Appl Environ Microbiol. 2024 Jul 24;90(7):e0074124. doi: 10.1128/aem.00741-24. Epub 2024 Jul 2.
2
'All About' Extremophiles.嗜极生物全知道
Fac Rev. 2023 Nov 7;12:27. doi: 10.12703/r/12-27. eCollection 2023.
3
TroR is the primary regulator of the iron homeostasis transcription network in the halophilic archaeon Haloferax volcanii.
在嗜盐古菌盐沼盐菌中,TroR 是铁稳态转录网络的主要调节因子。
Nucleic Acids Res. 2024 Jan 11;52(1):125-140. doi: 10.1093/nar/gkad997.
4
An archaeal transcription factor EnfR with a novel 'eighth note' fold controls hydrogen production of a hyperthermophilic archaeon Thermococcus onnurineus NA1.具有新型“八分音符”折叠结构的古菌转录因子EnfR控制嗜热古菌嗜热栖热袍菌NA1的产氢过程。
Nucleic Acids Res. 2023 Oct 13;51(18):10026-10040. doi: 10.1093/nar/gkad699.
5
Promoter-proximal elongation regulates transcription in archaea.启动子近端延伸调控古菌中的转录。
Nat Commun. 2021 Sep 17;12(1):5524. doi: 10.1038/s41467-021-25669-2.
6
Towards the Elucidation of Assimilative Operon Transcriptional Regulation in .阐明 中的同化操纵子转录调控
Genes (Basel). 2021 Apr 22;12(5):619. doi: 10.3390/genes12050619.
7
CopR, a Global Regulator of Transcription to Maintain Copper Homeostasis in .CopR,一种维持……铜稳态的转录全局调节因子 。(原文句子不完整,翻译可能会受影响,你可补充完整原文再让我翻译)
Front Microbiol. 2021 Jan 11;11:613532. doi: 10.3389/fmicb.2020.613532. eCollection 2020.
8
The biology of thermoacidophilic archaea from the order Sulfolobales.嗜热嗜酸古菌的生物学特性。来自硫磺酸杆菌目。
FEMS Microbiol Rev. 2021 Aug 17;45(4). doi: 10.1093/femsre/fuaa063.
9
Evolution of Regulated Transcription.调控转录的进化。
Cells. 2020 Jul 12;9(7):1675. doi: 10.3390/cells9071675.
10
Identification of XylR, the Activator of Arabinose/Xylose Inducible Regulon in and Its Application for Homologous Protein Expression.木糖诱导型调节子激活蛋白XylR的鉴定及其在 中的同源蛋白表达应用 (注:原文中“in ”表述不完整,可能影响准确理解,这里按字面翻译)
Front Microbiol. 2020 May 26;11:1066. doi: 10.3389/fmicb.2020.01066. eCollection 2020.