• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

RNA 聚合酶 II CTD 在拟南芥中的新兴作用。

Emerging roles for RNA polymerase II CTD in Arabidopsis.

机构信息

Department of Plant Developmental Biology, Max Planck Institute for Plant Breeding Research, D-50829 Cologne, Germany.

出版信息

Trends Plant Sci. 2013 Nov;18(11):633-43. doi: 10.1016/j.tplants.2013.07.001. Epub 2013 Jul 30.

DOI:10.1016/j.tplants.2013.07.001
PMID:23910452
Abstract

Post-translational modifications of the carboxy-terminal domain of the largest subunit of RNA polymerase II (RNAPII CTD) provide recognition marks to coordinate recruitment of numerous nuclear factors controlling transcription, cotranscriptional RNA processing, chromatin remodeling, and RNA export. Compared with the progress in yeast and mammals, deciphering the regulatory roles of position-specific combinatorial CTD modifications, the so-called CTD code, is still at an early stage in plants. In this review, we discuss some of the recent advances in understanding of the molecular mechanisms controlling the deposition and recognition of RNAPII CTD marks in plants during the transcriptional cycle and highlight some intriguing differences between regulatory components characterized in yeast, mammals, and plants.

摘要

RNA 聚合酶 II 大亚基羧基末端结构域(RNAPII CTD)的翻译后修饰为协调募集大量核因子提供了识别标记,这些核因子控制转录、共转录 RNA 加工、染色质重塑和 RNA 输出。与酵母和哺乳动物的研究进展相比,解析位置特异性组合 CTD 修饰(所谓的 CTD 密码)的调控作用在植物中仍处于早期阶段。在这篇综述中,我们讨论了在转录周期中理解控制植物中 RNAPII CTD 标记沉积和识别的分子机制的一些最新进展,并强调了在酵母、哺乳动物和植物中鉴定的调控成分之间存在一些有趣的差异。

相似文献

1
Emerging roles for RNA polymerase II CTD in Arabidopsis.RNA 聚合酶 II CTD 在拟南芥中的新兴作用。
Trends Plant Sci. 2013 Nov;18(11):633-43. doi: 10.1016/j.tplants.2013.07.001. Epub 2013 Jul 30.
2
Arabidopsis SCP1-like small phosphatases differentially dephosphorylate RNA polymerase II C-terminal domain.拟南芥 SCP1 样小磷酸酶差异去磷酸化 RNA 聚合酶 II C 末端结构域。
Biochem Biophys Res Commun. 2010 Jun 25;397(2):355-60. doi: 10.1016/j.bbrc.2010.05.130. Epub 2010 May 27.
3
Gene-specific requirement of RNA polymerase II CTD phosphorylation.RNA 聚合酶 II CTD 磷酸化的基因特异性需求。
Mol Microbiol. 2012 Jun;84(6):995-1004. doi: 10.1111/j.1365-2958.2012.08071.x. Epub 2012 May 4.
4
Arabidopsis C-terminal domain phosphatase-like 1 and 2 are essential Ser-5-specific C-terminal domain phosphatases.拟南芥C端结构域类磷酸酶1和2是必需的丝氨酸5特异性C端结构域磷酸酶。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Oct 5;101(40):14539-44. doi: 10.1073/pnas.0403174101. Epub 2004 Sep 23.
5
Arabidopsis CPL4 is an essential C-terminal domain phosphatase that suppresses xenobiotic stress responses.拟南芥CPL4是一种重要的C末端结构域磷酸酶,可抑制异源生物胁迫反应。
Plant J. 2014 Oct;80(1):27-39. doi: 10.1111/tpj.12612. Epub 2014 Aug 5.
6
A structural perspective of CTD function.CTD功能的结构视角。
Genes Dev. 2005 Jun 15;19(12):1401-15. doi: 10.1101/gad.1318105.
7
CDKF;1 and CDKD protein kinases regulate phosphorylation of serine residues in the C-terminal domain of Arabidopsis RNA polymerase II.CDKF;1 和 CDKD 蛋白激酶调节拟南芥 RNA 聚合酶 II C 末端结构域丝氨酸残基的磷酸化。
Plant Cell. 2012 Apr;24(4):1626-42. doi: 10.1105/tpc.112.096834. Epub 2012 Apr 30.
8
Rat1p maintains RNA polymerase II CTD phosphorylation balance.Rat1p 维持 RNA 聚合酶 II CTD 磷酸化平衡。
RNA. 2014 Apr;20(4):551-8. doi: 10.1261/rna.041129.113. Epub 2014 Feb 5.
9
Different strategies for carboxyl-terminal domain (CTD) recognition by serine 5-specific CTD phosphatases.丝氨酸5特异性羧基末端结构域(CTD)磷酸酶识别CTD的不同策略。
J Biol Chem. 2005 Nov 11;280(45):37681-8. doi: 10.1074/jbc.M505292200. Epub 2005 Sep 7.
10
Dynamic phosphorylation patterns of RNA polymerase II CTD during transcription.转录过程中RNA聚合酶II CTD的动态磷酸化模式。
Biochim Biophys Acta. 2013 Jan;1829(1):55-62. doi: 10.1016/j.bbagrm.2012.08.013. Epub 2012 Sep 7.

引用本文的文献

1
Pre-mRNA processing factors differentially impact coordination between co-transcriptional cleavage and transcription termination.前体mRNA加工因子对共转录切割和转录终止之间的协调有不同影响。
Nat Commun. 2025 Aug 1;16(1):7086. doi: 10.1038/s41467-025-62555-7.
2
Bromodomain-containing proteins interact with a non-canonical RNA polymerase II kinase to maintain gene expression upon heat stress.含溴结构域的蛋白质与一种非典型RNA聚合酶II激酶相互作用,以在热应激时维持基因表达。
Nat Plants. 2025 Jul 9. doi: 10.1038/s41477-025-02044-3.
3
Dynamic changes in chromatin structure and transcriptional activity in the generative cells of Lilium longiflorum.
麝香百合生殖细胞中染色质结构和转录活性的动态变化
J Plant Res. 2025 Apr 15. doi: 10.1007/s10265-025-01637-5.
4
Global profiling of CPL3-mediated alternative splicing reveals regulatory mechanisms of DGK5 in plant immunity and phosphatidic acid homeostasis.CPL3介导的可变剪接的全局分析揭示了DGK5在植物免疫和磷脂酸稳态中的调控机制。
Genome Biol. 2025 Mar 21;26(1):65. doi: 10.1186/s13059-025-03529-2.
5
Defining gene ends: RNA polymerase II CTD threonine 4 phosphorylation marks transcription termination regions genome-wide.定义基因末端:RNA聚合酶II CTD苏氨酸4磷酸化在全基因组范围内标记转录终止区域。
Nucleic Acids Res. 2025 Jan 11;53(2). doi: 10.1093/nar/gkae1240.
6
Are complex traits underpinned by polygenic molecular traits? A reflection on the complexity of gene expression.复杂性状是否由多基因分子性状支撑?对基因表达复杂性的思考。
Plant Cell Physiol. 2025 May 17;66(4):444-460. doi: 10.1093/pcp/pcae140.
7
ALTERED MERISTEM PROGRAM1 impairs RNA silencing by repressing the biogenesis of a subset of inverted repeat-derived siRNAs.改变的分生组织程序1通过抑制一部分反向重复序列来源的小干扰RNA的生物合成来损害RNA沉默。
Plant Cell. 2024 Dec 23;37(1). doi: 10.1093/plcell/koae293.
8
The general transcription factors (GTFs) of RNA polymerase II and their roles in plant development and stress responses.RNA 聚合酶 II 的一般转录因子及其在植物发育和应激反应中的作用。
Crit Rev Biochem Mol Biol. 2024 Oct;59(5):267-309. doi: 10.1080/10409238.2024.2408562. Epub 2024 Oct 3.
9
Light control of three-dimensional chromatin organization in soybean.大豆中三维染色质组织的光控
Plant Biotechnol J. 2024 Sep;22(9):2596-2611. doi: 10.1111/pbi.14372. Epub 2024 May 19.
10
Cajal bodies: Evolutionarily conserved nuclear biomolecular condensates with properties unique to plants.卡哈尔体:具有植物特有性质的进化上保守的核生物分子凝聚物。
Plant Cell. 2023 Sep 1;35(9):3214-3235. doi: 10.1093/plcell/koad140.