• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

蛋白质的协同、快速、定量和位点特异性双重标记

Concerted, rapid, quantitative, and site-specific dual labeling of proteins.

作者信息

Sachdeva Amit, Wang Kaihang, Elliott Thomas, Chin Jason W

机构信息

Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology, Francis Crick Avenue, Cambridge CB2 0QH, United Kingdom.

出版信息

J Am Chem Soc. 2014 Jun 4;136(22):7785-8. doi: 10.1021/ja4129789. Epub 2014 May 23.

DOI:10.1021/ja4129789
PMID:24857040
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4333588/
Abstract

Rapid, one-pot, concerted, site-specific labeling of proteins at genetically encoded unnatural amino acids with distinct small molecules at physiological pH, temperature, and pressure is an important challenge. Current approaches require sequential labeling, low pH, and typically days to reach completion, limiting their utility. We report the efficient, genetically encoded incorporation of alkyne- and cyclopropene-containing amino acids at distinct sites in a protein using an optimized orthogonal translation system in E. coli. and quantitative, site-specific, one-pot, concerted protein labeling with fluorophores bearing azide and tetrazine groups, respectively. Protein double labeling in aqueous buffer at physiological pH, temperature, and pressure is quantitative in 30 min.

摘要

在生理pH值、温度和压力条件下,利用不同的小分子对基因编码的非天然氨基酸处的蛋白质进行快速、一锅法、协同、位点特异性标记是一项重大挑战。目前的方法需要顺序标记、低pH值,而且通常需要数天才能完成,这限制了它们的实用性。我们报告了使用优化的大肠杆菌正交翻译系统,在蛋白质的不同位点高效地、基因编码地掺入含炔烃和环丙烯的氨基酸,以及分别用带有叠氮化物和四嗪基团的荧光团进行定量、位点特异性、一锅法、协同蛋白质标记。在生理pH值、温度和压力条件下,在水性缓冲液中进行蛋白质双标记,30分钟内即可完成定量。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/578f4ea6c724/ja-2013-129789_0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/effbd974fbdf/ja-2013-129789_0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/0481e593d773/ja-2013-129789_0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/7ef11e7c2e55/ja-2013-129789_0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/578f4ea6c724/ja-2013-129789_0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/effbd974fbdf/ja-2013-129789_0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/0481e593d773/ja-2013-129789_0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/7ef11e7c2e55/ja-2013-129789_0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9e26/4333588/578f4ea6c724/ja-2013-129789_0003.jpg

相似文献

1
Concerted, rapid, quantitative, and site-specific dual labeling of proteins.蛋白质的协同、快速、定量和位点特异性双重标记
J Am Chem Soc. 2014 Jun 4;136(22):7785-8. doi: 10.1021/ja4129789. Epub 2014 May 23.
2
Genetic Encoding of bicyclononynes and trans-cyclooctenes for site-specific protein labeling in vitro and in live mammalian cells via rapid fluorogenic Diels-Alder reactions.通过快速的氟代 Diels-Alder 反应,对双环壬炔和反式环辛烯进行遗传编码,用于体外和活哺乳动物细胞中的定点蛋白质标记。
J Am Chem Soc. 2012 Jun 27;134(25):10317-20. doi: 10.1021/ja302832g. Epub 2012 Jun 13.
3
Genetic Incorporation of Two Mutually Orthogonal Bioorthogonal Amino Acids That Enable Efficient Protein Dual-Labeling in Cells.遗传掺入两种相互正交的生物正交氨基酸,可在细胞内有效进行蛋白质双重标记。
ACS Chem Biol. 2021 Nov 19;16(11):2612-2622. doi: 10.1021/acschembio.1c00649. Epub 2021 Sep 30.
4
Efficient and Site-specific Antibody Labeling by Strain-promoted Azide-alkyne Cycloaddition.通过应变促进的叠氮化物-炔烃环加成实现高效且位点特异性的抗体标记
J Vis Exp. 2016 Dec 23(118):54922. doi: 10.3791/54922.
5
Genetic encoding and labeling of aliphatic azides and alkynes in recombinant proteins via a pyrrolysyl-tRNA Synthetase/tRNA(CUA) pair and click chemistry.通过吡咯赖氨酸-tRNA合成酶/tRNA(CUA)对及点击化学对重组蛋白中的脂肪族叠氮化物和炔烃进行遗传编码与标记。
J Am Chem Soc. 2009 Jul 1;131(25):8720-1. doi: 10.1021/ja900553w.
6
Encoding multiple unnatural amino acids via evolution of a quadruplet-decoding ribosome.通过四重编码核糖体的进化来编码多个非天然氨基酸。
Nature. 2010 Mar 18;464(7287):441-4. doi: 10.1038/nature08817. Epub 2010 Feb 14.
7
Application of Noncanonical Amino Acids for Protein Labeling in a Genomically Recoded Escherichia coli.非标准氨基酸在基因组重编码大肠杆菌中用于蛋白质标记的应用
ACS Synth Biol. 2017 Feb 17;6(2):233-255. doi: 10.1021/acssynbio.6b00138. Epub 2016 Nov 23.
8
Site-Specific Glycoconjugation of Protein via Bioorthogonal Tetrazine Cycloaddition with a Genetically Encoded trans-Cyclooctene or Bicyclononyne.通过生物正交四嗪环加成与基因编码的反式环辛烯或双环壬炔实现蛋白质的位点特异性糖基化。
Bioconjug Chem. 2015 May 20;26(5):802-6. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.5b00101. Epub 2015 Apr 24.
9
Site-Specific Protein Labeling with Tetrazine Amino Acids.用四嗪氨基酸进行位点特异性蛋白质标记。
Methods Mol Biol. 2018;1728:201-217. doi: 10.1007/978-1-4939-7574-7_13.
10
Residue-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids for Protein Engineering.用于蛋白质工程的非天然氨基酸的位点特异性掺入
Methods Mol Biol. 2018;1728:137-145. doi: 10.1007/978-1-4939-7574-7_8.

引用本文的文献

1
Triazolinedione Modification of Prenylated Peptides, Proteins, and DNA: Toward a Single-Site Multilabeling Approach for Biomolecules.异戊烯化肽、蛋白质和DNA的三唑啉二酮修饰:迈向生物分子的单位点多标记方法
ACS Omega. 2025 May 18;10(21):21187-21194. doi: 10.1021/acsomega.4c10125. eCollection 2025 Jun 3.
2
Late-Stage Minimal Labeling of Peptides and Proteins for Real-Time Imaging of Cellular Trafficking.用于细胞运输实时成像的肽和蛋白质晚期微量标记
ACS Cent Sci. 2024 Nov 26;11(1):66-75. doi: 10.1021/acscentsci.4c01249. eCollection 2025 Jan 22.
3
Target Bioconjugation of Protein Through Chemical, Molecular Dynamics, and Artificial Intelligence Approaches.

本文引用的文献

1
Strain-promoted sydnone bicyclo-[6.1.0]-nonyne cycloaddition†Electronic supplementary information (ESI) available: Full experimental details, H/C NMR spectral data, protein synthesis and purification. See DOI: 10.1039/c3sc53332h.应变促进的 sydnone 双环-[6.1.0]-壬炔环加成†可获得电子补充信息(ESI):完整的实验细节、H/C NMR 光谱数据、蛋白质合成与纯化。见 DOI: 10.1039/c3sc53332h。
Chem Sci. 2014 Apr 1;5(5):1742-1744. doi: 10.1039/c3sc53332h. Epub 2014 Feb 5.
2
Copper-chelating azides for efficient click conjugation reactions in complex media.铜螯合叠氮化物在复杂介质中用于高效点击偶联反应。
Angew Chem Int Ed Engl. 2014 Jun 2;53(23):5872-6. doi: 10.1002/anie.201310671. Epub 2014 Apr 30.
3
通过化学、分子动力学和人工智能方法实现蛋白质的靶向生物共轭
Metabolites. 2024 Dec 2;14(12):668. doi: 10.3390/metabo14120668.
4
Sydnthiones are versatile bioorthogonal hydrogen sulfide donors.西顿硫酮是多功能的生物正交硫化氢供体。
Nat Commun. 2024 Nov 27;15(1):10288. doi: 10.1038/s41467-024-54765-2.
5
Directed Evolution of Pyrrolysyl-tRNA Synthetase for the Genetic Incorporation of Two Different Noncanonical Amino Acids in One Protein.用于在一种蛋白质中基因编码两种不同非天然氨基酸的吡咯赖氨酸-tRNA合成酶的定向进化
ACS Bio Med Chem Au. 2024 Aug 22;4(5):233-241. doi: 10.1021/acsbiomedchemau.4c00028. eCollection 2024 Oct 16.
6
Engineering Pyrrolysine Systems for Genetic Code Expansion and Reprogramming.工程吡咯赖氨酸系统用于遗传密码扩展和重编程。
Chem Rev. 2024 Oct 9;124(19):11008-11062. doi: 10.1021/acs.chemrev.4c00243. Epub 2024 Sep 5.
7
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology.细胞特异性非天然氨基酸掺入的合成生物学。
Chem Rev. 2024 Sep 25;124(18):10577-10617. doi: 10.1021/acs.chemrev.3c00938. Epub 2024 Aug 29.
8
Mutually Orthogonal Bioorthogonal Reactions: Selective Chemistries for Labeling Multiple Biomolecules Simultaneously.相互正交的生物正交反应:同时标记多种生物分子的选择性化学。
Top Curr Chem (Cham). 2024 Jul 6;382(3):24. doi: 10.1007/s41061-024-00467-8.
9
Engineering tRNAs for the Ribosomal Translation of Non-proteinogenic Monomers.用于非蛋白质ogenic单体核糖体翻译的工程化tRNA
Chem Rev. 2024 May 22;124(10):6444-6500. doi: 10.1021/acs.chemrev.3c00894. Epub 2024 Apr 30.
10
Inserting "OFF-to-ON" BODIPY Tags into Cytokines: A Fluorogenic Interleukin IL-33 for Real-Time Imaging of Immune Cells.将“关到开”型硼二吡咯(BODIPY)标签插入细胞因子:用于免疫细胞实时成像的荧光白细胞介素IL-33
ACS Cent Sci. 2023 Dec 20;10(1):143-154. doi: 10.1021/acscentsci.3c01125. eCollection 2024 Jan 24.
Optimized orthogonal translation of unnatural amino acids enables spontaneous protein double-labelling and FRET.
非天然氨基酸的优化正交翻译可实现蛋白质的自发双标记和荧光共振能量转移。
Nat Chem. 2014 May;6(5):393-403. doi: 10.1038/nchem.1919. Epub 2014 Apr 20.
4
Proteome labeling and protein identification in specific tissues and at specific developmental stages in an animal.动物特定组织和特定发育阶段的蛋白质组标记与蛋白质鉴定。
Nat Biotechnol. 2014 May;32(5):465-72. doi: 10.1038/nbt.2860. Epub 2014 Apr 13.
5
Cellular incorporation of unnatural amino acids and bioorthogonal labeling of proteins.非天然氨基酸的细胞掺入与蛋白质的生物正交标记
Chem Rev. 2014 May 14;114(9):4764-806. doi: 10.1021/cr400355w. Epub 2014 Mar 21.
6
Bioorthogonal reactions for labeling proteins.用于标记蛋白质的生物正交反应。
ACS Chem Biol. 2014 Jan 17;9(1):16-20. doi: 10.1021/cb4009292.
7
Isomeric cyclopropenes exhibit unique bioorthogonal reactivities.立体异构体环丙烯具有独特的生物正交反应活性。
J Am Chem Soc. 2013 Sep 18;135(37):13680-3. doi: 10.1021/ja407737d. Epub 2013 Sep 6.
8
Site-specific protein labeling using PRIME and chelation-assisted click chemistry.利用 PRIME 和螯合辅助点击化学进行位点特异性蛋白质标记。
Nat Protoc. 2013 Aug;8(8):1620-34. doi: 10.1038/nprot.2013.096. Epub 2013 Jul 25.
9
Labeling proteins with fluorophore/thioamide Förster resonant energy transfer pairs by combining unnatural amino acid mutagenesis and native chemical ligation.通过将非天然氨基酸突变和天然化学连接相结合,用荧光团/硫代酰胺 Förster 共振能量转移对标记蛋白质。
J Am Chem Soc. 2013 May 1;135(17):6529-40. doi: 10.1021/ja4005943. Epub 2013 Apr 17.
10
A versatile platform for single- and multiple-unnatural amino acid mutagenesis in Escherichia coli.一种在大肠杆菌中进行单/多种非天然氨基酸突变的多功能平台。
Biochemistry. 2013 Mar 12;52(10):1828-37. doi: 10.1021/bi4000244. Epub 2013 Feb 27.