通过Web界面使用EMBL-EBI服务，并通过Web服务以编程方式使用。
Using EMBL-EBI Services via Web Interface and Programmatically via Web Services.
作者信息
Lopez Rodrigo, Cowley Andrew, Li Weizhong, McWilliam Hamish
机构信息
EMBL Outstation-European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge, United Kingdom.
出版信息
Curr Protoc Bioinformatics. 2014 Dec 12;48:3.12.1-3.12.50. doi: 10.1002/0471250953.bi0312s48.
Abstract
The European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) provides access to a wide range of databases and analysis tools that are of key importance in bioinformatics. As well as providing Web interfaces to these resources, Web Services are available using SOAP and REST protocols that enable programmatic access to our resources and allow their integration into other applications and analytical workflows. This unit describes the various options available to a typical researcher or bioinformatician who wishes to use our resources via Web interface or programmatically via a range of programming languages.
摘要
欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）提供了对生物信息学中至关重要的广泛数据库和分析工具的访问。除了为这些资源提供Web界面外，还可使用SOAP和REST协议获得Web服务，这些协议允许对我们的资源进行编程访问，并将其集成到其他应用程序和分析工作流程中。本单元描述了典型研究人员或生物信息学家可采用的各种选项，他们希望通过Web界面或通过一系列编程语言以编程方式使用我们的资源。
相似文献
1
Using EMBL-EBI Services via Web Interface and Programmatically via Web Services.通过Web界面使用EMBL-EBI服务，并通过Web服务以编程方式使用。
Curr Protoc Bioinformatics. 2014 Dec 12;48:3.12.1-3.12.50. doi: 10.1002/0471250953.bi0312s48.
2
Using EMBL-EBI Services via Web Interface and Programmatically via Web Services.通过 Web 界面和通过 Web 服务进行 EMBL-EBI 服务的使用。
Curr Protoc. 2024 Jun;4(6):e1065. doi: 10.1002/cpz1.1065.
3
Using EMBL-EBI Services via Web Interface and Programmatically via Web Services.通过Web界面使用EMBL-EBI服务以及通过Web服务以编程方式使用。
Curr Protoc Bioinformatics. 2019 Jun;66(1):e74. doi: 10.1002/cpbi.74. Epub 2019 Apr 30.
4
Web services at the European Bioinformatics Institute-2009.欧洲生物信息学研究所的网络服务-2009年。
Nucleic Acids Res. 2009 Jul;37(Web Server issue):W6-10. doi: 10.1093/nar/gkp302. Epub 2009 May 12.
5
Analysis Tool Web Services from the EMBL-EBI.EMBL-EBI 的分析工具 Web 服务。
Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(Web Server issue):W597-600. doi: 10.1093/nar/gkt376. Epub 2013 May 13.
6
A new bioinformatics analysis tools framework at EMBL-EBI.一个新的生物信息学分析工具框架在 EMBL-EBI。
Nucleic Acids Res. 2010 Jul;38(Web Server issue):W695-9. doi: 10.1093/nar/gkq313. Epub 2010 May 3.
7
Programmatic access to bioinformatics tools from EMBL-EBI update: 2017.从 EMBL-EBI 获取生物信息学工具的编程访问：2017 年更新。
Nucleic Acids Res. 2017 Jul 3;45(W1):W550-W553. doi: 10.1093/nar/gkx273.
8
Biosphere: the interoperation of web services in microarray cluster analysis.生物群落：微阵列聚类分析中网络服务的互操作。
Appl Bioinformatics. 2004;3(4):253-6. doi: 10.2165/00822942-200403040-00007.
9
Search and sequence analysis tools services from EMBL-EBI in 2022.2022 年 EMBL-EBI 的搜索和序列分析工具服务。
Nucleic Acids Res. 2022 Jul 5;50(W1):W276-W279. doi: 10.1093/nar/gkac240.
10
The EMBL-EBI bioinformatics web and programmatic tools framework.欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）的生物信息学网络及编程工具框架。
Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(W1):W580-4. doi: 10.1093/nar/gkv279. Epub 2015 Apr 6.
引用本文的文献
1
Unraveling the Secrets of a Double-Life Fungus by Genomics: CCMB661 Displays Molecular Machinery for Both Parasitic and Endophytic Lifestyles.通过基因组学揭开一种兼具双重生活方式真菌的秘密：CCMB661展现出寄生和内生生活方式的分子机制。
J Fungi (Basel). 2023 Jan 13;9(1):110. doi: 10.3390/jof9010110.
2
Regression of Breast Cancer Metastases Following Treatment with Irradiated SV-BR-1-GM, a GM-CSF Overexpressing Breast Cancer Cell Line: Intellectual Property and Immune Markers of Response.辐照过的 SV-BR-1-GM（高表达 GM-CSF 的乳腺癌细胞系）治疗后乳腺癌转移的消退：反应的知识产权和免疫标志物。
Recent Pat Anticancer Drug Discov. 2022;18(2):224-240. doi: 10.2174/1574892817666220518123331.
3
GraphQL for the delivery of bioinformatics web APIs and application to ZincBind.用于生物信息学网络应用程序编程接口交付及应用于锌结合的GraphQL
Bioinform Adv. 2021 Sep 29;1(1):vbab023. doi: 10.1093/bioadv/vbab023. eCollection 2021.
4
Mining the Protein Data Bank to improve prediction of changes in protein-protein binding.从蛋白质数据库中挖掘信息以提高蛋白质-蛋白质结合变化的预测能力。
PLoS One. 2021 Nov 2;16(11):e0257614. doi: 10.1371/journal.pone.0257614. eCollection 2021.
5
Proteomics INTegrator (PINT): An Online Tool To Store, Query, and Visualize Large Proteomics Experiment Results.蛋白质组学整合器（PINT）：一个用于存储、查询和可视化大型蛋白质组学实验结果的在线工具。
J Proteome Res. 2019 Aug 2;18(8):2999-3008. doi: 10.1021/acs.jproteome.8b00711. Epub 2019 Jul 1.
6
The Genome-Based Virus Taxonomy with ICTV Database Extension.基于基因组的病毒分类学与国际病毒分类委员会数据库扩展。
Genomics Inform. 2018 Dec;16(4):e22. doi: 10.5808/GI.2018.16.4.e22. Epub 2018 Dec 28.
7
Draft genome sequence of (Sw.) Kreisel CCMB561, a tropical white-rot Basidiomycota from the semiarid region of Brazil.来自巴西半干旱地区的热带白腐担子菌（Sw.）克雷泽尔CCMB561的基因组序列草图。
Data Brief. 2018 Apr 25;18:1581-1587. doi: 10.1016/j.dib.2018.04.074. eCollection 2018 Jun.
8
GO FEAT: a rapid web-based functional annotation tool for genomic and transcriptomic data.GO FEAT：一个快速的基于网络的基因组和转录组数据功能注释工具。
Sci Rep. 2018 Jan 29;8(1):1794. doi: 10.1038/s41598-018-20211-9.
9
Programmatic access to bioinformatics tools from EMBL-EBI update: 2017.从 EMBL-EBI 获取生物信息学工具的编程访问：2017 年更新。
Nucleic Acids Res. 2017 Jul 3;45(W1):W550-W553. doi: 10.1093/nar/gkx273.
10
The EMBL-EBI bioinformatics web and programmatic tools framework.欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）的生物信息学网络及编程工具框架。
Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(W1):W580-4. doi: 10.1093/nar/gkv279. Epub 2015 Apr 6.
Zotero 插件