• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

系统发育分析中分子数据的漫长而曲折之路。

The long and winding road of molecular data in phylogenetic analysis.

作者信息

Suárez-Díaz Edna

机构信息

Departamento de Biología Evolutiva, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, Copilco, Coyoacán, Mexico, DF, Mexico. ednasuarez@ciencias. unam.mx

出版信息

J Hist Biol. 2014 Fall;47(3):443-78.

PMID:25574534
Abstract

The use of molecules and reactions as evidence, markers and/or traits for evolutionary processes has a history more than a century long. Molecules have been used in studies of intra-specific variation and studies of similarity among species that do not necessarily result in the analysis of phylogenetic relations. Promoters of the use of molecular data have sustained the need for quantification as the main argument to make use of them. Moreover, quantification has allowed intensive statistical analysis, as a condition and a product of increasing automation. All of these analyses are subject to the methodological anxiety characteristic of a community in search of objectivity (Suárez-Díaz and Anaya-Munoz, Stud Hist Philos Biol Biomed Sci 39:451–458, 2008). It is in this context that scientists compared and evaluated protein and nucleic acid sequence data with other types of molecular data – including immunological, electrophoretic and hybridization data. This paper argues that by looking at longterm historical processes, such as the use of molecular evidence in evolutionary biology, we gain valuable insights into the history of science. In that sense, it accompanies a growing concern among historians for big-pictures of science that incorporate the fruitful historical research on local cases of the last decades.

摘要

将分子和反应用作进化过程的证据、标记和/或特征已有一个多世纪的历史。分子已被用于种内变异研究以及物种间相似性研究,这些研究不一定会对系统发育关系进行分析。分子数据使用的推动者一直坚持将量化作为使用它们的主要论据。此外,量化使得密集的统计分析成为可能,这是自动化程度提高的条件和产物。所有这些分析都受到一个寻求客观性的群体所特有的方法论焦虑的影响(苏亚雷斯 - 迪亚兹和阿纳亚 - 穆尼奥斯,《科学史与科学哲学杂志:生物学与生物医学科学》39:451 - 458,2008)。正是在这种背景下,科学家们将蛋白质和核酸序列数据与其他类型的分子数据——包括免疫学、电泳和杂交数据进行了比较和评估。本文认为,通过审视长期的历史过程,比如进化生物学中分子证据的使用,我们能对科学史有宝贵的洞察。从这个意义上说,它伴随着历史学家们日益增长的对科学全景的关注,这种全景包含了过去几十年对局部案例富有成果的历史研究。

相似文献

1
The long and winding road of molecular data in phylogenetic analysis.系统发育分析中分子数据的漫长而曲折之路。
J Hist Biol. 2014 Fall;47(3):443-78.
2
The long and winding road of molecular data in phylogenetic analysis.系统发育分析中分子数据的漫长而曲折之路。
J Hist Biol. 2014 Summer;47(2):443-78. doi: 10.1007/s10739-013-9373-9.
3
History, objectivity, and the construction of molecular phylogenies.历史、客观性与分子系统发育树的构建
Stud Hist Philos Biol Biomed Sci. 2008 Dec;39(4):451-68. doi: 10.1016/j.shpsc.2008.09.002.
4
Making room for new faces: evolution, genomics and the growth of bioinformatics.为新面孔腾出空间:进化、基因组学和生物信息学的发展。
Hist Philos Life Sci. 2010;32(1):65-89.
5
[Foundations of the new phylogenetics].[新系统发育学的基础]
Zh Obshch Biol. 2004 Jul-Aug;65(4):334-66.
6
Curious parallels and curious connections--phylogenetic thinking in biology and historical linguistics.奇妙的相似性与奇妙的联系——生物学和历史语言学中的系统发育思维
Syst Biol. 2005 Aug;54(4):513-26. doi: 10.1080/10635150590950317.
7
Phylogeny and beyond: Scientific, historical, and conceptual significance of the first tree of life.系统发育与超越:生命第一棵树的科学、历史和概念意义。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2012 Jan 24;109(4):1011-8. doi: 10.1073/pnas.1109716109. Epub 2012 Jan 17.
8
The application of molecular genetic approaches to the study of human evolution.分子遗传学方法在人类进化研究中的应用。
Nat Genet. 2003 Mar;33 Suppl:266-75. doi: 10.1038/ng1113.
9
Histories of molecules: Reconciling the past.分子的历史:调和过去。
Stud Hist Philos Sci. 2016 Feb;55:69-83. doi: 10.1016/j.shpsa.2015.09.002. Epub 2015 Oct 9.
10
[Research on recent science: the example of molecular biology].[近期科学研究:以分子生物学为例]
Medizinhist J. 2006;41(2):187-99.

引用本文的文献

1
How Phenograms and Cladograms Became Molecular Phylogenetic Trees.支序图和系统发生树如何成为分子系统发育树。
J Hist Biol. 2024 Sep;57(3):423-443. doi: 10.1007/s10739-024-09782-8. Epub 2024 Aug 30.
2
The Molecular Basis of Evolution and Disease: A Cold War Alliance.进化与疾病的分子基础:一场冷战联盟。
J Hist Biol. 2019 Jun;52(2):325-346. doi: 10.1007/s10739-017-9476-9.
3
Moving Past the Systematics Wars.超越系统学之争

本文引用的文献

1
PHYLOGENETIC ANALYSIS: MODELS AND ESTIMATION PROCEDURES.系统发育分析:模型与估计程序
Evolution. 1967 Sep;21(3):550-570. doi: 10.1111/j.1558-5646.1967.tb03411.x.
2
Human evolution across the disciplines: spotlights on American anthropology and genetics.跨学科的人类进化:聚焦美国人类学和遗传学。
Hist Philos Life Sci. 2012;34(1-2):211-36.
3
The old man and the sea urchin genome: theory and data in the work of Eric Davidson, 1969-2006.老人与海胆基因组:1969-2006 年埃里克·戴维森的理论与数据。
J Hist Biol. 2018 Mar;51(1):31-67. doi: 10.1007/s10739-017-9471-1.
Hist Philos Life Sci. 2011;33(2):147-63.
4
From metaphor to practices: The introduction of "information engineers" into the first DNA sequence database.从隐喻到实践:“信息工程师”在第一个 DNA 序列数据库中的引入。
Hist Philos Life Sci. 2011;33(1):71-104.
5
The experimenter's museum: GenBank, natural history, and the moral economies of biomedicine.实验者的博物馆:基因库、自然史与生物医学的道德经济
Isis. 2011 Mar;102(1):60-96. doi: 10.1086/658657.
6
Making room for new faces: evolution, genomics and the growth of bioinformatics.为新面孔腾出空间:进化、基因组学和生物信息学的发展。
Hist Philos Life Sci. 2010;32(1):65-89.
7
A new insight into Sanger's development of sequencing: from proteins to DNA, 1943-1977.对桑格测序技术发展的新见解:从蛋白质到DNA,1943年至1977年
J Hist Biol. 2010 Summer;43(2):265-323. doi: 10.1007/s10739-009-9184-1.
8
Waiting for sequences: Morris Goodman, immunodiffusion experiments, and the origins of molecular anthropology.等待序列:莫里斯·古德曼、免疫扩散实验与分子人类学的起源
J Hist Biol. 2010 Winter;43(4):697-725. doi: 10.1007/s10739-009-9219-7.
9
Collecting, comparing, and computing sequences: the making of Margaret O. Dayhoff's Atlas of Protein Sequence and Structure, 1954-1965.收集、比较与计算序列:玛格丽特·O·戴霍夫《蛋白质序列与结构图谱》的诞生,1954 - 1965年
J Hist Biol. 2010 Winter;43(4):623-60. doi: 10.1007/s10739-009-9221-0.
10
Laboratories, museums, and the comparative perspective: Alan A. Boyden's quest for objectivity in serological taxonomy, 1924-1962.实验室、博物馆与比较视角:艾伦·A·博伊登在血清分类学中对客观性的追求(1924 - 1962)
Hist Stud Nat Sci. 2010 Spring;40(2):149-82. doi: 10.1525/hsns.2010.40.2.149.