• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种感染马铃薯普通栽培种的哥伦比亚马铃薯病毒V(PVV)不同分离株的基因组序列。

Genome sequence of a divergent Colombian isolate of potato virus V (PVV) infecting Solanum phureja.

作者信息

Gutiérrez P, Mesa H Jaramillo, Marín Montoya M

出版信息

Acta Virol. 2016 Mar;60(1):49-54. doi: 10.4149/av_2016_01_49.

DOI:10.4149/av_2016_01_49
PMID:26982467
Abstract

Deep sequencing analysis of the transcriptome of a Solanum phureja cv. Criolla Colombia plant with symptoms typical of a virus disease revealed an infection with potato virus V (PVV). The PVV-phureja genome comprises 9904 nt, exhibits 83% nucleotide identity with currently fully sequenced PVV isolates and contains one large ORF that codes for a polyprotein of 3065 residues flanked by 5' and 3' UTR of 217 and 448 nt, respectively. Phylogenetic analysis of the PVV-phureja polyprotein indicates that it is divergent with respect to most PVV isolates. This is the first complete PVV genome of an isolate infecting a host different to S. tuberosum and, to this date, the only one from the South American Andes.

摘要

对一株具有典型病毒病症状的哥伦比亚克里奥亚亚种马铃薯(Solanum phureja cv. Criolla Colombia)植株的转录组进行深度测序分析,结果显示该植株感染了马铃薯病毒V(PVV)。PVV-克里奥亚亚种的基因组由9904个核苷酸组成,与目前已完全测序的PVV分离株具有83%的核苷酸同一性,并且包含一个大的开放阅读框,该阅读框编码一个由3065个氨基酸残基组成的多聚蛋白,其两侧分别为217个核苷酸和448个核苷酸的5'和3'非翻译区。对PVV-克里奥亚亚种多聚蛋白的系统发育分析表明,它与大多数PVV分离株不同。这是感染不同于马铃薯(S. tuberosum)的宿主的分离株的首个完整PVV基因组,并且截至目前,是来自南美安第斯山脉的唯一一株。

相似文献

1
Genome sequence of a divergent Colombian isolate of potato virus V (PVV) infecting Solanum phureja.一种感染马铃薯普通栽培种的哥伦比亚马铃薯病毒V(PVV)不同分离株的基因组序列。
Acta Virol. 2016 Mar;60(1):49-54. doi: 10.4149/av_2016_01_49.
2
Genome sequence of a virus isolate from tamarillo (Solanum betaceum) in Colombia: evidence for a new potyvirus.哥伦比亚番茄树(茄属甜菜树)中一种病毒分离株的基因组序列:一种新型马铃薯Y病毒的证据
Arch Virol. 2015 Feb;160(2):557-60. doi: 10.1007/s00705-014-2296-8. Epub 2014 Dec 3.
3
Phylogenetics and Evolution of Potato Virus V: Another Potyvirus that Originated in the Andes.马铃薯 Y 病毒的系统发育与进化:另一种起源于安第斯山脉的马铃薯 Y 病毒。
Plant Dis. 2022 Feb;106(2):691-700. doi: 10.1094/PDIS-09-21-1897-RE. Epub 2022 Feb 8.
4
Characterization of a new potyvirus infecting pepper crops in Ecuador.一种感染厄瓜多尔辣椒作物的新型马铃薯Y病毒的特性分析。
Arch Virol. 2008;153(8):1543-8. doi: 10.1007/s00705-008-0132-8. Epub 2008 Jun 16.
5
Complete genome sequence of sunflower ring blotch virus, a new potyvirus infecting sunflower in Argentina.向日葵环斑病毒的全基因组序列,一种在阿根廷感染向日葵的新型马铃薯Y病毒。
Arch Virol. 2017 Jun;162(6):1787-1790. doi: 10.1007/s00705-017-3275-7. Epub 2017 Feb 21.
6
Strains of Peru tomato virus infecting cocona (Solanum sessiliflorum), tomato and pepper in Peru with reference to genome evolution in genus Potyvirus.秘鲁番茄病毒株系在秘鲁感染可可纳(Solanum sessiliflorum)、番茄和辣椒,并涉及马铃薯Y病毒属的基因组进化。
Arch Virol. 2004 Oct;149(10):2025-34. doi: 10.1007/s00705-004-0356-1.
7
Complete genome sequence of a novel potato virus S strain infecting Solanum phureja in Colombia.哥伦比亚侵染普通野生马铃薯的新型马铃薯 S 病毒 S 株全基因组序列。
Arch Virol. 2013 Oct;158(10):2205-8. doi: 10.1007/s00705-013-1730-7. Epub 2013 May 12.
8
Molecular resolution of a complex of potyviruses infecting solanaceous crops at the centre of origin in Peru.对秘鲁起源中心感染茄科作物的一组马铃薯Y病毒复合体的分子解析。
J Gen Virol. 2003 Sep;84(Pt 9):2565-2578. doi: 10.1099/vir.0.19208-0.
9
Identification and characterization of a new potyvirus infecting cucurbits.一种感染葫芦科植物的新型马铃薯Y病毒的鉴定与特性分析
Arch Virol. 2018 Mar;163(3):719-724. doi: 10.1007/s00705-017-3660-2. Epub 2017 Dec 1.
10
Biological and Molecular Properties of Isolates from Pepino ().木瓜()分离物的生物学和分子特性。
Plant Dis. 2019 Jul;103(7):1746-1756. doi: 10.1094/PDIS-12-18-2164-RE. Epub 2019 May 13.

引用本文的文献

1
Pest categorisation of potato virus V (non-EU isolates).马铃薯V病毒(非欧盟分离株)的有害生物分类
EFSA J. 2020 Jan 9;18(1):e05936. doi: 10.2903/j.efsa.2020.5936. eCollection 2020 Jan.