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登革热病毒1型的系统发育动力学揭示了2013年两个不同谱系的时空共同传播以及巴西戈亚斯州登革热病毒的多次引入。

Phylodynamics of DENV-1 reveals the spatiotemporal co-circulation of two distinct lineages in 2013 and multiple introductions of dengue virus in Goiás, Brazil.

作者信息

Cunha Marielton Dos Passos, Guimarães Vanessa Neiva, Souza Menira, de Paula Cardoso Divina das Dôres, de Almeida Tâmera Nunes Vieira, de Oliveira Thaís Santana, Fiaccadori Fabíola Souza

机构信息

Federal University of Goiás, Goiânia, Goiás, Brazil.

Federal University of Goiás, Goiânia, Goiás, Brazil.

出版信息

Infect Genet Evol. 2016 Sep;43:130-4. doi: 10.1016/j.meegid.2016.05.021. Epub 2016 May 17.

DOI:10.1016/j.meegid.2016.05.021
PMID:27223633
Abstract

Dengue virus type 1 (DENV-1) was the first serotype introduced in Brazil, during in the 1980s. Since then, this virus has spread in the Brazilian territory, causing several outbreaks. In 2013 the highest number of dengue cases was notified, when compared to the previous years in Brazil, and the state of Goiás reported over 160 thousand cases. In this study, we aimed to present the Phylodynamics of DENV-1 isolates from the state of Goiás, Brazil, during 2013 outbreak, based on the envelope gene (E) sequences. Phylogenetic analysis revealed that Brazilian DENV-1 isolates are grouped together with viruses from genotype V in two distinct lineages (lineage I and lineage II) reflecting co-circulation. Phylogeographic analyses showed that these lineages were introduced in different moments in Goiás, Brazil, using distinct routes, likely originated from the Caribbean. Lineage I was first introduced coming from Rio de Janeiro (2007-2012), followed by the introduction from Argentina (2010-2013). Lineage II was introduced in a single moment from Rio de Janeiro and this clade has existed since 2007-2010. The different viral introduction events demonstrate the viral dispersion process with neighboring regions, which is essential for the maintenance of outbreaks and introduction of new emerging viruses. In conclusion, obtained data reveals the importance of continuous molecular surveillance of this virus in different regions, providing a better understanding of DENV-1 circulation, considering the evolutionary and virus spread patterns.

摘要

1型登革病毒(DENV-1)是20世纪80年代传入巴西的首个血清型。自那时起,这种病毒在巴西境内传播,引发了数次疫情。2013年,巴西报告的登革热病例数与前几年相比达到最高,戈亚斯州报告了超过16万例病例。在本研究中,我们旨在基于包膜基因(E)序列,呈现2013年巴西戈亚斯州疫情期间DENV-1分离株的系统发育动力学。系统发育分析表明,巴西的DENV-1分离株与基因型V的病毒在两个不同的谱系(谱系I和谱系II)中聚集在一起,反映了共同传播。系统地理学分析表明,这些谱系在不同时间通过不同途径传入巴西戈亚斯州,可能起源于加勒比地区。谱系I首先从里约热内卢传入(2007 - 2012年),随后从阿根廷传入(2010 - 2013年)。谱系II在一个时间点从里约热内卢传入,该分支自2007 - 2010年以来一直存在。不同的病毒传入事件证明了病毒与邻近地区的扩散过程,这对于疫情的持续和新出现病毒的传入至关重要。总之,所获得的数据揭示了在不同地区对该病毒进行持续分子监测的重要性,考虑到进化和病毒传播模式,有助于更好地了解DENV-1的传播情况。

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