• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

使用准确性和实用性评估预测的可信度——以Meteor Nexus对哺乳动物新陈代谢的预测为例

Assessing Confidence in Predictions Using Veracity and Utility - A Case Study on the Prediction of Mammalian Metabolism by Meteor Nexus.

作者信息

Judson Philip N, Long Anthony, Murray Ernest, Patel Mukesh

机构信息

Heather Lea, Bland Hill, Norwood, Harrogate HG3 1TE, UK phone: +44(0)1843880241.

Lhasa Limited, Granary Wharf House, 2 Canal Wharf, Leeds LS11 5PS, UK.

出版信息

Mol Inform. 2015 May;34(5):284-91. doi: 10.1002/minf.201400184. Epub 2015 Apr 24.

DOI:10.1002/minf.201400184
PMID:27490274
Abstract

A previous paper1 described new metrics, veracity and utility, for assessing the performance of toxicity prediction systems that report confidence in their predictions. Assessing the performance of systems that predict mammalian metabolism is complicated by the absence of comprehensive sets of negative observations and predictions. This paper presents an approach to assessing the performance of such systems using veracity and utility.

摘要

之前的一篇论文1描述了用于评估毒性预测系统性能的新指标——准确性和实用性,这些系统会报告其预测的置信度。由于缺乏全面的负面观察结果和预测结果集,评估预测哺乳动物新陈代谢的系统的性能变得复杂。本文提出了一种使用准确性和实用性来评估此类系统性能的方法。

相似文献

1
Assessing Confidence in Predictions Using Veracity and Utility - A Case Study on the Prediction of Mammalian Metabolism by Meteor Nexus.使用准确性和实用性评估预测的可信度——以Meteor Nexus对哺乳动物新陈代谢的预测为例
Mol Inform. 2015 May;34(5):284-91. doi: 10.1002/minf.201400184. Epub 2015 Apr 24.
2
BioTransformer: a comprehensive computational tool for small molecule metabolism prediction and metabolite identification.生物转化器:一种用于小分子代谢预测和代谢物鉴定的综合计算工具。
J Cheminform. 2019 Jan 5;11(1):2. doi: 10.1186/s13321-018-0324-5.
3
Knowledge-based expert systems for toxicity and metabolism prediction: DEREK, StAR and METEOR.用于毒性和代谢预测的基于知识的专家系统:DEREK、StAR和METEOR。
SAR QSAR Environ Res. 1999;10(2-3):299-314. doi: 10.1080/10629369908039182.
4
Translational Metabolomics of Head Injury: Exploring Dysfunctional Cerebral Metabolism with Ex Vivo NMR Spectroscopy-Based Metabolite Quantification头部损伤的转化代谢组学:基于体外核磁共振波谱的代谢物定量分析探索脑代谢功能障碍
5
Modeling challenges in the synthetic biology of secondary metabolism.次级代谢合成生物学中的建模挑战
ACS Synth Biol. 2013 Jul 19;2(7):373-8. doi: 10.1021/sb4000228. Epub 2013 May 20.
6
Pragmatic approaches to using computational methods to predict xenobiotic metabolism.运用计算方法预测外源性化合物代谢的实用方法。
J Chem Inf Model. 2013 Jun 24;53(6):1282-93. doi: 10.1021/ci400050v. Epub 2013 Jun 11.
7
In silico tools for sharing data and knowledge on toxicity and metabolism: derek for windows, meteor, and vitic.用于毒性和代谢数据和知识共享的计算机工具:Derek for Windows、Meteor 和 VITIC。
Toxicol Mech Methods. 2008;18(2-3):177-87. doi: 10.1080/15376510701857320.
8
HEMET: mathematical model of biochemical pathways for simulation and prediction of HEpatocyte METabolism.HEMET:用于肝细胞代谢模拟和预测的生化途径数学模型。
Comput Methods Programs Biomed. 2008 Oct;92(1):121-34. doi: 10.1016/j.cmpb.2008.06.004. Epub 2008 Jul 21.
9
Regulation of Glucose Metabolism - A Perspective From Cell Bioprocessing.从细胞生物处理的角度看葡萄糖代谢的调控
Trends Biotechnol. 2016 Aug;34(8):638-651. doi: 10.1016/j.tibtech.2016.04.012. Epub 2016 Jun 2.
10
Impact of thermodynamic principles in systems biology.热力学原理在系统生物学中的影响。
Adv Biochem Eng Biotechnol. 2010;121:139-62. doi: 10.1007/10_2009_63.

引用本文的文献

1
Integrated Framework for Identifying Toxic Transformation Products in Complex Environmental Mixtures.识别复杂环境混合物中毒性转化产物的综合框架
Environ Sci Technol Lett. 2017 Feb 14;4(2):32-43. doi: 10.1021/acs.estlett.6b00455. Epub 2017 Jan 4.
2
MetStabOn-Online Platform for Metabolic Stability Predictions.MetStabOn-在线代谢稳定性预测平台。
Int J Mol Sci. 2018 Mar 30;19(4):1040. doi: 10.3390/ijms19041040.