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KODAMA:一个用于知识发现和数据挖掘的R软件包。

KODAMA: an R package for knowledge discovery and data mining.

作者信息

Cacciatore Stefano, Tenori Leonardo, Luchinat Claudio, Bennett Phillip R, MacIntyre David A

机构信息

Institute of Reproductive and Developmental Biology, Imperial College London, London, UK.

Department of Clinical and Experimental Medicine.

出版信息

Bioinformatics. 2017 Feb 15;33(4):621-623. doi: 10.1093/bioinformatics/btw705.

DOI:10.1093/bioinformatics/btw705
PMID:27993774
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5408808/
Abstract

SUMMARY

KODAMA, a novel learning algorithm for unsupervised feature extraction, is specifically designed for analysing noisy and high-dimensional datasets. Here we present an R package of the algorithm with additional functions that allow improved interpretation of high-dimensional data. The package requires no additional software and runs on all major platforms.

AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION

KODAMA is freely available from the R archive CRAN ( http://cran.r-project.org ). The software is distributed under the GNU General Public License (version 3 or later).

CONTACT

s.cacciatore@imperial.ac.uk.

SUPPLEMENTARY INFORMATION

Supplementary data are available at Bioinformatics online.

摘要

摘要

KODAMA是一种用于无监督特征提取的新型学习算法,专门设计用于分析噪声和高维数据集。在此,我们展示了该算法的R包,其附加功能可改进对高维数据的解释。该包无需额外软件,可在所有主流平台上运行。

可用性与实现

KODAMA可从R存档库CRAN(http://cran.r-project.org)免费获取。该软件根据GNU通用公共许可证(第3版或更高版本)分发。

联系方式

s.cacciatore@imperial.ac.uk。

补充信息

补充数据可在《生物信息学》在线获取。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b0b2/5408808/14f92811103b/btw705f1.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b0b2/5408808/14f92811103b/btw705f1.jpg
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