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Correcting for cell-type heterogeneity in epigenome-wide association studies: revisiting previous analyses.在全表观基因组关联研究中校正细胞类型异质性：重新审视以往分析。
Nat Methods. 2017 Feb 28;14(3):216-217. doi: 10.1038/nmeth.4187.
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Nat Commun. 2019 Jul 15;10(1):3113. doi: 10.1038/s41467-019-10864-z.
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Diabetologia. 2022 May;65(5):763-776. doi: 10.1007/s00125-022-05652-2. Epub 2022 Feb 15.
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PLoS Pathog. 2024 Mar 11;20(3):e1012063. doi: 10.1371/journal.ppat.1012063. eCollection 2024 Mar.
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PLoS Med. 2023 Jul 6;20(7):e1004247. doi: 10.1371/journal.pmed.1004247. eCollection 2023 Jul.
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Alcohol Clin Exp Res. 2019 Oct;43(10):2111-2121. doi: 10.1111/acer.14168. Epub 2019 Aug 30.
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Lancet Respir Med. 2018 May;6(5):379-388. doi: 10.1016/S2213-2600(18)30052-3. Epub 2018 Feb 26.
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Epigenome-Wide Association Study Reveals CpG Sites Associated with Thyroid Function and Regulatory Effects on .全基因组关联研究揭示了与甲状腺功能相关的 CpG 位点，并揭示了其对. 的调控作用。
Thyroid. 2023 Mar;33(3):301-311. doi: 10.1089/thy.2022.0373. Epub 2023 Mar 1.

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本文引用的文献

1
Sparse PCA corrects for cell type heterogeneity in epigenome-wide association studies.稀疏主成分分析在全表观基因组关联研究中校正细胞类型异质性。
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Accounting for cellular heterogeneity is critical in epigenome-wide association studies.在全表观基因组关联研究中，考虑细胞异质性至关重要。
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Reference-free cell mixture adjustments in analysis of DNA methylation data.无参考细胞混合物调整在 DNA 甲基化数据分析中的应用。
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Correcting for cell-type heterogeneity in epigenome-wide association studies: revisiting previous analyses.

作者信息

Zheng Shijie C, Beck Stephan, Jaffe Andrew E, Koestler Devin C, Hansen Kasper D, Houseman Andres E, Irizarry Rafael A, Teschendorff Andrew E

机构信息

CAS Key Lab of Computational Biology, CAS-MPG Partner Institute for Computational Biology, Shanghai Institute for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai, China.

University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.

出版信息

Nat Methods. 2017 Feb 28;14(3):216-217. doi: 10.1038/nmeth.4187.

DOI:10.1038/nmeth.4187
PMID:28245219
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6659733/
Abstract
摘要