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MathIOmica-MSViewer:一款用于Mathematica的质谱文件动态查看器。

MathIOmica-MSViewer: a dynamic viewer for mass spectrometry files for Mathematica.

作者信息

Roushangar R, Mias G I

机构信息

Department of Biochemistry and Molecular Biology, Michigan State University, East Lansing, MI, 48824, USA.

出版信息

J Mass Spectrom. 2017 May;52(5):315-318. doi: 10.1002/jms.3928.

Abstract

UNLABELLED

MathIOmica-MSViewer is an add-on graphical user interface utility for the Mathematica software system which facilitates the visualization and exploration of spectra from open format mass spectrometry files (mzXML and mzML standard community formats). The viewer was designed for simplicity and handling of large mass spectrometry data files. To facilitate searches, users may use search filters for the spectra based on mass to charge ratios and retention times, and visualize precursor spectra associated to a parent spectrum.

AVAILABILITY

The viewer is available as a Mathematica notebook (MathIOmica-MSViewer.nb) at https://doi.org/10.5281/zenodo.321385. The software is provided under an MIT License. © 2017 The Authors. Journal of Mass Spectrometry published by John Wiley & Sons, Ltd.

摘要

未标注

MathIOmica-MSViewer是Mathematica软件系统的一个附加图形用户界面实用程序,它有助于可视化和探索来自开放格式质谱文件(mzXML和mzML标准社区格式)的光谱。该查看器设计用于简化和处理大型质谱数据文件。为便于搜索,用户可以基于质荷比和保留时间对光谱使用搜索过滤器,并可视化与母光谱相关的前体光谱。

可用性

该查看器可作为Mathematica笔记本(MathIOmica-MSViewer.nb)在https://doi.org/10.5281/zenodo.321385获取。该软件根据麻省理工学院许可提供。©2017作者。《质谱杂志》由John Wiley & Sons, Ltd.出版。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/ea4f/5435938/fbbf2d02b895/JMS-52-315-g001.jpg

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