• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

绘制未知的表观转录组图谱。

Charting the unknown epitranscriptome.

机构信息

Garvan Institute of Medical Research, Darlinghurst, NSW 2010, Australia.

University of New South Wales, Sydney, NSW 2052, Australia.

出版信息

Nat Rev Mol Cell Biol. 2017 Jun;18(6):339-340. doi: 10.1038/nrm.2017.49. Epub 2017 May 10.

DOI:10.1038/nrm.2017.49
PMID:28488699
Abstract

RNA modifications can alter RNA structure-function relationships and various cellular processes. However, the genomic distribution and biological roles of most RNA modifications remain uncharacterized. Here, we propose using phage display antibody technology and direct sequencing through nanopores to facilitate systematic interrogation of the distribution, location and dynamics of RNA modifications.

摘要

RNA 修饰可以改变 RNA 的结构-功能关系和各种细胞过程。然而,大多数 RNA 修饰的基因组分布和生物学作用仍未被描述。在这里,我们提出使用噬菌体展示抗体技术和通过纳米孔进行直接测序,以促进对 RNA 修饰的分布、位置和动态的系统研究。

相似文献

1
Charting the unknown epitranscriptome.绘制未知的表观转录组图谱。
Nat Rev Mol Cell Biol. 2017 Jun;18(6):339-340. doi: 10.1038/nrm.2017.49. Epub 2017 May 10.
2
An Informatics Pipeline for Profiling and Annotating RNA Modifications.用于 RNA 修饰谱分析和注释的信息学管道。
Methods Mol Biol. 2021;2298:15-27. doi: 10.1007/978-1-0716-1374-0_2.
3
Detecting RNA modifications in the epitranscriptome: predict and validate.检测外转录组中的 RNA 修饰:预测和验证。
Nat Rev Genet. 2017 May;18(5):275-291. doi: 10.1038/nrg.2016.169. Epub 2017 Feb 20.
4
Quantitative mapping of the mammalian epitranscriptome.哺乳动物转录组表观遗传学图谱绘制。
Curr Opin Genet Dev. 2024 Aug;87:102212. doi: 10.1016/j.gde.2024.102212. Epub 2024 May 31.
5
Analysis of RNA Modifications by Second- and Third-Generation Deep Sequencing: 2020 Update.基于二代和三代高通量测序的 RNA 修饰分析:2020 更新版
Genes (Basel). 2021 Feb 16;12(2):278. doi: 10.3390/genes12020278.
6
Identification of differential RNA modifications from nanopore direct RNA sequencing with xPore.使用xPore从纳米孔直接RNA测序中鉴定差异RNA修饰。
Nat Biotechnol. 2021 Nov;39(11):1394-1402. doi: 10.1038/s41587-021-00949-w. Epub 2021 Jul 19.
7
Role of RNA modifications in cancer metastasis.RNA 修饰在癌症转移中的作用。
Curr Opin Genet Dev. 2024 Aug;87:102232. doi: 10.1016/j.gde.2024.102232. Epub 2024 Jul 22.
8
"Mining the Epitranscriptome: Detection of RNA editing and RNA modifications".挖掘表观转录组:RNA编辑和RNA修饰的检测
Methods. 2019 Mar 1;156:1-4. doi: 10.1016/j.ymeth.2019.02.016.
9
RNA Post-Transcriptional Modification Mapping Data Analysis Using RNA Framework.使用RNA框架进行RNA转录后修饰图谱数据分析
Methods Mol Biol. 2021;2298:3-13. doi: 10.1007/978-1-0716-1374-0_1.
10
Epitranscriptomic Code and Its Alterations in Human Disease.转录组码及其在人类疾病中的改变。
Trends Mol Med. 2018 Oct;24(10):886-903. doi: 10.1016/j.molmed.2018.07.010. Epub 2018 Aug 14.

引用本文的文献

1
The emerging roles of long non-coding RNAs in the nervous system.长链非编码RNA在神经系统中的新作用。
Nat Rev Neurosci. 2025 Sep 5. doi: 10.1038/s41583-025-00960-z.
2
Toward the use of nanopore RNA sequencing technologies in the clinic: challenges and opportunities.迈向纳米孔RNA测序技术在临床中的应用:挑战与机遇
Nucleic Acids Res. 2025 Feb 27;53(5). doi: 10.1093/nar/gkaf128.
3
De novo basecalling of RNA modifications at single molecule and nucleotide resolution.在单分子和核苷酸分辨率下对RNA修饰进行从头碱基识别。

本文引用的文献

1
Detecting DNA cytosine methylation using nanopore sequencing.利用纳米孔测序检测 DNA 胞嘧啶甲基化。
Nat Methods. 2017 Apr;14(4):407-410. doi: 10.1038/nmeth.4184. Epub 2017 Feb 20.
2
The reverse transcription signature of N-1-methyladenosine in RNA-Seq is sequence dependent.RNA测序中N-1-甲基腺苷的逆转录特征取决于序列。
Nucleic Acids Res. 2015 Nov 16;43(20):9950-64. doi: 10.1093/nar/gkv895. Epub 2015 Sep 13.
3
The birth of the Epitranscriptome: deciphering the function of RNA modifications.表观转录组的诞生:解读RNA修饰的功能。
Genome Biol. 2025 Feb 25;26(1):38. doi: 10.1186/s13059-025-03498-6.
4
Native RNA nanopore sequencing reveals antibiotic-induced loss of rRNA modifications in the A- and P-sites.天然 RNA 纳米孔测序揭示抗生素诱导 A 位和 P 位 rRNA 修饰的丢失。
Nat Commun. 2024 Nov 29;15(1):10054. doi: 10.1038/s41467-024-54368-x.
5
Non-genetic differences underlie variability in proliferation among esophageal epithelial clones.非遗传差异是食管上皮克隆增殖变异性的基础。
PLoS Comput Biol. 2024 Oct 28;20(10):e1012360. doi: 10.1371/journal.pcbi.1012360. eCollection 2024 Oct.
6
Enhanced detection of RNA modifications and read mapping with high-accuracy nanopore RNA basecalling models.利用高精度纳米孔 RNA 碱基calling 模型增强 RNA 修饰的检测和读段比对。
Genome Res. 2024 Nov 20;34(11):1865-1877. doi: 10.1101/gr.278849.123.
7
Mettl3-catalyzed mA regulates histone modifier and modification expression in self-renewing somatic tissue.Mettl3 催化的 mA 调节自我更新体组织中的组蛋白修饰剂和修饰表达。
Sci Adv. 2023 Sep;9(35):eadg5234. doi: 10.1126/sciadv.adg5234. Epub 2023 Sep 1.
8
Exploring the epitranscriptome by native RNA sequencing.通过天然 RNA 测序探索表观转录组。
RNA. 2022 Nov;28(11):1430-1439. doi: 10.1261/rna.079404.122. Epub 2022 Sep 14.
9
Loop-Mediated Isothermal Amplification Detection of SARS-CoV-2 and Myriad Other Applications.环介导等温扩增检测 SARS-CoV-2 及其他多种应用。
J Biomol Tech. 2021 Sep;32(3):228-275. doi: 10.7171/jbt.21-3203-017.
10
Genome-Wide Scanning of Potential Hotspots for Adenosine Methylation: A Potential Path to Neuronal Development.腺苷甲基化潜在热点的全基因组扫描:通往神经元发育的潜在途径。
Life (Basel). 2021 Nov 5;11(11):1185. doi: 10.3390/life11111185.
Genome Biol. 2012 Oct 31;13(10):175. doi: 10.1186/gb-2012-13-10-175.
4
Comprehensive analysis of mRNA methylation reveals enrichment in 3' UTRs and near stop codons.对 mRNA 甲基化的综合分析表明,它在 3' UTR 区和临近终止密码子处富集。
Cell. 2012 Jun 22;149(7):1635-46. doi: 10.1016/j.cell.2012.05.003. Epub 2012 May 17.
5
Topology of the human and mouse m6A RNA methylomes revealed by m6A-seq.m6A-seq 揭示的人类和小鼠 m6A RNA 甲基组学图谱。
Nature. 2012 Apr 29;485(7397):201-6. doi: 10.1038/nature11112.
6
N6-methyladenosine in nuclear RNA is a major substrate of the obesity-associated FTO.核 RNA 中的 N6-甲基腺苷是肥胖相关 FTO 的主要底物。
Nat Chem Biol. 2011 Oct 16;7(12):885-7. doi: 10.1038/nchembio.687.
7
Selection of human antibody fragments by phage display.通过噬菌体展示技术筛选人源抗体片段
Nat Protoc. 2007;2(11):3001-8. doi: 10.1038/nprot.2007.448.