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相似文献

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Energetic redistribution in allostery to execute protein function.变构作用中的能量重新分布以执行蛋白质功能。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 18;114(29):7480-7482. doi: 10.1073/pnas.1709071114. Epub 2017 Jul 10.
2
Ensemble allosteric model: energetic frustration within the intrinsically disordered glucocorticoid receptor.整体变构模型：固有无序的糖皮质激素受体中的能量约束。
Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2018 Jun 19;373(1749). doi: 10.1098/rstb.2017.0175.
3
Structural and energetic basis of allostery.变构作用的结构和能量基础。
Annu Rev Biophys. 2012;41:585-609. doi: 10.1146/annurev-biophys-050511-102319.
4
Is allostery an intrinsic property of all dynamic proteins?变构是所有动态蛋白质的固有特性吗？
Proteins. 2004 Nov 15;57(3):433-43. doi: 10.1002/prot.20232.
5
Structurally distributed surface sites tune allosteric regulation.结构分布的表面位点调节变构调节。
Elife. 2021 Jun 16;10:e68346. doi: 10.7554/eLife.68346.
6
Hidden electrostatic basis of dynamic allostery in a PDZ domain.PDZ 域中动态变构的隐藏静电基础。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 18;114(29):E5825-E5834. doi: 10.1073/pnas.1705311114. Epub 2017 Jun 20.
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Harnessing allostery: a novel approach to drug discovery.利用变构效应：一种新的药物发现方法。
Med Res Rev. 2014 Nov;34(6):1242-85. doi: 10.1002/med.21317. Epub 2014 May 14.
8
Tuning the "violin" of protein kinases: The role of dynamics-based allostery.调整蛋白激酶的“琴弦”：基于动力学的变构作用的角色。
IUBMB Life. 2019 Jun;71(6):685-696. doi: 10.1002/iub.2057. Epub 2019 May 7.
9
Quantitative Analysis of Dynamic Allostery.动态变构的定量分析。
J Chem Inf Model. 2022 May 23;62(10):2538-2549. doi: 10.1021/acs.jcim.2c00138. Epub 2022 May 5.
10
Allostery Frustrates the Experimentalist.变构抑制实验家。
J Mol Biol. 2023 Feb 28;435(4):167934. doi: 10.1016/j.jmb.2022.167934. Epub 2022 Dec 28.

引用本文的文献

1
Network Theory Analysis of Allosteric Drug-Rescue Mechanisms in the Tumor Suppressor Protein p53 Y220C Mutant.肿瘤抑制蛋白p53 Y220C突变体变构药物拯救机制的网络理论分析
Int J Mol Sci. 2025 Jul 17;26(14):6884. doi: 10.3390/ijms26146884.
2
Toward the Design of Allosteric Effectors: Gaining Comprehensive Control of Drug Properties and Actions.朝着变构效应剂的设计：全面控制药物性质和作用。
J Med Chem. 2024 Oct 10;67(19):17191-17206. doi: 10.1021/acs.jmedchem.4c01043. Epub 2024 Sep 26.
3
Molecular mechanism of regulation of RhoA GTPase by phosphorylation of RhoGDI.RhoGDI 磷酸化调控 RhoA GTP 酶的分子机制。
Biophys J. 2024 Jan 2;123(1):57-67. doi: 10.1016/j.bpj.2023.11.018. Epub 2023 Nov 21.
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Network Analysis of Molecular Dynamics Sectors in the p53 Protein.p53蛋白分子动力学区域的网络分析
ACS Omega. 2022 Dec 20;8(1):571-587. doi: 10.1021/acsomega.2c05635. eCollection 2023 Jan 10.
5
Allosteric Signaling in PDZ Energetic Networks: Embedding Error Analysis.PDZ 能量网络中的变构信号：嵌入错误分析。
J Phys Chem B. 2023 Jan 26;127(3):623-633. doi: 10.1021/acs.jpcb.2c06546. Epub 2023 Jan 10.
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Design of novel cyanovirin-N variants by modulation of binding dynamics through distal mutations.通过改变远端突变来调节结合动力学设计新型氰基病毒 N 变体。
Elife. 2022 Dec 6;11:e67474. doi: 10.7554/eLife.67474.
7
Discovery of cryptic allosteric sites using reversed allosteric communication by a combined computational and experimental strategy.通过计算与实验相结合的策略利用反向变构通讯发现隐秘变构位点
Chem Sci. 2020 Nov 2;12(1):464-476. doi: 10.1039/d0sc05131d.
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Dynamic energy correlation analysis of aspartokinase III and alteration of allosteric regulation by manipulating energy transduction pathways.天冬氨酸激酶III的动态能量相关分析以及通过操纵能量转导途径改变变构调节
Eng Life Sci. 2021 Mar 2;21(5):314-323. doi: 10.1002/elsc.202000065. eCollection 2021 May.
9
Substrates Modulate Charge-Reorganization Allosteric Effects in Protein-Protein Association.底物调节蛋白-蛋白相互作用中的电荷重组变构效应。
J Phys Chem Lett. 2021 Mar 25;12(11):2805-2808. doi: 10.1021/acs.jpclett.1c00437. Epub 2021 Mar 12.
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Machine Learning of Allosteric Effects: The Analysis of Ligand-Induced Dynamics to Predict Functional Effects in TRAP1.变构效应的机器学习：分析配体诱导的动力学以预测TRAP1中的功能效应
J Phys Chem B. 2021 Jan 14;125(1):101-114. doi: 10.1021/acs.jpcb.0c09742. Epub 2020 Dec 28.

本文引用的文献

1
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Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 18;114(29):E5825-E5834. doi: 10.1073/pnas.1705311114. Epub 2017 Jun 20.
2
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3
Native State Volume Fluctuations in Proteins as a Mechanism for Dynamic Allostery.蛋白质天然状态体积变化作为动态变构的一种机制。
J Am Chem Soc. 2017 Mar 15;139(10):3599-3602. doi: 10.1021/jacs.6b12058. Epub 2017 Jan 20.
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Dielectric Allostery of Protein: Response of Myosin to ATP Binding.蛋白质的介电变构：肌球蛋白对ATP结合的响应
J Phys Chem B. 2016 Dec 29;120(51):13047-13055. doi: 10.1021/acs.jpcb.6b10003. Epub 2016 Nov 22.
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Piezoelectric allostery of protein.蛋白质的压电变构。
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Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Jan 27;112(4):1131-6. doi: 10.1073/pnas.1424012112. Epub 2015 Jan 12.

Energetic redistribution in allostery to execute protein function.

作者信息

Liu Jin, Nussinov Ruth

机构信息

Department of Pharmaceutical Sciences, University of North Texas Systems College of Pharmacy, University of North Texas Health Science Center, Fort Worth, TX 76107;

Cancer and Inflammation Program, Leidos Biomedical Research, Inc., Frederick National Laboratory for Cancer Research, National Cancer Institute, Frederick, MD 21702;

出版信息

Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 18;114(29):7480-7482. doi: 10.1073/pnas.1709071114. Epub 2017 Jul 10.

DOI:10.1073/pnas.1709071114
PMID:28696318
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5530713/
Abstract
摘要