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从人类尿液中分离出的HUMV-6483的全基因组序列。

Whole-Genome Sequence of HUMV-6483 Isolated from Human Urine.

作者信息

Chapartegui-González Itziar, Lázaro-Díez María, Redondo-Salvo Santiago, Alted-Pérez Laura, Ocejo-Vinyals Javier Gonzalo, Navas Jesús, Ramos-Vivas José

机构信息

Instituto de Investigación Valdecilla IDIVAL, Santander, Spain.

Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Marqués de Valdecilla, Santander, Spain.

出版信息

Genome Announc. 2017 Jul 20;5(29):e00658-17. doi: 10.1128/genomeA.00658-17.

DOI:10.1128/genomeA.00658-17
PMID:28729271
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5522938/
Abstract

strain HUMV-6483 was obtained from urine from an adult patient. We report here its complete genome assembly using PacBio single-molecule real-time sequencing, which resulted in a chromosome with 4.07 Mb and a circular contig of 112 kb. About 3,953 protein-coding genes are predicted from this assembly.

摘要

菌株HUMV-6483取自一名成年患者的尿液。我们在此报告使用PacBio单分子实时测序对其进行的全基因组组装，结果得到一条4.07 Mb的染色体和一个112 kb的环状重叠群。从该组装中预测出约3953个蛋白质编码基因。

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