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“袖珍RNA测序”:一种捕获从感兴趣基因组区域产生的新成熟微小RNA的方法。

"Pocket-sized RNA-Seq": A Method to Capture New Mature microRNA Produced from a Genomic Region of Interest.

作者信息

Hubé Florent, Francastel Claire

机构信息

University Paris Diderot, Sorbonne Paris Cité, 75205 Paris, France.

Epigénétique et Destin Cellulaire, CNRS UMR 7216, 75013 Paris, France.

出版信息

Noncoding RNA. 2015 Jul 3;1(2):127-138. doi: 10.3390/ncrna1020127.

DOI:10.3390/ncrna1020127
PMID:29861419
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5932543/
Abstract

Currently, the discovery of new small ncRNAs requires high throughput methods even in the case of focused research on the regulation of specific genes or set of genes. We propose herein a simple, rapid, efficient, and cost effective method to clone and sequence single, yet unknown, small ncRNA. This technique that we called "Pocket-sized RNA-Seq" or psRNA-seq is based on transcription, RNA pull down and adapted RACE-PCR methods that allow its implementation using either available commercial kits or in-house reagents.

摘要

目前,即使是在专注于特定基因或基因集调控的研究中,新的小非编码RNA的发现也需要高通量方法。在此,我们提出一种简单、快速、高效且经济高效的方法来克隆和测序单个未知的小非编码RNA。我们将这种技术称为“袖珍RNA测序”(psRNA-seq),它基于转录、RNA下拉和改良的RACE-PCR方法,使用现有的商业试剂盒或自制试剂即可实施。

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