• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

生物大分子晶体的全自动表征与数据收集

Fully Autonomous Characterization and Data Collection from Crystals of Biological Macromolecules.

作者信息

Hutin Stephanie, Van Laer Bart, Mueller-Dieckmann Christoph, Leonard Gordon, Nurizzo Didier, Bowler Matthew W

机构信息

Structural Biology Group, European Synchrotron Radiation Facility.

Grenoble Outstation, European Molecular Biology Laboratory;

出版信息

J Vis Exp. 2019 Mar 22(145). doi: 10.3791/59032.

DOI:10.3791/59032
PMID:30958484
Abstract

High-brilliance X-ray beams coupled with automation have led to the use of synchrotron-based macromolecular X-ray crystallography (MX) beamlines for even the most challenging projects in structural biology. However, most facilities still require the presence of a scientist on site to perform the experiments. A new generation of automated beamlines dedicated to the fully automatic characterization of, and data collection from, crystals of biological macromolecules has recently been developed. These beamlines represent a new tool for structural biologists to screen the results of initial crystallization trials and/or the collection of large numbers of diffraction data sets, without users having to control the beamline themselves. Here we show how to set up an experiment for automatic screening and data collection, how an experiment is performed at the beamline, how the resulting data sets are processed, and how, when possible, the crystal structure of the biological macromolecule is solved.

摘要

高亮度X射线束与自动化技术相结合,使得基于同步加速器的大分子X射线晶体学(MX)光束线甚至可用于结构生物学中最具挑战性的项目。然而,大多数设施仍需要科学家在现场进行实验。最近开发了新一代自动化光束线,专门用于对生物大分子晶体进行全自动表征和数据收集。这些光束线为结构生物学家提供了一种新工具,用于筛选初始结晶试验的结果和/或收集大量衍射数据集,而无需用户亲自控制光束线。在此,我们展示了如何设置自动筛选和数据收集实验、如何在光束线上进行实验、如何处理所得数据集,以及在可能的情况下如何解析生物大分子的晶体结构。

相似文献

1
Fully Autonomous Characterization and Data Collection from Crystals of Biological Macromolecules.生物大分子晶体的全自动表征与数据收集
J Vis Exp. 2019 Mar 22(145). doi: 10.3791/59032.
2
MASSIF-1: a beamline dedicated to the fully automatic characterization and data collection from crystals of biological macromolecules.MASSIF-1:一条专门用于对生物大分子晶体进行全自动表征和数据收集的光束线。
J Synchrotron Radiat. 2015 Nov;22(6):1540-7. doi: 10.1107/S1600577515016604. Epub 2015 Oct 3.
3
Application of in situ diffraction in high-throughput structure determination platforms.原位衍射在高通量结构测定平台中的应用。
Methods Mol Biol. 2015;1261:233-53. doi: 10.1007/978-1-4939-2230-7_13.
4
MxCuBE: a synchrotron beamline control environment customized for macromolecular crystallography experiments.MxCuBE:一种为大分子晶体学实验定制的同步加速器光束线控制环境。
J Synchrotron Radiat. 2010 Sep;17(5):700-7. doi: 10.1107/S0909049510020005. Epub 2010 Jul 13.
5
FMX - the Frontier Microfocusing Macromolecular Crystallography Beamline at the National Synchrotron Light Source II.FMX - 国家同步辐射光源 II 上的前沿微聚焦大分子晶体学光束线。
J Synchrotron Radiat. 2021 Mar 1;28(Pt 2):650-665. doi: 10.1107/S1600577520016173. Epub 2021 Feb 25.
6
Instrumentation for synchrotron-radiation macromolecular crystallography.用于同步辐射大分子晶体学的仪器设备。
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2006 Jan;62(Pt 1):12-8. doi: 10.1107/S0907444905039570. Epub 2005 Dec 14.
7
How the ESRF helps industry and how they help the ESRF.欧洲同步辐射装置如何助力产业发展以及产业如何助力欧洲同步辐射装置。
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2013 Jul;69(Pt 7):1289-96. doi: 10.1107/S0907444913001108. Epub 2013 Jun 18.
8
An integrated pipeline for sample preparation and characterization at the EMBL@PETRA3 synchrotron facilities.欧洲分子生物学实验室@佩特拉3同步加速器设施中用于样品制备和表征的集成流程。
Methods. 2016 Feb 15;95:70-7. doi: 10.1016/j.ymeth.2015.08.003. Epub 2015 Aug 7.
9
Development of SPACE-II for rapid sample exchange at SPring-8 macromolecular crystallography beamlines.为在 SPring-8 高分子晶体学光束线实现快速样品交换而开发的 SPACE-II。
Acta Crystallogr D Struct Biol. 2020 Feb 1;76(Pt 2):155-165. doi: 10.1107/S2059798320000030. Epub 2020 Jan 31.
10
Dynamic Structural Biology Experiments at XFEL or Synchrotron Sources.XFEL 或同步辐射源的动态结构生物学实验。
Methods Mol Biol. 2021;2305:203-228. doi: 10.1007/978-1-0716-1406-8_11.

引用本文的文献

1
Unravelling the Adaptation Mechanisms to High Pressure in Proteins.解析蛋白质适应高压的机制。
Int J Mol Sci. 2022 Jul 30;23(15):8469. doi: 10.3390/ijms23158469.
2
Protein X-ray Crystallography and Drug Discovery.蛋白质 X 射线晶体学与药物发现。
Molecules. 2020 Feb 25;25(5):1030. doi: 10.3390/molecules25051030.