• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

从铁缺乏变体中洞察一氧化氮还原酶的机制。

Insights into the mechanism of nitric oxide reductase from a Fe -depleted variant.

机构信息

Department of Biochemistry and Biophysics, Stockholm University, Sweden.

Department of Organic Chemistry, Stockholm University, Sweden.

出版信息

FEBS Lett. 2019 Jun;593(12):1351-1359. doi: 10.1002/1873-3468.13436. Epub 2019 May 29.

DOI:10.1002/1873-3468.13436
PMID:31077353
Abstract

A key step of denitrification, the reduction of toxic nitric oxide to nitrous oxide, is catalysed by cytochrome c-dependent NO reductase (cNOR). cNOR contains four redox-active cofactors: three hemes and a nonheme iron (Fe ). Heme b and Fe constitute the active site, but the specific mechanism of NO-binding events and reduction is under debate. Here, we used a recently constructed, fully folded and hemylated cNOR variant that lacks Fe to investigate the role of Fe during catalysis. We show that in the Fe -less cNOR, binding of both NO and O to heme b still occurs but further reduction is impaired, although to a lesser degree for O than for NO. Implications for the catalytic mechanisms of cNOR are discussed.

摘要

反硝化作用的一个关键步骤是将有毒的一氧化氮还原为一氧化二氮,该过程由细胞色素 c 依赖型一氧化氮还原酶(cNOR)催化。cNOR 包含四个氧化还原活性辅因子:三个血红素和一个非血红素铁(Fe )。血红素 b 和 Fe 构成活性位点,但 NO 结合事件和还原的具体机制仍存在争议。在这里,我们使用最近构建的、完全折叠和血红素化的 cNOR 变体,该变体缺乏 Fe ,来研究 Fe 在催化过程中的作用。我们表明,在无 Fe 的 cNOR 中,血红素 b 仍然能够结合 NO 和 O,但进一步的还原受到了阻碍,尽管 O 的阻碍程度比 NO 小。这对 cNOR 的催化机制具有启示意义。

相似文献

1
Insights into the mechanism of nitric oxide reductase from a Fe -depleted variant.从铁缺乏变体中洞察一氧化氮还原酶的机制。
FEBS Lett. 2019 Jun;593(12):1351-1359. doi: 10.1002/1873-3468.13436. Epub 2019 May 29.
2
The mechanism for oxygen reduction in cytochrome c dependent nitric oxide reductase (cNOR) as obtained from a combination of theoretical and experimental results.根据理论和实验结果的综合分析,得到细胞色素 c 依赖的一氧化氮还原酶 (cNOR) 中氧还原的机制。
Biochim Biophys Acta Bioenerg. 2017 Nov;1858(11):884-894. doi: 10.1016/j.bbabio.2017.08.005. Epub 2017 Aug 8.
3
Bacterial denitrifying nitric oxide reductases and aerobic respiratory terminal oxidases use similar delivery pathways for their molecular substrates.细菌反硝化一氧化氮还原酶和需氧呼吸末端氧化酶使用相似的输送途径来传递其分子底物。
Biochim Biophys Acta Bioenerg. 2018 Sep;1859(9):712-724. doi: 10.1016/j.bbabio.2018.06.002. Epub 2018 Jun 5.
4
Bacterial nitric oxide reductase: a mechanism revisited by an ONIOM (DFT:MM) study.细菌一氧化氮还原酶:通过ONIOM(DFT:MM)研究重新审视的一种机制。
J Mol Model. 2015 May;21(5):130. doi: 10.1007/s00894-015-2679-0. Epub 2015 Apr 29.
5
Activation of O and NO in heme-copper oxidases - mechanistic insights from computational modelling.血红素铜氧化酶中 O 和 NO 的激活 - 计算建模的机理见解。
Chem Soc Rev. 2020 Oct 19;49(20):7301-7330. doi: 10.1039/d0cs00877j.
6
Characterization of quinol-dependent nitric oxide reductase from Geobacillus stearothermophilus: enzymatic activity and active site structure.嗜热栖热放线菌喹啉依赖性一氧化氮还原酶的特性:酶活性与活性位点结构
Biochim Biophys Acta. 2014 Jul;1837(7):1019-26. doi: 10.1016/j.bbabio.2014.02.017. Epub 2014 Feb 22.
7
Electroanalytical characterization of the direct Marinobacter hydrocarbonoclasticus nitric oxide reductase-catalysed nitric oxide and dioxygen reduction.直接 Marinobacter hydrocarbonoclasticus 一氧化氮还原酶催化的一氧化氮和氧气还原的电化学表征。
Bioelectrochemistry. 2019 Feb;125:8-14. doi: 10.1016/j.bioelechem.2018.08.005. Epub 2018 Aug 21.
8
Mechanisms for enzymatic reduction of nitric oxide to nitrous oxide - A comparison between nitric oxide reductase and cytochrome c oxidase.酶促将一氧化氮还原为笑气的机制——一氧化氮还原酶和细胞色素 c 氧化酶的比较。
Biochim Biophys Acta Bioenerg. 2018 Nov;1859(11):1223-1234. doi: 10.1016/j.bbabio.2018.09.368. Epub 2018 Sep 21.
9
Why is the reduction of NO in cytochrome c dependent nitric oxide reductase (cNOR) not electrogenic?为什么细胞色素c依赖性一氧化氮还原酶(cNOR)中NO的还原不是电致的?
Biochim Biophys Acta. 2013 Jul;1827(7):826-33. doi: 10.1016/j.bbabio.2013.04.005. Epub 2013 Apr 23.
10
Pseudomonas aeruginosa overexpression system of nitric oxide reductase for in vivo and in vitro mutational analyses.用于体内和体外突变分析的铜绿假单胞菌一氧化氮还原酶过表达系统。
Biochim Biophys Acta Bioenerg. 2018 May;1859(5):333-341. doi: 10.1016/j.bbabio.2018.02.009. Epub 2018 Feb 27.

引用本文的文献

1
Insights into the structure-function relationship of the NorQ/NorD chaperones from Paracoccus denitrificans reveal shared principles of interacting MoxR AAA+/VWA domain proteins.解析脱氮副球菌 NorQ/NorD 伴侣蛋白结构-功能关系的研究揭示了相互作用的 MoxR AAA+/VWA 结构域蛋白的共有原理。
BMC Biol. 2023 Feb 28;21(1):47. doi: 10.1186/s12915-023-01546-w.
2
Molecular understanding of heteronuclear active sites in heme-copper oxidases, nitric oxide reductases, and sulfite reductases through biomimetic modelling.通过仿生模拟研究细胞色素 c 氧化酶、一氧化氮还原酶和亚硫酸盐还原酶中异核活性部位的分子机制。
Chem Soc Rev. 2021 Mar 1;50(4):2486-2539. doi: 10.1039/d0cs01297a.