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SpCas9-NG 可自我靶向植物基因组编辑中的 sgRNA 序列。

SpCas9-NG self-targets the sgRNA sequence in plant genome editing.

机构信息

Key Laboratory of Rice Genetics & Breeding, Institute of Rice Research, Anhui Academy of Agricultural Science, Hefei, China.

出版信息

Nat Plants. 2020 Mar;6(3):197-201. doi: 10.1038/s41477-020-0603-9. Epub 2020 Feb 24.

DOI:10.1038/s41477-020-0603-9
PMID:32094641
Abstract

Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9)-NG recognizes NGN protospacer adjacent motifs and expands the scope of genome-editing tools. In this study, we found that SpCas9-NG not only targeted the genome but also efficiently self-targeted the single-guide RNA sequence in transfer DNA in transgenic plants, potentially increasing off-target risk by generating new single-guide RNAs. We further showed that the self-target effect of SpCas9-NG could be greatly alleviated by using a modified single-guide RNA scaffold starting with a GCCCC sequence.

摘要

化脓链球菌 Cas9(SpCas9)-NG 识别 NGN 间隔基序邻近基序,并扩展了基因组编辑工具的范围。在这项研究中,我们发现 SpCas9-NG 不仅靶向基因组,而且还能有效地在转基因植物中的转移 DNA 中自我靶向单指导 RNA 序列,通过产生新的单指导 RNA 潜在地增加脱靶风险。我们进一步表明,通过使用从 GCCCC 序列开始的修饰单指导 RNA 支架,可以大大减轻 SpCas9-NG 的自我靶向效应。

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