• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

机构级 ELN/LIMS 部署:高度可定制的 ELN/LIMS 平台,是生命科学研究所数字化转型的基石。

Institutional ELN/LIMS deployment: Highly customizable ELN/LIMS platform as a cornerstone of digital transformation for life sciences research institutes.

机构信息

EPFL, Lausanne, Switzerland.

出版信息

EMBO Rep. 2020 Mar 4;21(3):e49862. doi: 10.15252/embr.201949862. Epub 2020 Feb 27.

DOI:10.15252/embr.201949862
PMID:32129000
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7054672/
Abstract

The systematic recording and management of experimental data in academic life science research remains an open problem. EPFL engaged in a program of ELN/LIMS deployment 6 years ago, encountering a host of fundamental questions at the institutional level and in each single laboratory. Here, based on our experience we aim to share with research institute managers, PIs, and any scientists involved in an ELN/LIMS deployment, helpful tips and tools to surround yourself with the right people and the right software at the right time. In this article we describe the resources used, the challenges, key success factors, and the results obtained at each phase of our project. Finally, we discuss the current and next challenges and how our experience leads us to support the creation of a new position in the research groups: the laboratory data manager.

摘要

在学术生命科学研究中,系统地记录和管理实验数据仍然是一个未解决的问题。EPFL 六年前开始了 ELN/LIMS 的部署计划,在机构层面和每个单独的实验室都遇到了一系列基本问题。在这里,我们根据经验,旨在与研究所管理人员、PI 以及任何参与 ELN/LIMS 部署的科学家分享有用的提示和工具,以便在适当的时间与合适的人员和合适的软件一起工作。在本文中,我们描述了在项目的每个阶段使用的资源、遇到的挑战、关键成功因素和获得的结果。最后,我们讨论了当前和未来的挑战,以及我们的经验如何促使我们支持在研究小组中创建一个新职位:实验室数据经理。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/d920fdcae56e/EMBR-21-e49862-g008.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/189005721448/EMBR-21-e49862-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/933885416c70/EMBR-21-e49862-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/9c1e5084cc2d/EMBR-21-e49862-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/8a277a440f64/EMBR-21-e49862-g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/452e9bb32e7d/EMBR-21-e49862-g005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/a5163eff41f3/EMBR-21-e49862-g006.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/589412332560/EMBR-21-e49862-g007.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/d920fdcae56e/EMBR-21-e49862-g008.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/189005721448/EMBR-21-e49862-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/933885416c70/EMBR-21-e49862-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/9c1e5084cc2d/EMBR-21-e49862-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/8a277a440f64/EMBR-21-e49862-g004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/452e9bb32e7d/EMBR-21-e49862-g005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/a5163eff41f3/EMBR-21-e49862-g006.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/589412332560/EMBR-21-e49862-g007.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8f4/7054672/d920fdcae56e/EMBR-21-e49862-g008.jpg

相似文献

1
Institutional ELN/LIMS deployment: Highly customizable ELN/LIMS platform as a cornerstone of digital transformation for life sciences research institutes.机构级 ELN/LIMS 部署:高度可定制的 ELN/LIMS 平台,是生命科学研究所数字化转型的基石。
EMBO Rep. 2020 Mar 4;21(3):e49862. doi: 10.15252/embr.201949862. Epub 2020 Feb 27.
2
openBIS ELN-LIMS: an open-source database for academic laboratories.openBIS电子实验室笔记本-实验室信息管理系统:一款面向学术实验室的开源数据库。
Bioinformatics. 2016 Feb 15;32(4):638-40. doi: 10.1093/bioinformatics/btv606. Epub 2015 Oct 27.
3
Open-source LIMS in Vietnam: The path toward sustainability and host country ownership.越南的开源实验室信息管理系统:迈向可持续发展及东道国自主掌控的道路。
Int J Med Inform. 2016 Sep;93:92-102. doi: 10.1016/j.ijmedinf.2016.06.010. Epub 2016 Jun 23.
4
eLabFTW as an Open Science tool to improve the quality and translation of preclinical research.eLabFTW 作为一种开放科学工具,可提高临床前研究的质量和转化。
F1000Res. 2021 Apr 16;10:292. doi: 10.12688/f1000research.52157.3. eCollection 2021.
5
Analysis and Implementation of an Electronic Laboratory Notebook in a Biomedical Research Institute.生物医学研究所中电子实验室笔记本的分析与实现
PLoS One. 2016 Aug 1;11(8):e0160428. doi: 10.1371/journal.pone.0160428. eCollection 2016.
6
Twenty five years of the National Academy of Medical Sciences of Ukraine - progress and priorities for future of radiation medicine and biology.乌克兰国家医学科学院的二十五年——放射医学与生物学的进展及未来优先事项
Probl Radiac Med Radiobiol. 2017 Dec;22:10-14.
7
SHOT UK Collaborative Reviewing and Reforming IT Processes in Transfusion (SCRIPT) survey: Laboratory information management systems: Are we ready for digital transformation?SHOT UK 协作审查和改革输血中的 IT 流程 (SCRIPT) 调查:实验室信息管理系统:我们是否准备好迎接数字化转型?
Transfus Med. 2023 Dec;33(6):433-439. doi: 10.1111/tme.13010. Epub 2023 Sep 30.
8
SIGLa: an adaptable LIMS for multiple laboratories.SIGLa:一个适用于多个实验室的可扩展的实验室信息管理系统。
BMC Genomics. 2010 Dec 22;11 Suppl 5(Suppl 5):S8. doi: 10.1186/1471-2164-11-S5-S8.
9
HEnRY: a DZIF LIMS tool for the collection and documentation of biomaterials in multicentre studies.HENRY:一个用于多中心研究中生物材料收集和记录的 DZIF LIMS 工具。
BMC Bioinformatics. 2020 Jul 8;21(1):290. doi: 10.1186/s12859-020-03596-1.
10
Baobab Laboratory Information Management System: Development of an Open-Source Laboratory Information Management System for Biobanking.猴面包树实验室信息管理系统:用于生物样本库的开源实验室信息管理系统的开发。
Biopreserv Biobank. 2017 Apr;15(2):116-120. doi: 10.1089/bio.2017.0014. Epub 2017 Apr 4.

引用本文的文献

1
Gain efficiency with streamlined and automated data processing: Examples from high-throughput monoclonal antibody production.通过简化和自动化数据处理提高效率:来自高通量单克隆抗体制备的示例。
PLoS One. 2025 Jul 1;20(7):e0326678. doi: 10.1371/journal.pone.0326678. eCollection 2025.
2
Implementing an institution-wide electronic lab notebook initiative.实施全机构范围的电子实验室笔记本计划。
J Med Libr Assoc. 2022 Apr 1;110(2):222-227. doi: 10.5195/jmla.2022.1407.

本文引用的文献

1
Quality management for academic laboratories: burden or boon? Professional quality management could be very beneficial for academic research but needs to overcome specific caveats.学术实验室的质量管理:负担还是福音?专业的质量管理可能对学术研究非常有益,但需要克服特定的注意事项。
EMBO Rep. 2018 Nov;19(11). doi: 10.15252/embr.201847143. Epub 2018 Oct 19.
2
How to pick an electronic laboratory notebook.如何挑选电子实验室笔记本。
Nature. 2018 Aug;560(7717):269-270. doi: 10.1038/d41586-018-05895-3.
3
Implementation and use of cloud-based electronic lab notebook in a bioprocess engineering teaching laboratory.
基于云的电子实验室笔记本在生物过程工程教学实验室中的实施与应用。
J Biol Eng. 2017 Nov 24;11:40. doi: 10.1186/s13036-017-0083-2. eCollection 2017.
4
Analysis and Implementation of an Electronic Laboratory Notebook in a Biomedical Research Institute.生物医学研究所中电子实验室笔记本的分析与实现
PLoS One. 2016 Aug 1;11(8):e0160428. doi: 10.1371/journal.pone.0160428. eCollection 2016.
5
A pocket guide to electronic laboratory notebooks in the academic life sciences.学术生命科学领域电子实验室笔记本实用指南。
F1000Res. 2016 Jan 4;5:2. doi: 10.12688/f1000research.7628.1. eCollection 2016.
6
The Economics of Reproducibility in Preclinical Research.临床前研究中的可重复性经济学
PLoS Biol. 2015 Jun 9;13(6):e1002165. doi: 10.1371/journal.pbio.1002165. eCollection 2015 Jun.
7
Quality assurance mechanisms for the unregulated research environment.无监管研究环境的质量保证机制。
Trends Biotechnol. 2013 Oct;31(10):552-4. doi: 10.1016/j.tibtech.2013.06.007.
8
Requirement analysis for an electronic laboratory notebook for sustainable data management in biomedical research.生物医学研究中用于可持续数据管理的电子实验室笔记本的需求分析
Stud Health Technol Inform. 2013;192:1108.
9
People and organizational issues in research systems implementation.研究系统实施中的人员与组织问题。
J Am Med Inform Assoc. 2008 May-Jun;15(3):283-9. doi: 10.1197/jamia.M2582. Epub 2008 Feb 28.