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阿根廷感染巴拉圭冬青(Ilex paraguariensis)的新型细胞弹状病毒的分子特征及其独特的基因组结构。

Molecular characterization of a novel cytorhabdovirus with a unique genomic organization infecting yerba mate (Ilex paraguariensis) in Argentina.

机构信息

Instituto de Patología Vegetal, Centro de Investigaciones Agropecuarias, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (IPAVE-CIAP-INTA), Camino 60 Cuadras Km 5,5, (X5020ICA), Córdoba, Argentina.

Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola, Buenos Aires, Argentina.

出版信息

Arch Virol. 2020 Jun;165(6):1475-1479. doi: 10.1007/s00705-020-04609-3. Epub 2020 Apr 3.

DOI:10.1007/s00705-020-04609-3
PMID:32246285
Abstract

The genome of a novel rhabdovirus was detected in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). The newly identified virus, tentatively named "yerba mate virus A" (YmVA), has a genome of 14,961 nucleotides. Notably, eight open reading frames were identified in the antigenomic orientation of the negative-sense, single-stranded viral RNA, including two novel accessory genes, in the order 3'-N-P-3-4-M-G-L-8-5'. Sequence comparisons of the encoded proteins as well as phylogenetic analysis suggest that YmVA is a new member of the genus Cytorhabdovirus, family Rhabdoviridae. YmVA's unique genomic organization and phylogenetic relationships indicate that this virus likely represents a distinct evolutionary lineage among the cytorhabdoviruses.

摘要

在巴拉圭冬青(Ilex paraguariensis St. Hil.)中检测到一种新型弹状病毒的基因组。新鉴定的病毒暂时命名为“冬青病毒 A”(YmVA),其基因组为 14961 个核苷酸。值得注意的是,在负义单链病毒 RNA 的抗原基因组方向上鉴定出了 8 个开放阅读框,包括两个新的辅助基因,其顺序为 3'-N-P-3-4-M-G-L-8-5'。编码蛋白的序列比较以及系统发育分析表明,YmVA 是 Cytorhabdovirus 属、Rhabdoviridae 科的一个新成员。YmVA 独特的基因组组织和系统发育关系表明,该病毒可能代表 Cytorhabdoviruses 中的一个独特进化谱系。

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